LOC103033168 (si:ch211-121a2.4,LOC103033168,LOC108416079,LOC107581514,LOC108257924,LOC107687197,LOC107712847)


Basic Information

Item Value
gene id LOC103033168
gene name si:ch211-121a2.4,LOC103033168,LOC108416079,LOC107581514,LOC108257924,LOC107687197,LOC107712847
gene type coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035899.1
NCBI id CM008302.1
chromosome length 74127438
location 72604213 ~ 72610182 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>XM_007245320.3
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>XM_007245321.3
TGTGAACACCGTGACCCTGCCCGGGTGTCCGCTGAGGGCGCGCTGATCCGGGAGCCGCTCTGCTGGAGAGGAAGCTGGAGGGTTAAAGGGTTTGGTGTGTATTGTGGAGGACATTCAGGAAAGTTTTGCCACAGACTGCAGTGTGAACTGCTGTGTTGACGGACTGTACTCCGGGGCGCGGCTAGGTTACCCGCCGTGATCCAGGTTGTATCCGGGGTGACTGGTGGATTTGTTTGGATCTGTTGATTGTCCAACCTTTATCTACATTGCATAGCTCTTAGTTTTGAAGACTTGCACCTGCACACTGACCTTAGGAAGAAAAAACTTGGGTCAGAGGCCAGTTCTTCAAAGACTGAATGGTGTGCCCTCAACATGTCCACTGACAGAGAGCCATGTGTTACTGCTAAACTCTTCCACCTCATCTTCCTTTCCACCTTTTGGGGCATGCAGATATGGGTCACGTTTATCTCTGGCTTTGTGATGGACAACCATCTGAACAGGCACACATATGGCTTTATTCAGAGTCGACTGTTCCCCTTCTACCTGCACATCGGCTCAGCATGTGCCTTCTTCAACCTTACCATTTTCGCCATGTACCACCCCAGTGACCTTCTCACTGACAAAGAGGCATTTCAGATCTTCATTTTCTTTGTATGTGTGACTGTGGCAGCAGTGAATGCCCAGTGGTTTGGCCAGTTGACCTCTGAGATCATGGCAGATATGCACATGATTGAACAGGCCTGCGGACTGGGCCAGGACATTGGGCTGTCATCCAACCGAGAGGCCTACTCCAAACTGTGTGACACAGACCCCAAGTACAAACGACTGAGCAGCCGGCTGTGGCTCTACCACCTGCTGTCTTCCCTATGTAACCTGTGCTGTATTGTGTGTAATGGCTACAGCCTTTACTACCTAGCAGAAAACCTCACTACACTGTGAAGTCTAGAGGTCATGAACTCACAATGCAAACCAATCCAAGGCTGTCAAGGTATACAACCTGGACAAACATTTAAGTACAAGCATTCTTAGGTACTGTCTCTGTGGCCTGCCTTGTCTGATTTTTGGTACTATTTTGTTGTTAATATTTCATGTTCCTTTTTAATACTTTGCTGCtgacgagaaaaaaaaaaaaacagatttaaagaaTGGAATAATGTtgttaatggattttttttctaaggaATTTCTTAATAAAATTTACACAAAATGTAAAGCAGTGTGCACTTAGTGCAAATAATTGCAGGATCAACAATATTTAGATAACATGGAGATGAATGGGACTGTATATAAAAAGctaattacttaaataatagAAAAGTATCCTGTTAAAACTGTAACATCATACATAGTTTACAGGTAAAGCAAATAGAACAGATGTTAAGATctactaaaaaagaaaaaaaaaatgaaaaggtttttttttctttgtttgattTATCCGTATATAGATTTGTAGTCTACCTGAATCTCATATTCAATCAACTTTTAATAGGCTATATGACAGAAATCATTATATACTAAAAATATGTTGACAATATGTATTTGTAGCAGTTTCACAACAACtagttgtttaaaaaatagacccaatattgtaaaaaagttAAGAGAAGTCCTAAcaaaaattctatttttaagCTTCAGAATTGTTTACCTTATGTCCTCCTAAAATGGAATGAATcacaaataagaaaaatactGCTAAATGTCACAACCTTTTCAAAGAACCTCTCCTTGTATAAAATGTCTCTGTAACAGTTATGGTTTATTATAGAACCAGAATTTAGAAGTTATCTATGGCATCGCTCTACAAACCATTTgtaccacattttttttaaaagcacactcttaaatatacacacagcaGTTTTATATAGGGTTTTACcaacagcacaaaaaaacattcaacaggattaactACACTCTCTTTGGAATGCAACTTGCAGTAAATCAGTATGCTGTACCTAatagcagtatttttttttgttacctaTAAACATTTACTTATTGACCTGTTGATACAGGAGTATGAGTTGAGGCAATGAAGGAAAGCTATCACCTGGAGCTGGTGTCTTAGGACTGAGGACAGTACAAAATCTTACTGCCATAAAGTGTGAATGCCCATGTAAGTGCTTTTTCCTCACTGAGACTTATTTGTTCTGAGGCTTTTGCTGAGGTTCAGAGCCCCTTGTGCATTGCTACATTCAAAACAGGATTTTTTGGTTGTAGTAGATTGTTCTAGCTGTGTTCGAGCACCTAAATCGAGTTGTACTGGTCATGCAGGCCTGACCGGCTAACCTGCAGTAGCTGATTTATGCACACGCACATCAGCAATGCAGTAATACACAGTACATGTTAAGGTTATTATATAGTCTCATTACTGATACAGGACTGCTTAATTCGTGtggaccgtttttttttttcagctgtaaAACGTACATGCTCTGATCTACAGTCATAAGCTGAAGTATGAGATCattaattttatattgtttgaAATGTAACTTAGGCTGTAGAACACCTCACTCTACAGTATGTATGTGACAATCTGACAAATCACTTTCATTACAGTTGAAATATTatgcaatgtaaaaaatgtttttacataaTGGTGTACTTACACAATGAGGCTGTTGAGGCTTTGAATGCATCCCATTTAGGGTTCTTGTATATAAAGTCAATGCATATGAGCCGGCAGCTAATTTAAAACTTACTTTAGTACTTTCATATAGTGTTTGATGTCAATAGAAGTGAATGAACGAGTATGTGCTTATGCCCAGTCTTTAATCATATTTAAACACTATTGATGACCAGTATGAGTTCGGTGCAGCAGAATTAGGCATTATTGATGCTGTGGGTATATGATTTTTATGGTGTTAAGTTGGGTTTGTATTGTCTGGAAAGGTGAATATTAgtactatatataaaaatgtgagtTAACGAGTTTCCAAATTTACCATCTTCAATTCTGATAATAAAGGTTGCACccatcacaatttttttttcaaataacacTAGGGGATGTTGAGCTTACATGTGTTCATTGTACTGGTTAGTTATTTATTCTAATAATGATTGTGCCTgtataactttttaataataaaacacattaaaataagaaGGCTGGTACTAAA
>XM_022666125.1
CCTGCCCGGGTGTCCGCTGAGGGCGCGCTGATCCGGGAGCCGCTCTGCTGGAGAGGAAGCTGGAGGGTTAAAGGGTTTGGTTGTATCCGGGGTGACTGGTGGATTTGTTTGGATCTGTTGATTGTCCAACCTTTATCTACATTGCATAGCTCTTAGTTTTGAAGACTTGCACCTGCACACTGACCTTAGGAAGAAAAAACTTGGGTCAGAGGCCAGTTCTTCAAAGACTGAATGGTGTGCCCTCAACATGTCCACTGACAGAGAGCCATGTGTTACTGCTAAACTCTTCCACCTCATCTTCCTTTCCACCTTTTGGGGCATGCAGATATGGGTCACGTTTATCTCTGGCTTTGTGATGGACAACCATCTGAACAGGCACACATATGGCTTTATTCAGAGTCGACTGTTCCCCTTCTACCTGCACATCGGCTCAGCATGTGCCTTCTTCAACCTTACCATTTTCGCCATGTACCACCCCAGTGACCTTCTCACTGACAAAGAGGCATTTCAGATCTTCATTTTCTTTGTATGTGTGACTGTGGCAGCAGTGAATGCCCAGTGGTTTGGCCAGTTGACCTCTGAGATCATGGCAGATATGCACATGATTGAACAGGCCTGCGGACTGGGCCAGGACATTGGGCTGTCATCCAACCGAGAGGCCTACTCCAAACTGTGTGACACAGACCCCAAGTACAAACGACTGAGCAGCCGGCTGTGGCTCTACCACCTGCTGTCTTCCCTATGTAACCTGTGCTGTATTGTGTGTAATGGCTACAGCCTTTACTACCTAGCAGAAAACCTCACTACACTGTGAAGTCTAGAGGTCATGAACTCACAATGCAAACCAATCCAAGGCTGTCAAGGTATACAACCTGGACAAACATTTAAGTACAAGCATTCTTAGGTACTGTCTCTGTGGCCTGCCTTGTCTGATTTTTGGTACTATTTTGTTGTTAATATTTCATGTTCCTTTTTAATACTTTGCTGCtgacgagaaaaaaaaaaaaacagatttaaagaaTGGAATAATGTtgttaatggattttttttctaaggaATTTCTTAATAAAATTTACACAAAATGTAAAGCAGTGTGCACTTAGTGCAAATAATTGCAGGATCAACAATATTTAGATAACATGGAGATGAATGGGACTGTATATAAAAAGctaattacttaaataatagAAAAGTATCCTGTTAAAACTGTAACATCATACATAGTTTACAGGTAAAGCAAATAGAACAGATGTTAAGATctactaaaaaagaaaaaaaaaatgaaaaggtttttttttctttgtttgattTATCCGTATATAGATTTGTAGTCTACCTGAATCTCATATTCAATCAACTTTTAATAGGCTATATGACAGAAATCATTATATACTAAAAATATGTTGACAATATGTATTTGTAGCAGTTTCACAACAACtagttgtttaaaaaatagacccaatattgtaaaaaagttAAGAGAAGTCCTAAcaaaaattctatttttaagCTTCAGAATTGTTTACCTTATGTCCTCCTAAAATGGAATGAATcacaaataagaaaaatactGCTAAATGTCACAACCTTTTCAAAGAACCTCTCCTTGTATAAAATGTCTCTGTAACAGTTATGGTTTATTATAGAACCAGAATTTAGAAGTTATCTATGGCATCGCTCTACAAACCATTTgtaccacattttttttaaaagcacactcttaaatatacacacagcaGTTTTATATAGGGTTTTACcaacagcacaaaaaaacattcaacaggattaactACACTCTCTTTGGAATGCAACTTGCAGTAAATCAGTATGCTGTACCTAatagcagtatttttttttgttacctaTAAACATTTACTTATTGACCTGTTGATACAGGAGTATGAGTTGAGGCAATGAAGGAAAGCTATCACCTGGAGCTGGTGTCTTAGGACTGAGGACAGTACAAAATCTTACTGCCATAAAGTGTGAATGCCCATGTAAGTGCTTTTTCCTCACTGAGACTTATTTGTTCTGAGGCTTTTGCTGAGGTTCAGAGCCCCTTGTGCATTGCTACATTCAAAACAGGATTTTTTGGTTGTAGTAGATTGTTCTAGCTGTGTTCGAGCACCTAAATCGAGTTGTACTGGTCATGCAGGCCTGACCGGCTAACCTGCAGTAGCTGATTTATGCACACGCACATCAGCAATGCAGTAATACACAGTACATGTTAAGGTTATTATATAGTCTCATTACTGATACAGGACTGCTTAATTCGTGtggaccgtttttttttttcagctgtaaAACGTACATGCTCTGATCTACAGTCATAAGCTGAAGTATGAGATCattaattttatattgtttgaAATGTAACTTAGGCTGTAGAACACCTCACTCTACAGTATGTATGTGACAATCTGACAAATCACTTTCATTACAGTTGAAATATTatgcaatgtaaaaaatgtttttacataaTGGTGTACTTACACAATGAGGCTGTTGAGGCTTTGAATGCATCCCATTTAGGGTTCTTGTATATAAAGTCAATGCATATGAGCCGGCAGCTAATTTAAAACTTACTTTAGTACTTTCATATAGTGTTTGATGTCAATAGAAGTGAATGAACGAGTATGTGCTTATGCCCAGTCTTTAATCATATTTAAACACTATTGATGACCAGTATGAGTTCGGTGCAGCAGAATTAGGCATTATTGATGCTGTGGGTATATGATTTTTATGGTGTTAAGTTGGGTTTGTATTGTCTGGAAAGGTGAATATTAgtactatatataaaaatgtgagtTAACGAGTTTCCAAATTTACCATCTTCAATTCTGATAATAAAGGTTGCACccatcacaatttttttttcaaataacacTAGGGGATGTTGAGCTTACATGTGTTCATTGTACTGGTTAGTTATTTATTCTAATAATGATTGTGCCTgtataactttttaataataaaacacattaaaataagaaGGCTGGTACTAAA

Function

symbol description
si:ch211-121a2.4 Predicted to be located in membrane. Predicted to be integral component of membrane. Orthologous to human TMEM205 (transmembrane protein 205).

NR:

description
transmembrane protein 205-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_007245320.3 True 3240 mRNA 0.39 5 72604213 72610182
XM_007245321.3 False 3131 mRNA 0.38 5 72604219 72610182
XM_022666125.1 False 3006 mRNA 0.37 5 72604234 72610182

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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LOC107197929 NA coding upstream 606572 71988157 ~ 71997641 (+)
LOC111191308 LOC108415780 coding upstream 902919 71698448 ~ 71701294 (+)
sirt5 sirt5,LOC107687181,LOC107712885,LOC107581456 coding downstream 17058 72627240 ~ 72636248 (+)
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LOC103023468 vsnl1a,LOC103023468,LOC103379314,LOC107378186,LOC102798040,LOC104929407,LOC107553484 coding downstream 132836 72743018 ~ 72777057 (+)
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LOC111191374 NA non-coding downstream 266862 72877044 ~ 72877730 (+)
G32641 NA other upstream 7276 72595906 ~ 72596937 (+)
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sf3b6 SF3B6,sf3b6,pm14 other downstream 171611 72781793 ~ 72786363 (+)
cd2ap cd2ap other downstream 534468 73144650 ~ 73196220 (+)
LOC103030552 cnih3,LOC107601529,LOC107732540,LOC106607867,LOC107095392,LOC106527994,LOC108248696,LOC108440801,LOC106571455 other downstream 828874 73439056 ~ 73506987 (+)
selp NA other downstream 1378319 73988501 ~ 74016347 (+)

Expression


Co-expression Network