G58694



Basic Information


Item Value
gene id G58694
gene name NA
gene type misc
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id CI01000009
NCBI id null
chromosome length 16003125
location 14899398 ~ 14955795 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence


>TU66834
TCACCTGTCCCCAAACGCACTTTTACTTTTCCACCTGAAGTCGCCTGCAGAATCCCGACATCTGTCAGGTCTTAAAGATAACGGCATGTTTTGTGCATTGCTCTGCAGTTTGTTGCTCCTGCACGGCTCGGTCGGGGAGATCGTGTTCCGCTGCCCGAGCTGCACCGCGGAGCGCCAGGCGGCGTGTCCCAAGCTCACCACCTCTTGCGAGATTGTCAGGGAACCGGGTTGCGGTTGCTGTCCGGTTTGCGCACGGCAGAAGGGCGAGCAGTGCGGCGTCTACACGCCGAGATGCGGGAGCGGTTTGAGGTGTTACCCGAGTGCGAATTCAGAGTTACCACTGCAACAGCTGATACAGGGACTAGGACAATGCGACAACAAAGTGGACCTGGAGCCCACCTTACGGTAGCTCGAGTTTGGCCTAGTTTGAAAACAGTGCGAAACCAATCCCTGTGGTTTTCGGGCATATTGATTTGCCAGAGTGGTTCCGATGGGATGGAAGTGTTCATGTATGCGTGTGTGTGTGTTTGTGTGTACTTGTGTGAACGTTTCGATGCTGTGCCATGCCTGGAGCCAGTGTGACGGTGGGAAGGATTGCTTGCCATCTGGTGCAGTGTAAAACTGTCAGAGCCGGTCTCTGCATTTGGAGAGTCTCACACAAATGACAGGGGGAATTTCTTGAGCAAATCCAAAGCCATGTACCATGCCAGCATCTCACATGCCTTTTTTTTTTTTTTTCTTTATTTCATTGCGTATCCTGTGTGTCACGAGATGCGGTGGTTTTAAATAACATACATTACTCCAAGCATGTGTCCACTGTCATGCGAATGGTGCATGAACTGAGTTTTCTGTACAACTGCAATGGAAAAAGCCATAAATGCATGCAAAAATAGACATTGGTTTTAAATTCTTGTAATAAAATCCAGCATGATTAAATGTATTACCTTTCAGACA
>TU66837
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Function


GO:

id name namespace
GO:0016071 mRNA metabolic process biological_process
GO:0000375 RNA splicing, via transesterification reactions biological_process
GO:0000377 RNA splicing, via transesterification reactions with bulged adenosine as nucleophile biological_process
GO:0006397 mRNA processing biological_process
GO:0000398 mRNA splicing, via spliceosome biological_process
GO:0016607 nuclear speck cellular_component
GO:0005681 spliceosomal complex cellular_component
GO:0005685 U1 snRNP cellular_component

KEGG:

id description
ko03040 Spliceosome

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU66834 True 554 TUCP 0.49 1 14955242 14955795
TU66837 False 6983 lncRNA 0.38 3 14899398 14955795

Expression



Co-expression Network