dcun1d4 (dcun1d4,LOC107755250,LOC107597444)


Basic Information

Item Value
gene id dcun1d4
gene name dcun1d4,LOC107755250,LOC107597444
gene type coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035899.1
NCBI id CM008302.1
chromosome length 74127438
location 63318652 ~ 63334868 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

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Function

symbol description
dcun1d4 Predicted to enable cullin family protein binding activity; ubiquitin conjugating enzyme binding activity; and ubiquitin-like protein binding activity. Predicted to be involved in positive regulation of protein neddylation; positive regulation of ubiquitin-protein transferase activity; and protein neddylation. Predicted to be located in nucleus. Predicted to be part of ubiquitin ligase complex. Orthologous to human DCUN1D4 (defective in cullin neddylation 1 domain containing 4).

NR:

description
PREDICTED: DCN1-like protein 4 isoform X2

GO: NA

KEGG:

id description
K17824 DCUN1D4_5; DCN1-like protein 4/5

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_007257029.2 False 5735 mRNA 0.39 11 63319256 63334868
XM_007257030.3 True 6943 mRNA 0.39 11 63321555 63334868
XM_022664352.1 False 5629 mRNA 0.39 11 63318652 63334868

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
ociad2 ociad2 coding upstream 3695 63307949 ~ 63314957 (+)
ociad1 NA coding upstream 22929 63290134 ~ 63295723 (+)
zar1 zar1 coding upstream 183915 63132960 ~ 63134737 (+)
slc10a4 slc10a4 coding upstream 187552 63123306 ~ 63131100 (+)
slain2 slain2 coding upstream 206993 63087980 ~ 63111659 (+)
spata18 spata18,LOC107683994,LOC107601933,LOC107755228 coding downstream 30806 63365674 ~ 63379522 (+)
rasl11b rasl11b,LOC107718428,LOC107601936 coding downstream 186677 63521545 ~ 63524944 (+)
fip1l1 NA coding downstream 429901 63764769 ~ 63822100 (+)
gsx2 gsx2 coding downstream 760782 64095650 ~ 64097660 (+)
LOC103022002 LOC103022002 coding downstream 767413 64102281 ~ 64104332 (+)
LOC111191941 NA non-coding upstream 19920 63297863 ~ 63298732 (+)
G30335 NA non-coding upstream 30518 63263950 ~ 63288134 (+)
G30314 NA non-coding upstream 168437 63149666 ~ 63150215 (+)
G30311 NA non-coding upstream 175984 63139298 ~ 63142668 (+)
G30280 NA non-coding upstream 201237 63116862 ~ 63117415 (+)
G30383 NA non-coding downstream 98963 63433831 ~ 63435982 (+)
LOC103041812 NA non-coding downstream 131375 63466243 ~ 63468751 (+)
G30393 NA non-coding downstream 192653 63527521 ~ 63550200 (+)
G30517 NA non-coding downstream 971247 64306115 ~ 64306424 (+)
G30539 NA non-coding downstream 1087633 64422501 ~ 64422895 (+)
LOC103035278 NA other upstream 387519 62926018 ~ 62931133 (+)
LOC103045797 NA other upstream 465364 62821743 ~ 62853288 (+)
LOC103046322 clic5b,LOC108411995,LOC107678823,LOC107726746,LOC105897798,LOC103355727,LOC108258161,LOC107743284 other upstream 1382569 61926080 ~ 61936083 (+)
c3h14orf2 NA other upstream 2793601 60520342 ~ 60525051 (+)
nme6 nme6 other upstream 3720320 59586709 ~ 59598332 (+)
G30362 NA other downstream 866 63335734 ~ 63345693 (+)
kit kit other downstream 896376 64231244 ~ 64269695 (+)
LOC103033886 LOC108257901,LOC105910874 other downstream 1687551 65022419 ~ 65046978 (+)
LOC103031672 NA other downstream 1742912 65077780 ~ 65086780 (+)
trnad-guc_9 NA other downstream 1763634 65098502 ~ 65098573 (+)

Expression


Co-expression Network