fyn (fynb,fyn,LOC107704353,LOC103458010)


Basic Information

Item Value
gene id fyn
gene name fynb,fyn,LOC107704353,LOC103458010
gene type misc
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035899.1
NCBI id CM008302.1
chromosome length 74127438
location 38667509 ~ 38717435 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

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CAGAAGTCTGAGCACACCTGAGTTAAtgaacattttatgttttttgacctaaaggtaaaaaaaattaaatgcttgagattttattctaaaacaattaatagtgaTCTTGATGCCTGCGTATGAATTTATTCTTGTAACAACTTCTAAGAAATTACGCTTTTTAACTGtcattttatagtttattgtCTTTACCCTTATGTTATATTCtaacacattaaaataacacCAAGAACTCTTCATGATCAGGTGTGTAAATCCTTGGACTGGAGCAGTATGTTGTAACAGGGctggatgatgatgaagaaaatGCTGTTTGCTTTTACAGTAACTTTACTGTATCAGAAAATCCACTCTGCTATATTTTCCATCTCAATTTAAACATTTCCTTTTGTTAACCGTTTGATTTACCATTTGAAAATaaagtacagtattttaca

Function

symbol description
fynb Predicted to enable non-membrane spanning protein tyrosine kinase activity and signaling receptor binding activity. Acts upstream of or within convergent extension involved in gastrulation; fin regeneration; and regulation of protein kinase activity. Predicted to be located in cytoplasm. Predicted to be extrinsic component of cytoplasmic side of plasma membrane. Is expressed in caudal fin. Human ortholog(s) of this gene implicated in Alzheimer's disease and schizophrenia. Orthologous to human FYN (FYN proto-oncogene, Src family tyrosine kinase).
fyn Enables several functions, including disordered domain specific binding activity; phospholipase binding activity; and signaling receptor binding activity. Involved in several processes, including T cell receptor signaling pathway; cellular response to amyloid-beta; and peptidyl-tyrosine phosphorylation. Located in cytosol; endosome; and plasma membrane. Colocalizes with membrane raft. Implicated in Alzheimer's disease and schizophrenia. Biomarker of Alzheimer's disease.

NR:

description
PREDICTED: tyrosine-protein kinase fynb-like isoform X1

GO:

id name namespace
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GO:0051480 regulation of cytosolic calcium ion concentration biological_process
GO:0045859 regulation of protein kinase activity biological_process
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GO:0004715 non-membrane spanning protein tyrosine kinase activity molecular_function

KEGG:

id description
K08892 FRK, PTK5; fyn-related kinase

RNA

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Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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Expression


Co-expression Network