LOC111188745


Basic Information

Item Value
gene id LOC111188745
gene name NA
gene type coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035899.1
NCBI id CM008302.1
chromosome length 74127438
location 52769242 ~ 52781864 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>XM_022662521.1
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>XM_022662526.1
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_022662521.1 True 4770 mRNA 0.38 9 52770827 52781864
XM_022662526.1 False 4096 mRNA 0.41 10 52769242 52781864

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC103032675 kcnk10a,LOC103032675,LOC108413877,LOC107664828,LOC107582110,LOC107740298,LOC107747370,LOC107668129,LOC105017581 coding upstream 159421 52574938 ~ 52609821 (+)
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LOC103033541 LOC108413844,LOC108417958 coding downstream 3795 52785659 ~ 52789369 (+)
LOC111188773 LOC108417958 coding downstream 29189 52811053 ~ 52816494 (+)
LOC103041583 LOC108417958 coding downstream 43320 52825184 ~ 52829284 (+)
epb41l2 epb41l2,LOC107560489,LOC106571359,LOC100380760 coding downstream 1181698 53963562 ~ 54049416 (+)
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G27763 meis1,LOC103032373,LOC100690952,LOC106953003,LOC102195920 non-coding upstream 238242 52528728 ~ 52531000 (+)
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LOC111188765 glrx5,LOC106571612 other upstream 266 52760113 ~ 52768976 (+)
G27729 LOC103457336,LOC100194557,LOC103359577 other upstream 313078 52454431 ~ 52456164 (+)
G27683 LOC108412685 other upstream 454976 52314025 ~ 52314266 (+)
dsel dsel,LOC108411752,LOC105896186,LOC106590194 other upstream 678609 52083282 ~ 52090633 (+)
G27489 NA other upstream 1590868 51174488 ~ 51178374 (+)
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Expression


Co-expression Network