LOC103024246 (tspan11,LOC108279944,LOC107593980,LOC106576552,LOC107720401,LOC107560736,LOC107694254)



Basic Information


Item Value
gene id LOC103024246
gene name tspan11,LOC108279944,LOC107593980,LOC106576552,LOC107720401,LOC107560736,LOC107694254
gene type misc
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_035903.1
NCBI id CM008306.1
chromosome length 40813162
location 1445635 ~ 1481418 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence


>TU82422
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>TU82423
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>XM_022671207.1
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>XM_022671208.1
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>XM_022671209.1
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Function


symbol description
tspan11 Predicted to be involved in cell migration. Predicted to be located in membrane. Predicted to be integral component of membrane. Predicted to be integral component of plasma membrane. Orthologous to human TSPAN11 (tetraspanin 11).

NR:

description
PREDICTED: tetraspanin-11-like isoform X1

GO:

id name namespace
GO:0016021 integral component of membrane cellular_component

KEGG:

id description
K17352 TSPAN11; tetraspanin-11

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_022671209.1 True 4879 mRNA 0.39 8 1445636 1480910

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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LOC103022887 gdi2,LOC108436005,LOC108279819,LOC107754057 coding downstream 345422 1826840 ~ 1841427 (+)
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G61013 LOC108444125,LOC108444119,LOC108412201,LOC108262118 other upstream 402319 853526 ~ 1043316 (+)
LOC103045537 NA other upstream 820626 599659 ~ 625009 (+)
LOC103023024 cry1,LOC103023024,LOC108426403,LOC108279922,LOC105900698,LOC107560722 other upstream 887055 539518 ~ 558580 (+)
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Expression



Co-expression Network