G61317 (LOC103032312)


Basic Information

Item Value
gene id G61317
gene name LOC103032312
gene type non-coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035903.1
NCBI id CM008306.1
chromosome length 40813162
location 2454579 ~ 2461811 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>TU82768
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>TU82770
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>TU82771
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>TU82772
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>TU82774
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Function

NR:

description
beta-2-microglobulin-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU82768 False 1087 lncRNA 0.39 3 2455748 2461811
TU82770 True 2214 lncRNA 0.34 4 2454579 2461811
TU82771 False 753 lncRNA 0.35 2 2455748 2456536
TU82772 False 767 lncRNA 0.35 2 2455748 2456536
TU82774 False 711 lncRNA 0.32 2 2454579 2455599

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
lmo3 lmo3,LOC107757261,LOC107550907 coding upstream 130319 2274367 ~ 2324260 (+)
tmem121b cecr6 coding upstream 449333 2003842 ~ 2005246 (+)
mkrn1 mkrn1,LOC107725576 coding upstream 452950 1984873 ~ 2001629 (+)
LOC103022068 asb13a.2,LOC103022068,LOC108436004,LOC108280001,LOC107754063,LOC107560715,LOC107655562 coding upstream 592741 1846538 ~ 1861838 (+)
LOC103022369 LOC103022369,LOC108436003 coding upstream 608817 1842278 ~ 1845762 (+)
wif1 wif1,LOC107757271,LOC107594874,LOC107725640 coding downstream 152397 2614208 ~ 2642104 (+)
LOC103029880 NA coding downstream 191794 2653605 ~ 2657494 (+)
cand1 cand1,LOC107694273,LOC107571724,LOC107587138,LOC107655592 coding downstream 806153 3267964 ~ 3292593 (+)
dyrk2 dyrk2,LOC107694272,LOC107757277,LOC107655591 coding downstream 880908 3342719 ~ 3373751 (+)
rap1b rap1b,LOC106576640,LOC107695907 coding downstream 1100934 3562745 ~ 3642423 (+)
G61316 NA non-coding upstream 3070 2446079 ~ 2451509 (+)
G61302 dera,LOC107725660,LOC107655558,LOC107587132,LOC107594694,LOC107694244 non-coding upstream 30463 2415033 ~ 2424116 (+)
G61236 arhgef39,LOC107725686,LOC107655603 non-coding upstream 301993 2118799 ~ 2152586 (+)
G61233 NA non-coding upstream 360547 2090861 ~ 2094032 (+)
G61222 NA non-coding upstream 421292 2033003 ~ 2033287 (+)
G61320 NA non-coding downstream 4699 2466510 ~ 2469484 (+)
G61330 NA non-coding downstream 112008 2573819 ~ 2574425 (+)
G61334 NA non-coding downstream 114468 2576279 ~ 2581632 (+)
G61332 NA non-coding downstream 126260 2588071 ~ 2589176 (+)
G61370 NA non-coding downstream 196107 2657918 ~ 2658139 (+)
LOC103036328 tmem178b,LOC107725619,LOC107694293,LOC107590312,LOC107655551 other upstream 519080 1921395 ~ 1935499 (+)
LOC103031096 pclo,pcloa,LOC107655554,LOC107577557 other upstream 645649 1714817 ~ 1808930 (+)
LOC103024246 tspan11,LOC108279944,LOC107593980,LOC106576552,LOC107720401,LOC107560736,LOC107694254 other upstream 973161 1445635 ~ 1481418 (+)
G61014 NA other upstream 1405523 806565 ~ 1049056 (+)
G61575 NA other downstream 834735 3296546 ~ 3303998 (+)
LOC111192936 NA other downstream 3278744 5740555 ~ 5765785 (+)
plxnb2 NA other downstream 3320280 5782091 ~ 5967735 (+)
c7h12orf75 NA other downstream 3520425 5982236 ~ 5993994 (+)
G62455 gpr85,LOC106576049,LOC107580073 other downstream 4389419 6851230 ~ 6855762 (+)

Expression


Co-expression Network