LOC103041471 (slc37a3,LOC106609230,LOC106576065,LOC107719875,LOC107758206,LOC107601005,LOC107562143)


Basic Information

Item Value
gene id LOC103041471
gene name slc37a3,LOC106609230,LOC106576065,LOC107719875,LOC107758206,LOC107601005,LOC107562143
gene type misc
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035903.1
NCBI id CM008306.1
chromosome length 40813162
location 8526218 ~ 8540123 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>TU84760
AGTGCAGGGCCTGATCTCTGATTTTCTTGGTAAAAGAGCTCCTGTGCTTTCTGTCAGTTTGCTCCTGGCTATGGGATCTTTAGTTGGATATAGCCATTCTCCAAATGATCAAGTGATAAATGGAGTGCTTTTAGCAACAACTGGTTTTCTTATTGGTGGCCCCTCTAACATGATAAGCTCAGCAATCTCAGCAGACCTGGGCAGACAAGAAGCTCTACAGGGCAGCCAGGAAGCTTTGGCCACTGTTACGGGCATAGTGGATGGAACTGGCAGCATCGGGGCTGCAGGTGGACAGTACCTGGTGTCACTCATCGAGAGCAAACTAGGATGGATGTGGGTCTTTTACTTCTTCATTCTTATGACGGGGTTCAGCATTGTGTTCATCATTCCTCTTATTATAAGTGAAGTGCGTGCCATGtgcagagacagacaggcaagGACACACCAGCTCTGAGAGCTTATTTATGTTTTGGACTCTTGTTTTATTGAGGTTAGTATGAGAGAGATTGGCTGTGTCTCAGTCTGAACACACAGAACACTCAGTTTTATCCCGCTCTCTGGCtgctttttaaagattttgtgACAGTTGGTCTAAATAGTTAGTTGACTCCAGGGGTGAATTAATTTATGCCATATTAGTAACAATGACTGGAGAGAGGTAAGTGTCATCCGTGTCTTAACAGGCCAGGAGTGACTGTCAGTTTAACTAGCCTGTTaagcatgttttcttttttttttcatattctcGCTTGAAACAAGCTCAGTGTATTTCAGTGTATGTTTAAAGCAACACTGATGTATAACAATGGAAGACTTTAAGTGGTTATAATCAAAAGTTAATTAAGAGATCATTGCTGTCAGTCAAACCTTGCATCTCCAAAATtgcaacttttaaaaaatatattttcaatggATGCACTATTGGTGCATTCAacacaacatttaaacacagtgtaaagaacaactgccataTTCATAGTGCTGAAGCCCTTTAACAGTggttcagagctttcagagcacAGAGCAAGACTTCAAGTTAGTTATCTATTTGGGTAGCAGAacatcttattttcttttactcagataATAAGGTAGTAAAAACTGTGCAAATCCAACTCATGTCATCAGACGGGTGGCTTCTGTTCTGTCATCCCGTGGGTTCTAgcagtaacttaaaaaacaTTAGTGGTTTGCAGTTTCCATTAAGAAAGAGAagaccagcttttttttttttttatttggctcTTATATCTTGAAAAAACCCTTAATGAGCAATTTaaagcctttacacaattcagTGCCTTTATTTTAGGCCCAGATTTTAATTCTGAGTTTAGCATTTTGACATTTGTAGGTTTTGAGGCCTATTCACAACAAATCAGAAACTGACGGACTGTGATCAGTGTTGGCAGTTTTATTATAATGAAAAGTACCTAAATCCAGTTtgaaaagtataaatatattaaaaaatattttgtatttacatgCTGCCTAGTGTTATATGGTAGCAGGCTTTTACAGTGATGAACAACTATTTcatatttatcaaaaaaaatcAGCAGTATGCAATAAATTAAGGAATGCACTGAAATTCAGCGAATCACAAAATGGAATTGAACGTGCAAATACTTCAGTATAATATATTGTGGAGGTAATGTGGAGGTATAATATAACAAGTGGAGGTACTGAGTTTTATGCATTTAGTAATTTATTAGACACAAGTACCACAATGattttatgttaattaaattattttcagcTCAAAAACTCTGAATTAAAATTAACTCAACAGAAGGAGTAGCGAACAACAGATTAATGATTCGTCTTTGGCAGCACTACTTGCTGTTAAATTCGTCTTACAAATAAAACGAACTTGGTGTGAATAGGCCTTTATTCcccaaaaaaagagaggaacCAGCCAGCAGTTCCTTCAGCATTTCTTTCAGTCCATTAATTAGTGTAAGCAAATCTAAGCAACATTTTTCCAGCTGCACGTACTTGTAAAATAGAGTGGGAAAATGTGTTAACCAATGGAACTGTATAGTATCTATTcttttaaattgtgttatttattaatctttttttttattactgaagatttttattgattttactgGCTGCTTTGAAGGGGCAGAACCTTCGTGCTGCAGTTGTGGTTTGTATGTTGTGATGAAAGGAACCAAATCCCTCAGCCATTCCACATATTTGGGTTAATAGAAGCTAGAAACTGGAATTTTTAAGTGGTGCTTTTGGGGACTGTTTAAATGAGATTTTAGTTTAGTagtgttagtttagttttttaaagcATTGTGGTGTATATACTCTAtagtagtatatagtatatatacactAGAACACATTTTGTGAATGATTTTTTGGACTGCCTTAAATTGAGTGGATTTATtgaacaacagcaacaacaaaatGATGGTCTGTATTGAGtactaatgtaatatatatacgtTATACAGAACAATTTCAAGGCATCTCTATTACTGTACAGCACCAGGGTTTTTAATGAGTGAAATGTACAGcaataaatatagatatatatatatatatactgtactgtgtaaACGTTACAGactaccttttatttatttaattttcagtcGAAAGTTACAGTTTGCCATATCGCTATATGTGTAACAGATCACTGCCACATCCTGAACACATTCAGTGATAGAGTTCTGTACTCTGGGGTAGTCATTTATTTGTCCTCCACTTGTGATAACAAACATGTATAACCCCCCtccttaattttctcttttcctgTGTGCTGCGCTCTTATTGGCTGTAGCTCCTCgctgcacaaatataaacatgcTTGTTATTTGCAGACATCCctgcaaaaattaatttcaggaaggTGCCCCCGGACCTGGACTTAGTACTATTTAGTACTAATACAAACTGTACAGCTGgcaagactttcattgttttttacttttaccagacatggatatactttagagtagtcagagatGAAATGAGTTTCGATGGGAGCCGTGATGCTCCTGAACACATCCCATCCAGGAgggaaaaaacactgcctgcccacactaaaaagtgattggctgactcacagactctttgcagagaacaggccaatcagaaccctctctgttttgcatgggctgcatctttctttccttctcttttgcAAACATGATTGGGGAAAAAGTCTGTGTCGCCTGCGTGCGCATGCTAGATTCCAggagttttttttctgatctgcaggcatcagggagccgttattgatatgcggtagtCTCCTGCGTCTTCCGTGAGACTTGGGACATCTGTATTTGTCAGGGGCTTGCAAGGCAGTCAGATTACACATAGCTTTAGTGCCAAACAAACAGCAGTTGCCTCTGATCCGAGACTTTTGTCAGTGATTTACAAAAACAATTGGTGAAtattaaggtagagtgaggtagatgtcCACATTGAACCTCACACCAAACTACCTCTTATGCTGGGAACAATGAGTGCAGCCAAGCCAATTTCTAAATATCCTTTGAAGAgcttaaattaattcattttattttacatgtatcaatatcaatataccCAACAGTCTATGTCATCCACCTCATTTGTAAACAGGGtctaaatctacacagaatcatctactgaaataaatagtattaaatagttttttttagacTGGGAAAGTAAATACACAAAGGGTGATCTCTGACTTTTGCACTGTACTATATAAATAATCACTCTATACTCtaaaatagtgtatatatgtatactaAGTATGATGATCTCTTAACACTTTATTACTTGTGAAAAGATGTTCTGGTGAATCACACCTCGATGGACAACCTCGCTTTTAAATTTGCTCGCTTGTCTCAGGATCTGGAACTGTAAAGACCTTGGAAAGCTGAACGttgttaaaatgagttaaaacgAGACTCTTCAGCTTTTAGAAAAACTGGTACGAACTGCACACAGCCTTTTTTTTGCAGCGCATGCCTTTAAATTAGTTTGTACTCTTCAGTGAAACTAAAGGAAAACactatgtcactcataaaaacGTGCTATAATGGGAAAGAGATCACAGGTTTATTTTGGTATGATGCCATAGATCTAATGGAAACTTGATGAACTTGATCACATGTATAATGTTGAAATCAAGCTCAGGTCTTTCTTTAGTGAATGCTCTGACGAAGCAGCAGGTTTGCTGCTGAGCCACGGTTAGatatacttgattttaaaagaatgttCTCTCCCATTCTCTgtggtaatgtttttttttattgtttttttaaatgtgaaagtCCTTATTTTATGTGAATGTTTCACACATGCACTTTAGTAAGAATGgcttaaacttttattttgttattatgttgttgtattttatttgcaa
>TU84764
GCAACAAGTCTGATTTCAGTGGAAAGGGATCCAGACAGCCATCAGCCACTCATGAGTGATGATGAGGAGGGTGATGAAGATGCAGTTTGTGATGGAGGATACTATTCCATACAGCAGCAGGATGAAGAACCTGTGTCCCAAGCCAAACCCATCGGTTTCTGCCAGGCCTTCTGTCTGCCTGGAGTCCTTCCTTACTCTTTGGCCTATGCTTGTCTGAAGCTGGTGAACTACTCCTTCTTCTTCTGGCTGCCGTTCTATTTGAGCAACAACTTTGGCTGGAAGGAGGCTCAGGCTGACCGTCTGTCTGTATGGTACGATGTAGGAGGAATTATAGG
>XM_022671304.1
AGGAGCGGATCCTCCAACACGTCACTTCCTGACACATTGGTCATCAACATCTGGGAGGAGATACGAGCTCTGTGTGCAGGAATAAAGcCCCAGATGATGCGTTAGTGTGCCgtcccctctccctctcccgaAGACTTCCacccctcctctttctcctcctccacaTCCTGCCGAGACCCCAGTGATGTGGCCCCCCGGCTGCGCTTTCCTGTCGCAGTACACACATCATCACCTGGTCGCCTTTCTCCTGACCTTCTTTAGCTATGTCTTGCTGCATGCTTCACGCAAAACTTTCAGTAATGTGAAAGTGAGCATCTCAGCACAGTGGACTCCTTCAGCGCAGAACACTAGCTTTTTACCTGGAGAGACATGGGAAGGCAACAAACTGTTTGCAGACAGTGAAGAGGCCACACTGTTCCTGGGTGCCCTGGACActatctttctcttctcttatgCTGTGGGCTTGTATATCAGTGGGGTAATCGGAGACCGGCTGAATCTCCGTTATGTCCTGGCCACTGGGCTGTGTGGTTCCGCTATTGTGgAGTTTATTTTTGGAACTCTGACAGAGTGGCTGCAGTTCTATAATGTGTATTTCTACTGCAGCCTCTGGGTGCTGAATGGCCTGCTACAGTCAGCAGTATGGCCTTGTGTGGTGGCTGTCATGGGcaactggtttggtaaatctGGCCGAGGTTTTGTGTTTGGCTTGTGGAGTGCCTGTGCGTCAGTGGGGAATATACTGGGAGCGTTCCTGGCATCCAGTGTCCTCAAGCATGGCTATGAGtaTGCTTTCCTGGTGACATCAGTGGTGCAGTTTGCGGGTGGAGTAGTTGTGTTTTTCGGCCTGCTCACCTCCCAAAGGAAGTTGGTGAGTCTTAGTGACTCTGCAACAAGTCTGATTTCAGTGGAAAGGGATCCAGACAGCCATCAGCCACTCATGAGTGATGATGAGGAGGGTGATGAAGATGCAGTTTGTGATGGAGGATACTATTCCATACAGCAGCAGGATGAAGAACCTGTGTCCCAAGCCAAACCCATCGGTTTCTGCCAGGCCTTCTGTCTGCCTGGAGTCCTTCCTTACTCTTTGGCCTATGCTTGTCTGAAGCTGGTGAACTACTCCTTCTTCTTCTGGCTGCCGTTCTATTTGAGCAACAACTTTGGCTGGAAGGAGGCTCAGGCTGACCGTCTGTCTGTATGGTACGATGTAGGAGGAATTATAGGTAAgggaACAGTGCAGGGCCTGATCTCTGATTTTCTTGGTAAAAGAGCTCCTGTGCTTTCTGTCAGTTTGCTCCTGGCTATGGGATCTTTAGTTGGATATAGCCATTCTCCAAATGATCAAGTGATAAATGGAGTGCTTTTAGCAACAACTGGTTTTCTTATTGGTGGCCCCTCTAACATGATAAGCTCAGCAATCTCAGCAGACCTGGGCAGACAAGAAGCTCTACAGGGCAGCCAGGAAGCTTTGGCCACTGTTACGGGCATAGTGGATGGAACTGGCAGCATCGGGGCTGCAGGTGGACAGTACCTGGTGTCACTCATCGAGAGCAAACTAGGATGGATGTGGGTCTTTTACTTCTTCATTCTTATGACGGGGTTCAGCATTGTGTTCATCATTCCTCTTATTATAAGTGAAGTGCGTGCCATGtgcagagacagacaggcaagGACACACCAGCTCTGAGAGCTTATTTATGTTTTGGACTCTTGTTTTATTGAGGTTAGTATGAGAGAGATTGGCTGTGTCTCAGTCTGAACACACAGAACACTCAGTTTTATCCCGCTCTCTGGCtgctttttaaagattttgtgACAGTTGGTCTAAATAGTTAGTTGACTCCAGGGGTGAATTAATTTATGCCATATTAGTAACAATGACTGGAGAGAGGTAAGTGTCATCCGTGTCTTAACAGGCCAGGAGTGACTGTCAGTTTAACTAGCCTGTTaagcatgttttcttttttttttcatattctcGCTTGAAACAAGCTCAGTGTATTTCAGTGTATGTTTAAAGCAACACTGATGTATAACAATGGAAGACTTTAAGTG

Function

symbol description
slc37a3 Orthologous to human SLC37A3 (solute carrier family 37 member 3).

NR:

description
PREDICTED: sugar phosphate exchanger 3

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU84760 True 4384 TUCP 0.37 5 8533348 8540123
TU84764 False 335 TUCP 0.50 2 8532759 8533232
XM_022671304.1 False 2055 mRNA 0.48 15 8526218 8536561

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC103044524 NA coding upstream 1181 8517980 ~ 8525037 (+)
LOC107197608 LOC107197608,LOC108425361 coding upstream 9684 8510515 ~ 8516534 (+)
ckap4 NA coding upstream 94228 8428552 ~ 8431990 (+)
LOC103021322 LOC108425378,LOC108279462 coding upstream 604994 7820355 ~ 7921224 (+)
smkr1 NA coding upstream 755975 7766846 ~ 7770243 (+)
sapcd1 NA coding downstream 27174 8567297 ~ 8572672 (+)
LOC103045143 LOC108425356,LOC108425352,LOC108280014,LOC103363517,LOC107719870,LOC104927640,LOC107699203 coding downstream 249232 8789355 ~ 8882696 (+)
LOC103042395 LOC108425352,LOC108425356,LOC103363517,LOC107719870,LOC107699203,LOC104927640 coding downstream 516300 9056423 ~ 9168847 (+)
kiaa0930 kiaa0930,zgc:172139,LOC102798964 coding downstream 656009 9196132 ~ 9246664 (+)
phf21b phf21b coding downstream 753697 9293820 ~ 9423281 (+)
G62873 NA non-coding upstream 451 8525568 ~ 8525767 (+)
G62805 pacsin2,LOC103038884,LOC108279716 non-coding upstream 29929 8464127 ~ 8496289 (+)
G62810 arfgap3 non-coding upstream 70307 8451492 ~ 8455911 (+)
G62807 NA non-coding upstream 91836 8433736 ~ 8434382 (+)
LOC107197604 NA non-coding upstream 151523 8370763 ~ 8374695 (+)
G62902 NA non-coding downstream 74095 8614218 ~ 8614523 (+)
G62945 NA non-coding downstream 416628 8956751 ~ 8956951 (+)
G62947 NA non-coding downstream 456545 8996668 ~ 8998907 (+)
G62949 NA non-coding downstream 473576 9013699 ~ 9013925 (+)
G62951 NA non-coding downstream 492680 9032803 ~ 9033574 (+)
rab19 rab19,LOC108425368,LOC106523538 other upstream 111179 8401840 ~ 8415039 (+)
G62455 gpr85,LOC106576049,LOC107580073 other upstream 1670456 6851230 ~ 6855762 (+)
c7h12orf75 NA other upstream 2532224 5982236 ~ 5993994 (+)
plxnb2 NA other upstream 2558483 5782091 ~ 5967735 (+)
LOC111192936 NA other upstream 2760433 5740555 ~ 5765785 (+)
LOC111192948 NA other downstream 891376 9431499 ~ 9440564 (+)
G63051 NA other downstream 1106456 9646579 ~ 9650087 (+)
G63432 NA other downstream 3927927 12468050 ~ 12468902 (+)
LOC111192955 NA other downstream 4616103 13156226 ~ 13161367 (+)
gata3 gata3,LOC107555822 other downstream 5627106 14167229 ~ 14242234 (+)

Expression


Co-expression Network