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Item Value
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gene type misc
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_035903.1
NCBI id CM008306.1
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Sequence


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Function


symbol description
cyth3b Orthologous to human CYTH3 (cytohesin 3).
cyth3 Enables guanyl-nucleotide exchange factor activity and phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate binding activity. Involved in Golgi vesicle transport. Located in cytosol; nucleoplasm; and plasma membrane. Is extrinsic component of cytoplasmic side of plasma membrane.

NR:

description
cytohesin-3 isoform X3

GO:

id name namespace
GO:0043087 regulation of GTPase activity biological_process
GO:0032012 regulation of ARF protein signal transduction biological_process

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TU87262 False 3454 TUCP 0.40 5 17535296 17597545
TU87264 False 5422 TUCP 0.35 4 17586845 17597545
TU87266 False 5422 TUCP 0.35 5 17586845 17597545
TU87269 False 1777 TUCP 0.46 4 17591116 17597545
TU87272 True 5453 TUCP 0.35 5 17586845 17597545
TU87274 False 5453 TUCP 0.35 5 17586845 17597545
TU87275 False 4819 TUCP 0.35 5 17586845 17597545
XM_022671179.1 False 2178 mRNA 0.51 12 17591701 17664561

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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LOC103027149 LOC103027149 coding downstream 874789 16654113 ~ 16660507 (-)
stk19 stk19,LOC106601743,LOC106601674 coding upstream 56568 17721129 ~ 17731699 (-)
LOC111192974 tvp23b,LOC108437154,LOC105899270 coding upstream 118191 17782752 ~ 17797809 (-)
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ush1g ush1g,ush1ga,LOC107556601,LOC107698769,LOC107568596 coding upstream 175618 17840179 ~ 17855162 (-)
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G64835 rac1,RAC1,LOC105898786,LOC108437155,LOC106601744,LOC107664344 non-coding upstream 25668 17690229 ~ 17719911 (-)
G64841 rac1b,rac1,LOC103481976,LOC106531821,LOC102217008,LOC105935606 non-coding upstream 43435 17707996 ~ 17715442 (-)
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LOC111192971 LOC108435850 other upstream 973746 18638307 ~ 18650343 (-)
G65184 LOC108435872,LOC108274344,LOC107731677,LOC107558868 other upstream 1233624 18898185 ~ 19023658 (-)

Expression



Co-expression Network