G66480 (slc16a7)


Basic Information

Item Value
gene id G66480
gene name slc16a7
gene type non-coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035903.1
NCBI id CM008306.1
chromosome length 40813162
location 24223005 ~ 24231186 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>TU89690
AATAAAATCAGAGATGTTGACAAACTGACAAACTGGTTAATACTGTACATGAAAATGTCATAAAACTCATTGCCTAATTATTACCCTAACTATGAACTACCCTTTAAAAAACTTTGACAGGAATTGAAAACTGCAGGTCAAATGAAGAAGATTGAACATTATACAAGTGAAGAACATTATACAAGTGATCAGTTGTTCTCAAATTCTTAAAAACTTGCAACACATAGGAATCGAGCAGAAATGTATGTCCCTTAGGACCACTGCACTACATGCGGACACTATGTACATACTTAATATTAATAAGTGTCTGTAAATTACTGCTAAATTCTGTAATCAAACCCACTGAgtctgtttgtctatttttgtgAATGTATAAACTTGTGTGCAGCATATACCAGTTATCATAAACTGATGAGTGAATCTGACAAGGAATGAAACAATGATGAACCTCTTATATCTGAGATCACTGACTAATGTGCAAAACTAACttaattttaattgaattaattaatatatatacagctctgaaaagaaaTCTGACCTCCTTgaatttttgcgccaggagtggcataaaattatccaaaagcagtgtgaaagactggtggaggagactattccaagatgcataaaaactgtgattaaaaaccaggggtattccaccaaatattgatttctaaactcttaaaactttataaatgtgaacttgtattctttgcattatttgaggtctgaaagctctccatctttttatttatttcagccatttctcattttctggaaataaatgctctaaatgacaatatttttatttggaatttgggagaaatgttgtccgtagtttacagaataaaacaacattaattttactcaagcatatacctaaaaatagcaaaatcagagaaacagatctcttatttttcccccagagctgtgtatatatacatatatagacctACAGATCTTGTCTTGTCATACATATCTTGTCTTGTGTTTGGTTCCCTTTGGTGACCCCTTGTGGCGTACAGGCTTGGAATCAGTGGACATACACAGTTCTAGGAAACAGGTCACATGGATATGGCTTGGACTACatgttattttgtgtgtgttcagtacATACAAACATTAATACACAACTCTTTGTTTTCACATCACAAGAACAGTTACTGCTGCAGTTTGCAGGCAGCCGATTTCAAACACCATGATGTAAAATGTATGTAGACTAATAAGAcacaattacaatattttatcaatACCCTGTGCCTGGGGCTtatatgattatttttaaaaggaTCCCTTAAATACATAGTGTGCGTAACAGAAAGTagattatgacaaaaaaaaaaaaagaacagaacagaatactTAATTGGCCATGACATTTATAAAATgatttacaaaagaaaaatgaaatgtCATTCAAGTACAGAAGTTTGCTTCAATTAGTTACTACAAAATATAATGCATCCCAACAATAAGTGCATTTAAATTAAACCTTTATCACATGTCctaatttcttattatttcttaatttagtAGGTTAATTAGTATCTTACATCAATAAGCATTTCTATACACATCATATATAGATATCTTTATACACTGTTTTAACCTGTTGTTAGTTACGCTCTTTACATTTAAGGCAAGcataagttgtaaatacttagttttatacatttacactctctctctctctctctctctctctctcttttctctctctacctctctttcccAAAATAAAACTCCCCATACAGTATCATAAATATCCCTGTTTGGTTTAAGGTtttaacacttacacaatggAAGGTATATTATAGATACACTAATGAACCAAAACATTAAGACAAGAAATAACAGATAAATCTAATAACACTAGAAAACATGTCAAGATTGTTGGTAAGCAAGCAGTCGGCTCTTGTAGTTGGATGTGAAAGAAACAGGCATGTGTGAAGACCTGAGCGACTCTAACAGGAGCCAAATCCATTATTTCCAGACTGCCATGCTCGTAATATATTTCTGAGCAGCAGTGGTGTATACCTGGGGCCAATTAGcccacccattcattaggactcttCCTATCACTaagagggtgaagacaagcacatgcctccttttttcaaactgctgctgttacagTTGGAAGCCAGCGAACTCAGAGCACAGCACAGTGACCTAGCTTTGGCAAGCAGTTTCCTCATATTCAAATCAGCAATCCTCAGATCATAGTAAAAGCAACTTAGTCTGCTAAACCATTTAGAGTCCTCCAACAGTGATGAATATCTACTAAGGCGATGTTCACAGTACAAGCCACAACGCTCAAATCCCACATTTTTTTGCttagatcagatttggctatcttgatggttcacattcacaaatataagtcatctgtatctgtgtgtaatgtgaacaaatccaTCCCTAAAACGCCTCACATGTGCACACTGATACGTGTATTAACGTTGCCTtcttcacaaacaacaaaaacacatcaTATTTATGAGACAACTCATAAtggatgtgttagcagctcatatgtggagcatcttttacTCCAGTggagagcaaacagctggtctgaagtacacacctaggtcgaggaggagaaaaaagacaaggtggtttgcttttgctgtttttttttatagctgcacagctgcaccaagagatgtatacgagggtacgagagagaagcacataggAAATGTGTAacagcaaaaagacgcatgaattctgatttaacctttcacattcatgttgcatgtccatggatcagatacaTATCCAATTTATGAGCACATATGTAAaagactcaaatctgatttggaaaaaaaaaccgGATTTgtcacgttcacacagccatgaaaaaatgaGATCTGAGCAACATTGGGCAAAATATCAGTTTTGAGTCATTTTGgtttggtaatgtgaacatagcctaagaGTGGTCGAGGAAAAGACAAACCATTAATTGGTGATATGATGTTGGGCATCCCAGGCTTAATGAGGCACAAAGGTTGTGATGGTTTAATGATGGGTATTGGAGGAGTGCTACGGTAGCACACTGCTACACTAACTATATTACCAAAAGTATTcgctcacccatccaaatcattgaacTCAGGTTTCAATCACTTCCTTGTCCTCAGGAGATCAGTGAATTCCAGTATGTGGCACAGTTATAGGCTGCCACCTGTTCAACAAGCCCAGTTGTGATATtccctcactactaaatattccacagtcaactatTAGTGCTATTATCACAAAGTGAAAGTGACACAGAATGACAGCAACTCAATCTGTCAATGTATCAAAAATTATaaagtggtgtcaatcactacagacctccaaattTCATGTGGCCTTAAGATAAGTTCCAGAACAGTAGagctagtgctgggcagtattcCAGTTCATACGGTGTACTGCGGGGGAACCGGTATGCGTTTTTCCCATACCGCcacaccactagaggcgctgcagaGCACTGTGTAGAAGTGTAGAGCGCCGCCAAAGAAGCAACTGGCAGCTCTGCAGTGCCTCACTCGGTCACGGTCCAGAAATATGAGAACAGAACTCCTGCAGCTTCTGCTGTTATACCTTACAACATGAGTAACTATAACTGTGTTTAAATTAAGTGGAAAACCAAGGCAATTGTGATAAATTGATAAACAGctgcttaaatactttaattcCTCTAATGGCCtaaataataacattgtaaattgatattaaacttctTTCTTATTTGTGCAATAAagattttgaaaaatatatattaggtttattcatagtgtttatggaactatttaaaatattaaaatttgtaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagctgtgttaaagttgtcggcgtatctctttttaaggtctattatttacattattcagctgtttttctgataatgaagtctgatttctgcatatattgtgtaatttttgggacaaagtaaaccccatagtaaaaataaaagccttaatttaaagctatattgtttgatattatatgtactcataacagtacagtaagtcacaaccctatattaaagcccagttatgcacaaacatataaataaataataaataataataaaaaataccatgatataaCGTGAAACTGTCAGAACCTTGCAAAATTCTTTATTTGTAACCTTACAAATATGCTTATTTGgtcataccacccagcactaagTAGAGCATAACAAACAATGCAGCAGAGTctatacttttggcaatatagtgtatatattggGCTATACAGCTGAGGACCTCTCAGTGTGTCCATGCTATTCCCTGTTTAACCGTCAAAAGTGCTTACAAAGAACAAATGAACACTGGCAGTGGATCTTGGAATAGAAGAAGTTCCATTGATTGTTATATCACGTGGGCAGCTTCATAGTCATAAGAATTTACTTGGAAAGTGATGGTACCACAATGCACGGTGGAAAAAAGACAAGCTGGGGGAGGGACTGTAATGCTTTTAGCTGTGTACTGTCCTTCAGGCATTCATTTGgatatacactgacatgtttAATCTACCTAAAACAGGGTTTTACCTCTTCGCGGTAATGGAATTCCCTGATGGTTTCGGCTTCTTTCAGCAGAATCTCTTTCCTGCTGAAAACATTGTTTGAGAATGGTTTGAAGAACATGATAAATAGTTCAAGGTGTTGATCTGGACACCAAATTCTGCAGCTCTCAGTCtgattgagcatctgtgggatgtgttggaaaagaaaaaaaagttacctCAAAGACAAATTAATCAGGAATTAAAAGATCTGCTAGCGTGTCTTGGTGTCAGATACCACAAGGCATATACCGTGGTCTCGCAGCTCGAGTTGAAGCTGTTTTTGTGGCAAACAATAGATACACTACATATTATGCAGgaggtcataatgttttggtcatcagtgtatataaatatataattaggtTCTATATTTGGTAGTTACCCagcaatatgtatttttattccc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Function

symbol description
slc16a7 Predicted to enable monocarboxylic acid transmembrane transporter activity. Predicted to be involved in monocarboxylic acid transport. Predicted to act upstream of or within transmembrane transport. Predicted to be located in membrane. Predicted to be integral component of plasma membrane. Is expressed in brain; gill; and heart.

NR:

description
unnamed protein product, partial

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU89690 True 8136 lncRNA 0.37 2 24223005 24231186

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC103023565 fam19a2,LOC103023565,LOC108411383,LOC108248567,LOC106529719,LOC103364248 coding upstream 105292 24026461 ~ 24117713 (+)
etv6 etv6 coding upstream 269285 23916306 ~ 23953720 (+)
rerg rerg,LOC107662225,LOC107669035 coding upstream 674748 23451563 ~ 23548257 (+)
lrp6 lrp6,LOC100705426 coding upstream 1137961 23020384 ~ 23085044 (+)
LOC103025638 mansc1 coding upstream 1210232 23004755 ~ 23012773 (+)
lrig3 lrig3,LOC104942525 coding downstream 65731 24296917 ~ 24320066 (+)
LOC111192915 NA coding downstream 228217 24459403 ~ 24461001 (+)
LOC103034593 LOC108442311 coding downstream 279303 24510489 ~ 24517356 (+)
LOC103033942 LOC103033942,LOC108442313 coding downstream 324415 24555601 ~ 24559622 (+)
snupn snupn,LOC107673280,LOC107738646 coding downstream 1147251 25378437 ~ 25387120 (+)
G66476 NA non-coding upstream 36622 24186134 ~ 24186383 (+)
G66472 NA non-coding upstream 84820 24137905 ~ 24138185 (+)
G66389 NA non-coding upstream 245059 23976240 ~ 23977946 (+)
G66382 NA non-coding upstream 310794 23911828 ~ 23912211 (+)
G66353 NA non-coding upstream 402028 23818073 ~ 23820977 (+)
G66488 NA non-coding downstream 92624 24323810 ~ 24324032 (+)
G66514 NA non-coding downstream 153733 24384919 ~ 24389774 (+)
G66524 mapk12b,LOC103035956,LOC108442322,LOC107658737,LOC108279513,LOC107656379,LOC107710136,LOC107579544,LOC106609457 non-coding downstream 177334 24408520 ~ 24414278 (+)
G66556 NA non-coding downstream 274155 24505341 ~ 24505541 (+)
G66577 NA non-coding downstream 347967 24579153 ~ 24579353 (+)
LOC103027234 timp3,LOC108412896,LOC106609153,LOC103152565 other upstream 502911 23698152 ~ 23720094 (+)
G66303 NA other upstream 739072 23483333 ~ 23483933 (+)
G66296 NA other upstream 778328 23444174 ~ 23444677 (+)
eps8 eps8 other upstream 899644 23222514 ~ 23323361 (+)
crebl2 crebl2,LOC107707978 other upstream 1084994 23131080 ~ 23138011 (+)
rpap3 rpap3 other downstream 136306 24367492 ~ 24383022 (+)
osgep apex1,osgep,LOC107658891,LOC107656416,LOC107579619,LOC102796710,LOC103033632 other downstream 287436 24518622 ~ 24552340 (+)
lingo1 lingo1,LOC107673268,LOC107727415,LOC107562294,LOC107680146,LOC107560004 other downstream 367980 24599166 ~ 24684580 (+)
cspg4 cspg4 other downstream 957999 25189185 ~ 25300875 (+)
LOC111192916 NA other downstream 1849266 26080452 ~ 26092119 (+)

Expression


Co-expression Network