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Basic Information


Item Value
gene id LOC103036580
gene name slc25a44,slc25a44a,LOC108432728,LOC108274961,LOC107673271,LOC107727505,LOC107562286,LOC107738649,LOC107680149
gene type misc
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_035903.1
NCBI id CM008306.1
chromosome length 40813162
location 25516515 ~ 25530980 (-)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence


>TU90079
CGTGACTTTATCATGGAGCCGGACAGTCCAGTTTAAAGGCCGTGAGAGACATTAATTCACCCCTCTGTCTAACATGCTGAGGTTCGCTGCCGTGTTTAAAATCGCGGACGTGTGTTAGTTATCAGGGCTCGAGTGGGAGGAGGAGATCATGTCGAGCTGACCTGAGCAGCTATCCAGGCTGGCTCCCTCTAACTGCCCTCATCTGCTTCTGCAGGCTGTGGCTGGGCCCATGGCTGCAGCCACTGCCTCCACCATTACAAACCCTATGGATGTAGTGAGAGCCAGAGTACAGGTTGAAGGCCGCTCATCTGTGATTGAGACGTTTAAGCAGCTCTTGGCAGAGGAGGGAATGTGGGGGCTGACGAAGGGTCTGTCTGCACGCATCATCTCCTCGACTCCAACCTCCATCCTTATCGTCATTGGCTACGAGACACTGAAAAGGCTCAGTCTGAGGCCTGAGCTGGTTCACACCAGACACTGGTGATTTGCAGAGCCCAGGAGTGGATTCTGAAACACAGTCCAGGACAACTTTACCTCAGAGCTGAGCTTTATGGACTGGACCTCTCTTTTTAGGCCTCTTTGCCTTTTAAACAGTTGCCTTTTGGGATATTTTAACGTGTGGTCAGGCTGCATGGATTTTAAAACAGGGATTTTGGAAAGAGGACCAGGAGAAATTTGTGCAGtgctaatatttttttctggattaTGTAGAgatatgtattttataatttttttagctTGGATGTTATGgcctgattgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtaatggtgctTCATAGTGGACCCATCCAAAACCAGCATTTCCAGCTACACTACACTAAATTTAAcagtcagtttttaaatctgGTAAGAATTAAAACTGTATTCATGCACACTAGTCAGGCCACAAAATCTATATGGCTCCACTTTTGCATTTACACATGCTGTTTAAATGTCACAGGGTCTCTGCTTGTCAGATAACATCTTTCCTTTCCATAGAAGCATCTAAGCTGGCCTGGGCACAGTAAATGCATTTACATGCCcatacgtaatcagattactgcagtTCTCATTATTCATGTAGTCATGTAAGCACCATTTTTAAGGTCCAAAaggaatgtaagaaatgtaatttcttatttgtttatacTATTCA
>XM_007228549.3
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>XM_007228550.3
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Function


symbol description
slc25a44a Predicted to enable branched-chain amino acid transmembrane transporter activity. Predicted to act upstream of or within branched-chain amino acid catabolic process and transmembrane transport. Predicted to be located in membrane and mitochondrion. Predicted to be integral component of membrane. Orthologous to human SLC25A44 (solute carrier family 25 member 44).
slc25a44 Predicted to enable branched-chain amino acid transmembrane transporter activity. Involved in branched-chain amino acid catabolic process. Predicted to be located in mitochondrion.

NR:

description
solute carrier family 25 member 44

GO:

id name namespace
GO:0055085 transmembrane transport biological_process
GO:0016021 integral component of membrane cellular_component

KEGG:

id description
K15121 SLC25A44; solute carrier family 25, member 44

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU90079 False 1153 lncRNA 0.45 3 25518688 25530346
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XM_007228550.3 False 4095 mRNA 0.40 4 25516515 25530161

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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LOC103041081 rbpms2,rbpms2a,LOC107381790,LOC103368877,LOC108275203,LOC107560016,LOC107738652,LOC107680137,LOC107086560 other upstream 2590280 28121260 ~ 28132788 (-)
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G67755 NA other upstream 5271730 30802710 ~ 30805567 (-)

Expression



Co-expression Network