LOC103038884 (pacsin2,LOC103038884,LOC108279716)


Basic Information

Item Value
gene id LOC103038884
gene name pacsin2,LOC103038884,LOC108279716
gene type coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035903.1
NCBI id CM008306.1
chromosome length 40813162
location 8464126 ~ 8496393 (-)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

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Function

symbol description
pacsin2 Predicted to enable phospholipid binding activity. Acts upstream of or within cilium assembly. Predicted to be located in caveola; endosome; and ruffle membrane. Predicted to be active in endosome and plasma membrane. Is expressed in several structures, including anterior axial hypoblast; axial mesoderm; axis; hatching gland; and notochord. Orthologous to human PACSIN2 (protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 2).

NR:

description
protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2 isoform X2

GO: NA

KEGG:

id description
K20123 PACSIN; protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein

RNA

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Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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Expression


Co-expression Network