LOC103040407


Basic Information

Item Value
gene id LOC103040407
gene name NA
gene type coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035903.1
NCBI id CM008306.1
chromosome length 40813162
location 21823896 ~ 21877702 (-)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>XM_022671522.1
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>XM_022671524.1
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_022671522.1 True 2722 mRNA 0.37 9 21823896 21877702
XM_022671523.1 False 1905 mRNA 0.39 10 21823896 21877702
XM_022671524.1 False 2656 mRNA 0.37 8 21823896 21877702

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
mrps10 NA coding downstream 5748 21809285 ~ 21818148 (-)
LOC103044186 NA coding downstream 437437 21374232 ~ 21386459 (-)
nav3 nav3 coding downstream 467388 20983152 ~ 21356508 (-)
syt1 syt1,syt1a,LOC107694178,LOC107755909 coding downstream 1013185 20522855 ~ 20810711 (-)
myf6 myf6 coding downstream 1618241 20202098 ~ 20205655 (-)
LOC103040999 LOC103040999 coding upstream 88275 21965977 ~ 21970642 (-)
LOC111192879 NA coding upstream 111553 21989255 ~ 21990070 (-)
cog5 cog5,LOC107583928,LOC107656447,LOC107658957 coding upstream 371185 22248887 ~ 22273098 (-)
LOC103043373 LOC108435080,LOC108279430,LOC107729145,LOC107656392,LOC107590530,LOC107583931,LOC107708018,LOC107658953 coding upstream 427503 22305205 ~ 22352523 (-)
pde3a pde3a,LOC107707962 coding upstream 485452 22363154 ~ 22401341 (-)
G65828 NA non-coding downstream 51156 21772445 ~ 21772740 (-)
G65806 NA non-coding downstream 94640 21661338 ~ 21729256 (-)
G65935 NA non-coding upstream 21469 21899171 ~ 21928133 (-)
G65928 tmem19,LOC107687559,LOC107758202,LOC107719866,LOC107671498 non-coding upstream 27544 21905246 ~ 21910490 (-)
G65948 rab21,zgc:154045,LOC106609839,LOC107690748,LOC107687573 non-coding upstream 55122 21932824 ~ 21956269 (-)
G65962 NA non-coding upstream 74677 21952379 ~ 21953951 (-)
G65949 NA non-coding upstream 79792 21957494 ~ 21958918 (-)
G65803 gen1 other downstream 139068 21629958 ~ 21684828 (-)
ost4 NA other downstream 249697 21545418 ~ 21574199 (-)
llph llph other downstream 2024294 19795154 ~ 19799602 (-)
ndufb2 ndufb2 other downstream 2218171 19600214 ~ 19605725 (-)
cdr2l cdr2l,LOC107665638,LOC107743016 other downstream 2453188 19305987 ~ 19370708 (-)
G66081 bcap29 other upstream 412983 22290685 ~ 22291682 (-)
dusp16 dusp16 other upstream 1175571 23053273 ~ 23160179 (-)
G66619 NA other upstream 2630132 24507834 ~ 24508281 (-)
G66642 NA other upstream 2782322 24660024 ~ 24661902 (-)
LOC103036580 slc25a44,slc25a44a,LOC108432728,LOC108274961,LOC107673271,LOC107727505,LOC107562286,LOC107738649,LOC107680149 other upstream 3638813 25516515 ~ 25530980 (-)

Expression


Co-expression Network