h6pd (h6pd)


Basic Information

Item Value
gene id h6pd
gene name h6pd
gene type coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035909.1
NCBI id CM008312.1
chromosome length 44161018
location 29245281 ~ 29259083 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>XM_007253389.3
GGAAGCGCCTGTCATCAAAACGGCGCTCGCGCTGCCTGCCGTGCACGCTACAGACACAGACAGCACGCGGGGGACAGGCTAGCAGTTTGCTTTCAGAATGTGGAGGGTAACGTGGTTGCTGCTACTGGCCACCACTGTTTGGCAGAGAGGCCACACCACAGAGGACGAGAATGCCCAAAGCCCTAGGCACGTGTCAGTGGTTATTGTGGGCAGCACAGGGGATCTGGCCAGAAAGTACCTTTGGCAAGGATTTTTCCGTCTTTATTCCAGTCAGGTTGGTAAGGGCTACACCTTCTCTTTCTACGGAGGAGGACTTTCTCCATCAGAAAAGGGAACCCCTCTGCTTTTTGAAATCCTGAAGGAACTTAAGTGCCCACCTGAGCTCGCCGCTGAGCGCTGTGCTCTGGTTAAAGAGCAGTTCTTACGACTTTCTCAGTACATCCAGCTCAAGACTGTGGAGGATTATGAGAAGCTCAGTCAGCAGATCGAGCAGCAGCTGAAGCAGGAGGATATGGTGGAGGCTGGTCGGCTCTTTTACCTGTCTGTCCCTGCCTTCGCCTATGCTGACGTCTCATCAAAGATTAACAGCACCTGCCGGCCCCCAGCTGAGGCTTGGTTCAGGGTTGTGCTAGAAAAGCCATTTGGTCACGATTTTGAAAGCGCCCAGCTTCTCGCAGCACAGCTGGCTGGATTTCTTAAGGAGGAGGAGATGTACAGGATTGACCACTACTTGGGGAAAGAggtTGTCGCCCAGATTTTGTCCTTTAGAAAGAAGAATAGTAATTTTCTAGAGCCAATTTGGAACAGACATCACATTGAGAGAATAGAGATTGTGCTGAAGGAAACACTGGTCTGCAAAGGACGAATTCAGTTCTACGACCAGTATGGAGTTATTAGAGATGTTCTTCAGAACCACCTTACAGAAGTCCTGACCCTTTTAATGATGAAAATACCTGCTAACCTTTCCAACAGTGAAGAGGTCCTAAAGAACAAGTTAAATGTATTTAGTTTTCTTGCACCTCTTGGGAGGAACAGCGTGGTTGTAGGTCAGTACCAGAAATATACTGAAGAGGTTCAGGAGGAACTTAATAAAACCAAGGATTATTTCAGCAGAACTCCAACTTTTGCTGGTGTAGGCATTTTTACTGACAGTCCTCAGTATGATGGCATTCCTATATTTATGACCTCGGGTAAGATGCTTGATGAACGGGTTGGGTATGCTCggattctttttaaaaatgacataTTTTGCGTTCAGGACTACAGTCATGTCAGCTGCAAACCCAAACAGATTGTGTTCCACCTGGGTCATGGAGCGCTGGACTATCCAGCAATTCTTGTCAGCAAAAATTTGTTCAAGCCTTCTCTGGTGAGCAGTGTTTGGAGAGAAGTTACAGAGCATAAAGATATCAGTGTGTTGGGATTACCACTCTCAGACTATTACATCCAGACCCCGGTTGCACCTAAAGAAGCTTATTATGTGCTGATTAATAAAGTCTTACATGGACGCAAAGACAGTTTTATCAGTGCTGACAACCTCCTGGCCTCCTGGGCTTTCTGGACGCCGCTATTGGACAGTCTGGTTCAGGCCTTCCCTAGGCCATACCCGGGGGGTGCTGCCAATGGAGACCTATTGAACTTCCAGCTGCGGGGTCGGGAGCTTGCTTACGTCAACGAGGCGGTGGTGAATGTGATCCAACAAGGCCAAGACGAGAACTTCCAGGTCATGCAAGGGAAGTTCCGCGGTGCTGAAATGGTGTCAGCCTGGGCAAAGGAACTGGTGGAGCGCTTGgcctccgacctgcaaagcatAGCAGAAGAGGTCATACAGGATGAGGGTCAGTTCCATCTGGTGCTGTCTGGTGGCTCCAGTCCTATTGCACTGTTTCTTCAGCTGGCTCTGCACCACTATACCTTTCCATGGCACCAGACTCACGTGTGGCTGGCTGATGAGCGCTGTGTACCGACAACTGATGCGGGATCCAACTTCCGCACTATTTATGAGCAGCTGCTTCAGCACGTACGCATTCCATACTTCAACATCCATCCAATGCCAGTGCAGCTCAATCAGCGCTTGTGTGttgaggaagatggaggagctCTCCTCTATGAGAAGGAAATCAACCAGCACGTCAATGCCTCCAGCTTCCACTATGTACTGCTAGGTGTAGGGCAGGACGGCCACACCGCCTCACTGTTCCAGGACAGCAAGCTGGATGAGACTGGGGAAAGACTGGTAACCCTCACCGAAAGTCCAGTCAAACCCCACCAGCGCATGAGCCTCACTTTCACTGCCATCAACAAAGCCCGCAGGGTGGGGGTTCTAGTGATGGGGAAGAGAAAGCACGAGCTCGTCACTCAGCTGAGCCGAATTAAAGGTGAATCAGCCAAGTATCCAATCACAAAGGTACGGCCAACAGATGGCAGTCTAATGTGGTATATAGACTATGATGCACTTTTAGGGTAAGAGTTAccgtatttaaaaaaagaaaattgatcaAGGATCTTGAGTTTTACtcaaaacacatactgtataaatcTAACTACGGGATTGTTTGATTATTTGCTGGAATCAGTTGGATACTTAAATCAGAAATTGATTGCTGAATTGTGACTATGTTTGTATGGGAAAGAGTTTGCTTCTGCAAATCAGTTGATTGGATAATTGCATATCGTCGCTTTCCAAtggaaaacaagtatctccatttttttacataacttGAACACACCAACTGTGTCTTAAACTGTGcttcttgataaatggaccaacagatattttccaaaatgacctaaacttttttacattgacttccattaaaagtttggttagttttctctcttttctgtaaagttgcttttttttGGAGACACATGTTtatcattggacagcgacagtATGGTCTTACTGCATTTGAAGAATTGTACAGTATTTAATGTATTGGGATAATATGGGACGGATCGTATGACTTATGAAAGAAAACCTACTGAGCCACACAGTTTGTAAACTCAAACTAAACTATGTGACATGAAGAAAATTAGatagtttatattattttcagGGATGATGTGAAGTATCATAATTAGCTGTGCTAATTGTATAGATAAAAATATGAtgtatatgaaaaatatataagaaaaatatcTGGGCACAGATCTTGGTGCTCACTTTTAAAAGTACCTGGCcaatcaaaaacacaattacTGTACATGATTAGGTTAAATTATGGTGATATTAATATGGATAGAACAATACCACATTAGACGTTTAATTGAGTTTCAGGTTAATTcagagtttttttatattaatgccAGTGAGAGAGGTCAGatgtgatttttagtttacagtTGTTTTAGGTTTCAGATGCAGGGAAACgttgatttaacactgtgaATATAATTTTGCTAAAttaatactgtaatgtactaaaacaaaatacagtattttgatCATGTAAAAGCTCTTAATACTTTATGGAGggaaggaaatatatatttttaaatacacaggTATTATCAACAGAagtaaaaaatgtcttaaataatattaatcaatCATCTGATCTACTGGAATCCAGATGATTTATTCTTTAATGTGTGCCTGTAATCATTTTTAGGTTGGGTGGTCTGAATATGTACATAAAGGTACATTCTGCTCATATAatgttacagtatatacaggTTCATCTCTGGATTTAAGAGAGGCGATATATAAAAGCATTGTGCCACTGCCACAGTTGTAAATCCAGTATCATAATCAGCATTATAATTATGTGGTACTTATGTGCTAGTTATACCTGTCACAAAGTAAACATATAGGTATGGTTCTTGGTAAAGTAATTTTGTACCGTTTCTGCTGGTGCATTTGTCATTAAAAATtcacatatacagtaaatgcaagagaaaaaagtcaaaaacataaaaaaaaatcacgctTTTCTTctgataattataatttaaacatgcttagttctgtgtaaaatgttctaaaaaggAATTTAAGTAATATTGACTAAATTGATTTGTTTATAAATTTGTTCACCTGTGCATAATGTGTTTTAACAGCACTtacattacagtaaatattaataaactactggtaattaaccatttaaaaaGCTGTCATTAGGGAAGCCCAGTATTTCCAGTTGTCATCAGACACTAGAAGTTATTCTAGTCAATCTAGTAAGTCAGGTTGTTTGCTGGTGGAACTGAAGAAATCTGTACAAAACAATCAGGAACAAAACCAAAATATAAAGAATGAGAAACACttattttacactgtatatgtaacatttaattAGCAAAAACACAGGTAGGTTTACAAATTGATTTgctaatacacacacttacacaaaggGGTGTATACATGGTATTCAAAATAAGGTTATCTGTAGctaaaaaatcaactaaaaaaacttaatttacttaaattattagCACCATGCCCAATACCAGGTGAATGCTagaagggtaaaaaaaaaacagcattgagctgtagagAAATGTaactgtgggatgatggtgctccatctacTGAGGATGAGGTGGGTGATGATCATCCCGTATTTAAACCTCACTGCCACTCTTTACAGTAAATGCAATCCTGTCCTTACAGACATTTAATCAATGTAATCCAACAAGAGCAGCATACAGTCATTTTAATTTCCATAATTTCATCCAGACATTCCAAAACTGAGCCAGTGTAAACAACTCATACCTCACAAAAAGTGTCTTACTGTTATCTGTGACTGAATCATGGACTGAATAACAGCACATATACCTTGCAATACTATGCATTCATATAAATTACATCAGTTCATTCCATAGTACAAATTTATGCAAATGTGCATACTGTAGtggctataaaataaatacatttgtggCTATA
>XM_022675645.1
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Function

symbol description
h6pd Predicted to enable 6-phosphogluconolactonase activity; NADP binding activity; and glucose-6-phosphate dehydrogenase activity. Predicted to act upstream of or within glucose metabolic process and pentose-phosphate shunt. Human ortholog(s) of this gene implicated in cortisone reductase deficiency; cortisone reductase deficiency 1; and multiple sclerosis. Orthologous to human H6PD (hexose-6-phosphate dehydrogenase/glucose 1-dehydrogenase).

NR:

description
GDH/6PGL endoplasmic bifunctional protein-like

GO: NA

KEGG:

id description
K13937 H6PD; hexose-6-phosphate dehydrogenase

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_007253389.3 True 4888 mRNA 0.41 5 29245281 29259083
XM_022675645.1 False 4874 mRNA 0.40 6 29245335 29259083

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
shmt2 shmt2,LOC103359782,LOC106515133 coding upstream 113218 29090843 ~ 29132063 (+)
nxph4 nxph4 coding upstream 159837 28994206 ~ 29085444 (+)
stac3 stac3 coding upstream 380498 28849141 ~ 28864783 (+)
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arhgap9 arhgap9 coding upstream 655791 28517631 ~ 28589490 (+)
rbp7 rbp7,LOC107713528,LOC107666991,LOC107555975,LOC107708738 coding downstream 8623 29267706 ~ 29271449 (+)
c13h3orf67 NA coding downstream 300648 29559731 ~ 29609556 (+)
LOC103032776 NA coding downstream 361277 29620360 ~ 29630245 (+)
LOC111193761 LOC108427564 coding downstream 371842 29630925 ~ 29638287 (+)
LOC103043238 pbrm1l,LOC108427561 coding downstream 423567 29682650 ~ 29697639 (+)
G114402 NA non-coding upstream 259642 28931924 ~ 28985639 (+)
G114405 NA non-coding upstream 267823 28976831 ~ 28977458 (+)
G114400 NA non-coding upstream 313685 28931350 ~ 28931596 (+)
G114399 NA non-coding upstream 318464 28926415 ~ 28926817 (+)
G114392 NA non-coding upstream 364426 28877249 ~ 28880855 (+)
G114439 tardbp,LOC108427558,LOC105025427 non-coding downstream 22375 29281458 ~ 29282414 (+)
G114474 NA non-coding downstream 198944 29458027 ~ 29557691 (+)
G114475 NA non-coding downstream 215763 29474846 ~ 29475567 (+)
G114480 NA non-coding downstream 262724 29521807 ~ 29599080 (+)
G114623 NA non-coding downstream 574113 29833196 ~ 29833502 (+)
LOC103037845 necab3,LOC108431835,LOC108271560,LOC107666033,LOC107553901,LOC107740282,LOC107587636,LOC107744391 other upstream 1755759 27391014 ~ 27489522 (+)
G113979 snrpb,LOC101173217 other upstream 1892837 27347449 ~ 27352444 (+)
ube2o ube2o other upstream 3848298 25342153 ~ 25396983 (+)
G113642 acox1 other upstream 3983060 25261386 ~ 25262221 (+)
LOC103030782 NA other upstream 3991151 25250384 ~ 25254130 (+)
LOC111193669 NA other downstream 623288 29882371 ~ 29887978 (+)
G114698 NA other downstream 867252 30126335 ~ 30129896 (+)
G114841 NA other downstream 1591226 30850309 ~ 30880553 (+)
G115024 ngf,LOC103031633,LOC105909845 other downstream 2634202 31893285 ~ 31894351 (+)
LOC103031324 kcna3a,LOC108427600,LOC108271529,LOC107729772,LOC107666172,LOC107708155,LOC107554199,LOC107685799 other downstream 2693931 31953014 ~ 31962885 (+)

Expression


Co-expression Network