c13h1orf210


Basic Information

Item Value
gene id c13h1orf210
gene name NA
gene type coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035909.1
NCBI id CM008312.1
chromosome length 44161018
location 41251017 ~ 41260579 (-)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>XM_015608133.2
TTGCACAACATGCCTCCATTTTCGTCCTGTGAAAGACTGTACAACACAGTGCACATGTTTTCCAAATCCTAAAATGTGACAACTGGAGAGATTAAAAGCTACACTCCAACATCTTTACAGGAACATAAGAACCAAAGCTCAGGAAACAGCAGAGCATGGGGCCGGTAGCTCACACTCTGTGTGTGCTCATCACCCTCTGGGCCTCAGGTTTATGCCATACACTCCAAACTGTGGGCCCTTGTGTGGTCGACAGAGAGAAGACTGCGTTTGACTGCAGCAGACGAAAGCTCACATCAGTTCCAGAACAGATATGGAAGAACGTGACTGAGCTTGATCTCTCAGGGAATTACTTAAACCTAGCCCAAACCAAAGGTCTCAAGGAGCATCCAAGCTTTGACCATTTGATTACACTCAATCTTTCAGGAAACTACCTCCCCCTACTGGGGAAGAAGCACTTTTACCCTCTCCCATCTCTgcaaatactggatctcagtgGATGCAAGCTGGCTGCAGTTGAGACTGATGCCCTGTTGAGCTTCCCCAGCTTGAAAAAGCTATTTCTGGGCAATAATAACCTACAGACACCTCTACCTGCTGCACTACAAGACCATGGACAGATTGAGTTGGTAGATGTCACATACAAAGTTCATGGAACTATGGCCCAGGAAAGACACTCcaatgGACATGCTTTTAACATGATCATCCAAAGTAAGGTGCAACGGAAACTGCTGGCAGCAAACACAACAGGCAATGATACAGTCACTGACAACAATGGGCACAGTTCCTCAGGCGGGTGGAAACCCCTTGTTGCTGTTTTGGTGACAGCCATTGTTGTCTCCATCCTTATCGCTGTGGGTGCAAAATGTAAAGTTGTGCGCAAGTATTTGGCCAGCTATAGGCACTCAAGGCTGAGCGAAACGGACACAACCAGCCACTGCGACCCCGGTAGTTTTGAGGTGGGCTTCTCCACTCAGGGCCCCTCAGGCAGGGGACCACATGCAGTTCCTGCCGAAGGGGACGAGatggaggaggatgatgatgggTTTATTGAGGACAATTATATTCAGGCCAGTGAGAGGGAGCGAGCAGAAAGAGAGGTACACACATGGGAACACGAAGAAGACGAcgaagatgaagaagaggatGAGATAGAATTCACTATTGGATAGTTAAATGAGAAGTTTGTGAAGATTGGGCCACAACTAGTAGCAGCAACTTAACAACTTAgttttttggaagaaaatggAAACAGCAGTGGACTTTTTTTCATAaagattatttatgatttaatgATTCTCCTACTTTACATATATTACGTTTGTATGTACTGCTgtgttctctctcctctctctctatgatacaattaacttaacatttaatttaaaaataagtaaattggGTTTGAAGAGGAATTCCATGGaatatgtattgtgtttttcttgTATAAAATGGTTATGTTTGGTCATGTTACCTTAGAACAGCGGTTTTGATATGTGTTCTACTGGTGGTGCACAAAGCATTCCCAAGGTGGTACACTTAATGGCATCAGAAAATTCTCTGCATACACTACAACATTAACACATCACATTTGCACATGTGATTCAGTGAAATGATCAGTAGGTGCTACTTGAAAGTTTTAGTTTGATCCTGGTTGGTACATGACCTACAAACTTTGAGAACTACTGTATTCAAGGAGGTCAATGATTCCTGGTCCTTGTCATAAGCTATTTAGGCCTTCCCAACACACCATAACCAGCTGATGAAAAGCTGGAAtgtcaaaacatgaaaaaatgtgTAGGACTAGGTACTCCAGTTCCAGGACTGGGAATAAGTGTGTAATAGTAGccacttgttttttgtttttgcatattGTATTGTGCAGTttgtttatgttgtatttaacaTCTTTTAAAAGTACGATAtggcaaaaaatacaaattaaaatttaaaatgagtTAACCAGACCTCACTGTTAGCCATATGGCTTGATCAATTTGTAAAATTTCAAATGTCAGGCATAGACATGTAATAATGGCTTGATAAAGTTGTTTTaaccttaataaaataaaatttgtttttGTACA
>XM_022675838.1
TTGCACAACATGCCTCCATTTTCGTCCTGTGAAAGACTGTACAACACAGTGCACATGTTTTCCAAATCCTAAAATGTGACAACTGGAGAGATTAAAAGCTACACTCCAACATCTTTACAGGAACATAAGAACCAAAGCTCAGtGGTACTTCCTGGAAAAATgcagGAAACAGCAGAGCATGGGGCCGGTAGCTCACACTCTGTGTGTGCTCATCACCCTCTGGGCCTCAGGTTTATGCCATACACTCCAAACTGTGGGCCCTTGTGTGGTCGACAGAGAGAAGACTGCGTTTGACTGCAGCAGACGAAAGCTCACATCAGTTCCAGAACAGATATGGAAGAACGTGACTGAGCTTGATCTCTCAGGGAATTACTTAAACCTAGCCCAAACCAAAGGTCTCAAGGAGCATCCAAGCTTTGACCATTTGATTACACTCAATCTTTCAGGAAACTACCTCCCCCTACTGGGGAAGAAGCACTTTTACCCTCTCCCATCTCTgcaaatactggatctcagtgGATGCAAGCTGGCTGCAGTTGAGACTGATGCCCTGTTGAGCTTCCCCAGCTTGAAAAAGCTATTTCTGGGCAATAATAACCTACAGACACCTCTACCTGCTGCACTACAAGACCATGGACAGATTGAGTTGGTAGATGTCACATACAAAGTTCATGGAACTATGGCCCAGGAAAGACACTCcaatgGACATGCTTTTAACATGATCATCCAAAGTAAGGTGCAACGGAAACTGCTGGCAGCAAACACAACAGGCAATGATACAGTCACTGACAACAATGGGCACAGTTCCTCAGGCGGGTGGAAACCCCTTGTTGCTGTTTTGGTGACAGCCATTGTTGTCTCCATCCTTATCGCTGTGGGTGCAAAATGTAAAGTTGTGCGCAAGTATTTGGCCAGCTATAGGCACTCAAGGCTGAGCGAAACGGACACAACCAGCCACTGCGACCCCGGTAGTTTTGAGGTGGGCTTCTCCACTCAGGGCCCCTCAGGCAGGGGACCACATGCAGTTCCTGCCGAAGGGGACGAGatggaggaggatgatgatgggTTTATTGAGGACAATTATATTCAGGCCAGTGAGAGGGAGCGAGCAGAAAGAGAGGTACACACATGGGAACACGAAGAAGACGAcgaagatgaagaagaggatGAGATAGAATTCACTATTGGATAGTTAAATGAGAAGTTTGTGAAGATTGGGCCACAACTAGTAGCAGCAACTTAACAACTTAgttttttggaagaaaatggAAACAGCAGTGGACTTTTTTTCATAaagattatttatgatttaatgATTCTCCTACTTTACATATATTACGTTTGTATGTACTGCTgtgttctctctcctctctctctatgatacaattaacttaacatttaatttaaaaataagtaaattggGTTTGAAGAGGAATTCCATGGaatatgtattgtgtttttcttgTATAAAATGGTTATGTTTGGTCATGTTACCTTAGAACAGCGGTTTTGATATGTGTTCTACTGGTGGTGCACAAAGCATTCCCAAGGTGGTACACTTAATGGCATCAGAAAATTCTCTGCATACACTACAACATTAACACATCACATTTGCACATGTGATTCAGTGAAATGATCAGTAGGTGCTACTTGAAAGTTTTAGTTTGATCCTGGTTGGTACATGACCTACAAACTTTGAGAACTACTGTATTCAAGGAGGTCAATGATTCCTGGTCCTTGTCATAAGCTATTTAGGCCTTCCCAACACACCATAACCAGCTGATGAAAAGCTGGAAtgtcaaaacatgaaaaaatgtgTAGGACTAGGTACTCCAGTTCCAGGACTGGGAATAAGTGTGTAATAGTAGccacttgttttttgtttttgcatattGTATTGTGCAGTttgtttatgttgtatttaacaTCTTTTAAAAGTACGATAtggcaaaaaatacaaattaaaatttaaaatgagtTAACCAGACCTCACTGTTAGCCATATGGCTTGATCAATTTGTAAAATTTCAAATGTCAGGCATAGACATGTAATAATGGCTTGATAAAGTTGTTTTaaccttaataaaataaaatttgtttttGTACAA
>XM_022675839.1
AGATGGcatcatatctctctctctctttgctgaTGTTGCTCATAGTGTGTTAACTACAAACACGTTGGGCTCCATTAACCCCTATGAGTCTTTATGTTGTCTTTTTAAACCACCACAATAAAcacaaggtaggtaggtaggctgTACTATGTCACTTTAACTACAGACATAAGGAAGTTGGGCTAACACACTGCTGGATTTACGAATAAAAGGTTAGGAATTTTGTTTCTGAATACACTGCAGTTGGGGAAAGGTGGGGAAAGGAAACAGCAGAGCATGGGGCCGGTAGCTCACACTCTGTGTGTGCTCATCACCCTCTGGGCCTCAGGTTTATGCCATACACTCCAAACTGTGGGCCCTTGTGTGGTCGACAGAGAGAAGACTGCGTTTGACTGCAGCAGACGAAAGCTCACATCAGTTCCAGAACAGATATGGAAGAACGTGACTGAGCTTGATCTCTCAGGGAATTACTTAAACCTAGCCCAAACCAAAGGTCTCAAGGAGCATCCAAGCTTTGACCATTTGATTACACTCAATCTTTCAGGAAACTACCTCCCCCTACTGGGGAAGAAGCACTTTTACCCTCTCCCATCTCTgcaaatactggatctcagtgGATGCAAGCTGGCTGCAGTTGAGACTGATGCCCTGTTGAGCTTCCCCAGCTTGAAAAAGCTATTTCTGGGCAATAATAACCTACAGACACCTCTACCTGCTGCACTACAAGACCATGGACAGATTGAGTTGGTAGATGTCACATACAAAGTTCATGGAACTATGGCCCAGGAAAGACACTCcaatgGACATGCTTTTAACATGATCATCCAAAGTAAGGTGCAACGGAAACTGCTGGCAGCAAACACAACAGGCAATGATACAGTCACTGACAACAATGGGCACAGTTCCTCAGGCGGGTGGAAACCCCTTGTTGCTGTTTTGGTGACAGCCATTGTTGTCTCCATCCTTATCGCTGTGGGTGCAAAATGTAAAGTTGTGCGCAAGTATTTGGCCAGCTATAGGCACTCAAGGCTGAGCGAAACGGACACAACCAGCCACTGCGACCCCGGTAGTTTTGAGGTGGGCTTCTCCACTCAGGGCCCCTCAGGCAGGGGACCACATGCAGTTCCTGCCGAAGGGGACGAGatggaggaggatgatgatgggTTTATTGAGGACAATTATATTCAGGCCAGTGAGAGGGAGCGAGCAGAAAGAGAGGTACACACATGGGAACACGAAGAAGACGAcgaagatgaagaagaggatGAGATAGAATTCACTATTGGATAGTTAAATGAGAAGTTTGTGAAGATTGGGCCACAACTAGTAGCAGCAACTTAACAACTTAgttttttggaagaaaatggAAACAGCAGTGGACTTTTTTTCATAaagattatttatgatttaatgATTCTCCTACTTTACATATATTACGTTTGTATGTACTGCTgtgttctctctcctctctctctatgatacaattaacttaacatttaatttaaaaataagtaaattggGTTTGAAGAGGAATTCCATGGaatatgtattgtgtttttcttgTATAAAATGGTTATGTTTGGTCATGTTACCTTAGAACAGCGGTTTTGATATGTGTTCTACTGGTGGTGCACAAAGCATTCCCAAGGTGGTACACTTAATGGCATCAGAAAATTCTCTGCATACACTACAACATTAACACATCACATTTGCACATGTGATTCAGTGAAATGATCAGTAGGTGCTACTTGAAAGTTTTAGTTTGATCCTGGTTGGTACATGACCTACAAACTTTGAGAACTACTGTATTCAAGGAGGTCAATGATTCCTGGTCCTTGTCATAAGCTATTTAGGCCTTCCCAACACACCATAACCAGCTGATGAAAAGCTGGAAtgtcaaaacatgaaaaaatgtgTAGGACTAGGTACTCCAGTTCCAGGACTGGGAATAAGTGTGTAATAGTAGccacttgttttttgtttttgcatattGTATTGTGCAGTttgtttatgttgtatttaacaTCTTTTAAAAGTACGATAtggcaaaaaatacaaattaaaatttaaaatgagtTAACCAGACCTCACTGTTAGCCATATGGCTTGATCAATTTGTAAAATTTCAAATGTCAGGCATAGACATGTAATAATGGCTTGATAAAGTTGTTTTaaccttaataaaataaaatttgtttttGTACAA

Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko04146 Peroxisome

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_015608133.2 False 2084 mRNA 0.42 5 41251018 41260579
XM_022675838.1 False 2108 mRNA 0.42 6 41251017 41260579
XM_022675839.1 True 2206 mRNA 0.41 5 41251017 41259970

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC103032504 ap1m3,LOC108441657,LOC107724146,LOC107684323,LOC108271949,LOC107692442,LOC106528254 coding downstream 1406 41224841 ~ 41249611 (-)
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LOC103034527 NA other downstream 481335 40731296 ~ 40769682 (-)
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Expression


Co-expression Network