LOC103044613


Basic Information

Item Value
gene id LOC103044613
gene name NA
gene type coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035909.1
NCBI id CM008312.1
chromosome length 44161018
location 37131574 ~ 37159320 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

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GCGTTGTTAAGCTGTGTTATCTCTATTTAAGTgttgatctattttttttctacttaatTGGGCTTTGTAAACAACTTACAAACAAGTTTCTATATGATAAAATGCcagctagtgttttttttttcacagagagCGACAGCTGTAGGGCTGTGCTTGGTTATTTGTTGTTCATTTCGAAGTATTTATTGTTTAGCTATTTCATtctatactgatttttttttttgttgttggtatgttgttttttatttttgtagtttgtttgtAGTTTTAACACACATTTTGTAAATACCCCAAAGAATGTTGGAAGAACTTACTGCTAAACTGTGTAGCTTCCgtgtactcacacacacagcgaaATAAAAACTACAACATTTTTACCCTGTGTATCTGAATTACATTTATTAGAATAAAGCGAGCACCGGAAACTCCCACCTTTATTACTATAAACTTCGCCCCCGCGCTGCGATTGGCTGCTGTTAACTCGTCTCTTGCGCTGTGATTGGTTGTTCTGCAGTTCGTTCTCCTCTTGAGTGAGGATGATTAGCTAATCTGTGGTGAATAGTGCTGCAGTCTGTCGGAATACAAGTGGAGAAAATAGTTCCTCAGCGAGTCTGAGAGAGTCTGAGGAACTGAAGAGCCGCAGCTGGAGCTCCGGAGCTGAGCACGTGCATGGTGTGATCCACAGTCAGCTCCAAGGTGGTCTATGTTAGCAAACGCTGTAGTGACTCATGTTCAGCCTGCAGAGACAGATGTTTGAGCAGCACCTGAGGATGGAGGGAGCGAGGGAGAGGGGGAAAGAgggggaagaaagagagaaagagagacaggcaCTTAAGCAGCTTTGGGATAAAGGGAAGAGCCAATACAGTGCTGTAGCCAGTCCTTGGGTAAAACAGAAGCTGCGTCAGTTGATCAAACAGAAGAACGAACAAGCGGAGTCCAACTTCAGCAGCATCCCCACAGGCTTCAGGAATCTGACTCCTATTCCCGACCTGAACTTTCAACATCTTCAACAGAACTCTTCCTCATCTCTAATCTATGGAAGCGACCGGTTACGGAGAACAcacTCGGAGCCCCTCATCAAGCTGAAGCTTAGGAGGAGCATAAGTAACAGGAGGAATCCTCTCTGTCATAAATCAAGTGCTCCCCCTACAGTGTGCATTCCAGCATCTGAGTGCAGTTTACCCTCCAGTCAGTCAAACAGTGGATTGTTAGCCTGGAACTACACCGGAAAACAGTTCCACAAGAGTCAGAGTCATCTGGACTGTGGAATGATGGAGGGTACCCCCATGCAACCCTCTACATATTTGTATGTCACACCTGACCAGGAGACTCTGGGGGGTGCTTTCTCTTCTGCTGCACCCTCTTTTTACGTCTCGAATGATCCTAGATACCCTTCAGTCCTCACCAGTCCTCACCCACAGGTTCAACAAGTCCTGGTGGTAGGGCCAGAGAGGCCTCTGATCAGATCCAAGTCACAGCCAGCGTTTTTTATTACTCAATACTCTCCACCTCCATATATCTTCCGGTCCTACAGCAGCcaacggaaaaaaaaaaccagacAGACACAAGAGGGCGAGGCCGTTAAAAGTAAACATGGAGAACTGAAGGCGAAAGGCAAGATGAACTCTGGGCACTTGTTTAATGAAGAATATGTCCAAAACAATGAACAGCAGAGCAGTCTTAACTCCACTTCATACACAACTCCAGCCCGCCAGCAAAGGTCCTCTTTCAGACGAAATGCTGGCTTTCGTCACgcactgaaacacagagagatgtCTCGTAATTTGTGCATGGCTGATATTAAAGAGCCCTGTACAGAGAACTGTATCACAGGGGTGGTGTGTAACTCAGAGATGCAAAACACCCAGTGCACCTGTCGTGGCAGCAACCCTCCTTCTGACCTTACCAACAGTGTGTGGTCAAGACTGCAGAAATGTGGCCTTATAAAACAGTGTAAGAAAATCCCAGGGAGAAAAGCCACTACTCAGGAAATCCAGTCCGTTTATCAGGAGAACAGCAGTGTTCCTTACGGAACTAATCATCTCGGCCGTCTAAACCTGGCATCAGCGAAAATGGCAGCAGGCAGTGTGACTGAGCTGGTTCTGCGGGTGGCACAGGGAGAACTGAAGAATGGTTTTGCAATAGTTAAACCATGTGGTACTTCAGACTCGGAGTCAGGTTCCTTTAGTTCAGTAGCGATTGCTGCTAAACAGCTCCAGCACAGACTCTGTGACAAAAAGATTCTTATTGTTGACTGGGACATTCATCATGCTGAAATTGTTCAGAATGTTTTCTACACTGATCCCAAAGTTCTCTACATCTCACTTCACCGCAAAGATACACTCAGCCCTGCAAGAGGAGGACCCACTGACGTGGGGTCTGGTGATGCAGTGGGATTCAATGTTAACGTGCCCTGGTCAGATAAACTGGAGACAATAGGAGATGCTGAGTACCTGGCAGCTTTTAGGACTGTGGTTCTTCCAATTGGACGTCAGTTCTCCCCTGATGTGGTTCTTGTGTCATCTGAGTTTAATGCAGTTGATGGTCACCCAGCATCTTCTGGAGGACACAGAGTGTCTGCTAACTGTTTTGGATTTCTGACACAGAGACTGATGGACTTGGCCAAAGATGGAGTGGTTCTGGTATTAGAGGGAGGTCATGACATAATGGCCATATGTGATGCATCAGAAGCATGTGTTAAAGCTCTACTGAATTATAAGtttgtagCTCCGTCTGAAGATGTATTGAAGAAGAGGCCATGTGCTAAGGCTGTTCAGTGCCTTCAGAAAGTCTTACGCATTCAGAgtAAGTACTGGAGCTCAGTGAATGCTGAAGCTCATACGGtggatcagccgtggttttggGCTAGTGGAAGATGTTTTACAGACAGTGATGCTTCCTCAGCAATGGCCTCTCTCAGCATGTCTGAAGCCGACAGTAGCAGCAGTCAGTCACGCTTCTGTCATGGGCCGATGGAGCATGATGAGAATGAGACGTATTGATGGTGAAAAAAGCTGAAGATCAGAACCCGACAATTGAATGagggaaaagaagaagaaaaaagagctttctttttatctttcaaACTCCAccgttttggagtaactatAATTTTGGACCACAGATAACAACTATGcctgttttaaaatcataaaCAACTTTCactgcatattattattataaaataaaaacacacactgaaataaaatgttattatatactaatatataccAAATGTAGCACATCTACCTAGTTATAACTATAAGAGGTCTGTGTGATGAGTAAGTGAATTGGTCCTGAATGACTACAAGCACAAGTTCCATAAAGATCTGCAGAgttaaaagacaaaagacatcaaggattatatttactgtagtaACTCATATCAGATCGTCAGATATTAATGAAACCTGCTGAGTTTAAGCAACGGCAgatcttgtcagcagagcttcaatCAATatgttcttatttgaactgcGCAGTATgtcacagaaatctgtgtgggattTAGCTTTTAAATCTGCCCACCGCAGactcccccagtcccatttccacattCTTGGGTTGCCAAGAATAGagaaaacttgttttctttgcattatttgagaccTAAAAGCTCtgatatttgttatttcagccaattcttattttctgcaaataagtgctctaaatgactatttatttggaatttgggagaaatgttgtccgtagtttatagaataaaacaacaatgttcatttgactcaaacatctaccgataaatagcaaaatcagagaaattgacctggaaattgaagtggtctcttcattttatctatattaaatgtatgtatCTCAAAAATCAATGGATTGATGTCTAAAGATTTTGAAGACATTTCTGCCATAATACTGTCgctttttttcttaaaagctctttttaaactaaaaactaataCTTCTACATCTCAATTGTGGCCCCTgaatttctttttattctttttttgcttttaaataaGCTAAAATACTGAGTGCTGCACTTAAATTAATGTTGTTGCCAGTGTTTTATACTGAAACAGCCTTTGTATTACTTTTAGTTTATAGCATTTTACAGGTACTGACAAACACTTTTCAGTAGAGTAAACCTTAACATGTTTTCaggatgtttatatatatatattttttttgtagttatttTTGTGATTGTTTTTATTGCTCTTAATAGTAAAGCCTTCCCTGAAATGTAGATGCACATTCACTGAATAAAATCATGTTGGTATATACTGCTCTGTATTCTggaataaaatgtattgttaccaAGATGA
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

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Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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LOC103046153 eif4b,LOC108441049 coding upstream 81166 37041366 ~ 37050408 (+)
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LOC103045245 vdrb,LOC108272216,LOC107585146,LOC107673565,LOC107711077,LOC108441087 other upstream 10247 37100014 ~ 37121327 (+)
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G116103 prkcda,LOC103030273,LOC108440644,LOC107582675,LOC107667398,LOC107721176,LOC107673500,LOC107712078,LOC108271968 other upstream 1143514 35982119 ~ 35988060 (+)
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Expression


Co-expression Network