pum1 (pum1,LOC107593563)


Basic Information

Item Value
gene id pum1
gene name pum1,LOC107593563
gene type coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035919.1
NCBI id CM008322.1
chromosome length 38085671
location 29039371 ~ 29064155 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

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Function

symbol description
pum1 Enables mRNA binding activity. Involved in pole plasm mRNA localization. Predicted to be active in cytosol. Is expressed in ovary. Human ortholog(s) of this gene implicated in cerebellar ataxia type 47. Orthologous to human PUM1 (pumilio RNA binding family member 1).

NR:

description
pumilio homolog 1

GO:

id name namespace
GO:0003723 RNA binding molecular_function

KEGG:

id description
K17943 PUM; pumilio RNA-binding family

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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Expression


Co-expression Network