LOC103042153 (LOC108426616)


Basic Information

Item Value
gene id LOC103042153
gene name LOC108426616
gene type coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035919.1
NCBI id CM008322.1
chromosome length 38085671
location 29468749 ~ 29478259 (+)
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Sequence

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XM_007245704.3 False 3066 mRNA 0.45 12 29468763 29478259
XM_007245705.3 False 3041 mRNA 0.45 12 29468762 29478259
XM_007245706.3 False 3179 mRNA 0.45 11 29468749 29478259
XM_022683297.1 True 3214 mRNA 0.45 11 29468763 29478259
XM_022683298.1 False 2829 mRNA 0.45 11 29468762 29478259

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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syce1 syce1 coding upstream 66466 29397398 ~ 29402283 (+)
LOC103039490 NA coding upstream 76296 29372764 ~ 29392453 (+)
LOC103038962 NA coding upstream 98467 29309371 ~ 29370282 (+)
LOC103043706 NA coding downstream 866 29479125 ~ 29483741 (+)
LOC103044018 eef1a1l1,LOC103044018,LOC108426629,LOC100526699 coding downstream 17841 29496100 ~ 29500103 (+)
LOC103044302 eef1a1l2,LOC103044302,LOC108426655,LOC108256978,LOC108426629,LOC103044018,LOC107589444 coding downstream 22102 29500361 ~ 29507353 (+)
LOC103045125 NA coding downstream 33444 29511703 ~ 29517460 (+)
rpl11 rpl11 coding downstream 41274 29519533 ~ 29523870 (+)
G200780 ppt1,LOC107697049,LOC107706207,LOC107589449,LOC107591677 non-coding upstream 1222 29462161 ~ 29467527 (+)
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G200840 NA non-coding downstream 395251 29873510 ~ 29878401 (+)
G200341 LOC108426039 other upstream 1272551 28193574 ~ 28196198 (+)
LOC103032101 NA other upstream 1480854 27978282 ~ 27987895 (+)
G200235 NA other upstream 1650099 27815336 ~ 27818650 (+)
dync1i1 dync1i1,LOC107731605 other upstream 1728640 27634679 ~ 27740109 (+)
LOC103023645 gngt1,LOC103023645,LOC108257427,LOC103152523,LOC103362787,LOC107085869 other upstream 2163163 27304521 ~ 27305586 (+)
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eloa tceb3 other downstream 64489 29542748 ~ 29552884 (+)
rbm24 rbm24,rbm24a,LOC107754275,LOC107592929 other downstream 1531667 31009926 ~ 31084633 (+)
G201018 NA other downstream 1534452 31012711 ~ 31015045 (+)
G201207 NA other downstream 2463943 31942202 ~ 31987057 (+)

Expression


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