LOC103045472 (LOC108433148,LOC107727127,LOC107674682,LOC107745580,LOC799265,LOC105013234,LOC106607346)



Basic Information


Item Value
gene id LOC103045472
gene name LOC108433148,LOC107727127,LOC107674682,LOC107745580,LOC799265,LOC105013234,LOC106607346
gene type coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_035919.1
NCBI id CM008322.1
chromosome length 38085671
location 37010695 ~ 37025525 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence


>XM_022683398.1
TAGAAAGTTTGAAAGTTGTAGAGGAGGTTATTGAACGCGGCATTTTAGCTTATCCTCCACTTCTAGTTAACCTACATTTGTTTCTCAGTTTAGCGCAGTTTTAACAGGTTATACGGCTATTTTGAGAGCAAGTATAGGCTTGAAAAGcgattaaataacttttaaccaGGAGGATAAGTGTTTAATAAGCTGCAAAGGAAGCTGTGCTGCTGAGAAGCCACGCTGTTAGTCCAGTAACTGCAATGTTTACAGGTTTTGGGCTCAGTAGTAGTATAGACGCTCCAGCATTTCTGGCTTTCctgagctggagctgctgtAGTTTCCTgtagttttctgtagtttaggtCTGTGCTGTAGTTGTTTAAGACATTAATATTGAGCAGGATTCAGGATTTTGGACGCACATAAAGAGAAACAAGGATGTGTGACATCAGGACTTATAATGTGGTCATTCTGGGCATTGGATTTCTATTCATTTTCACTGCCTTCACCACCTGTGGCAATATAGAACAAACTGTGGTGAAAAGTCTGGACAATGCTACTTTTACTGGAAGTGGTTATCACAGCCTCGGGATTATATATGGAATTTTTTCATTTGCTAATTTATTAGCTCCCCCTGTTGTAACAGTAATCGGACCACGTTTTACAATGTTCTTCAGTGGAATTCTTTACAGTGGTTATATAGCTGTATTCATTAATCCATGGACCTGGTCCTTTTACTTCACCTCAGTGCTAATTGGTATCGGAGCAGCTCtgCTTTGGACAGCTCAAGGACACTTTCTGGTGGAGAACTCTGATGCCTCCACCATTAACAGGAACACTGGGTTGTTTTGGGCTTTGTTGCAGTGCAGtatgCTGTTTGGTAATCTCTATGTTTATTTAGACTGGAAAGGAAAATCTGAAATTTCAGATGGAGACAGGAGGATTATGTTTATTGCTCTGCTGGTCACCTCTGTAATCGGCACTCTGAGCTTCCTGATCCTGAGAAGATCACAGCAGCTGGAGGACGAGGTTCTGTCTGAGGAAGAGGGACGATCCTTATTGTCATCTAGGTTAATATATAAGCAGCGAGCCAACTCTGCTATAAATGATGCCAAAGCAGAATTCAagacTATTTTGCACCTTTTTGGGACAAAAACAATATTACTCCTTGCCTGTTGCATGGCATACAGTGGTCTGGAGCTCTCTTTTTACAGCGGTGTGTACGGAACTTGCATTGGAGCAACAAGTCAGTTCGGTGATGGAGCCAAAGCTTTGATTGGGATTTCAGGGATTGTGGTGGGATTTGGAGAAATAATTGGTGGGGGTCTGTTTGGGCTCATTTTGAAAAATAACCGGTTTCGGCGCACGTCAGTCGTCTTCCTCGGTATGGTGGTTCATTTTGTGGCCTTCTACCTGATCTTCCTCAACATACCAGATGATGCTCCAGTGGCGTTTAAAAGCAGCACGCAGGAGAAGCCTTATCTGTCACCAAGTGTCTCCATTGCTATGCTGTGCAGCTTCCTGCTTGGACTCGGAGACAGCTGCTTCAACACTCAGCTATACAGCATTCTGGGCAGAGTTTACACTGAGCAAAGCGCACCAGCCTTTGCCATCTTCAAGTTTATTCAGTCTATCTTTGCAGCAGTGGCTTTCTTCTACAGTGGCTACCTCCTGCTGACCTGGCAGCTCCTGATCATGGTCATCCTGGGCTTTATAGGCACCCTGTGCTTCTTCATGGTGGAGAGGATGCAGAATGTCTCGGCTGATTTGCCAGAATACTAGATCTTCTAgtaacataattattttttatacagggTGTTTGCAAGGCAAATGTATTTGGACTGTTTTCCGTAACCTGGGGAATCACCCTgtttcactctcacacactgcttcagTGACTCTTCTGTTCCTGAGCTCTTATGAAACACTAACTCATCAGAGCttcagctttattttatttgcattgatAATTTGCTAAAGGTGCTCTTTGTGTGGGATGCTTTTGACAAAACTCATCATTCCTGGGTTGGACTGTATGATCCATTATAATAATCAATTGCAAAACCatagaataattttaaatatcttttaaaaGTAGTATCTGTCAGTTTTAAAGGTGGCACATTTTTTTcaatcattatttttaactCAACACTAAAGATACTAGCACACAAATCAAGCACAAcaatatggtatggtatggctAATCAGGTatgtgaaaaaaattataatgccTTAGTTTTTTGTGCTTTGCCCCTAAATGTCTCAGGGTTCAGATCACTTCaagatacagtgttaaataaatttctatttttctcttctctaaaaataaaaacgtttggttatgCACGTTATCCATGTTGTAAAATGTAGGCCCCATCACGataactatttttaattttatttttatttttattactagtTTTGTTGTTCCAGAAATATTTGCGATAAAAAAGATTATTGTCATTATTGTCAAATGTCACGATATGACTTTTTAAGTGCAAAAAATGCAGTTctattaatttaaagaataataaatttaaattcacagacgcctcgtgctgattgacatcaccctaggagtgatgaggggaaagagcgccatctacccacccagagagagcaagcccaattatgctctctcagggctctggcagctgatggcaagctgcatgaccgggattcacaCCTGTGATCTCCCTTCattgtggcagcgctttagactttTGGACCACTTAGCGCCcctaattttttaatttttggaaatatatatagatggttaagttagaatattttaaaatatatcctaaatactctaaatgtaaataaaattataccaCTTAGCTCATTCACAATAATTAGTCTCCCTAATAATCatcttatttttacttaatgATAACTTAATAACATAACTATCATGACTGGCCTAATAAAATGCACTGCCTATATTGtacttattattgttattactttaaactacatttatatattttgcatacTATTATTTGAGTTGAGTAAcctgtattttattgttaattgttCTGATTAGAGTTTTAACATGCAAAAACGACTCAGATACACTCAGTTAAAAGGAcagtaaggtttttttttaccaaagacACACATATATGAGGGTTTTTAAAGGTATAAAAAAGATGGACCATGGCAATATATaggaagtagaagaagaaattTAGAGTGTCATATGTACAGtgtcatgccaaaagtcatgggacagtaaCTGGTCTCATGTAAAGAATGCTGTACTGGATGTGTGATATGTGGATATGTTGTTCCCTGAGAGAACAATTCATAATTCGTAGGCATActcttgtcccatgacttttggcatgtcagtgattttttttgcgcacagttaaaaaaaacataattcagtattttattgtttaagaaAATCCAGGGTTTTCAAAAATGTACAATACTTAAATAACCAGCATTAAAATTTCAGTGCTTAACTCGAAGTTGTATAATAACTATGCAATGATTAACAGTAATTAGTGTCTtgtgaatgtattttatttatatttactaataTACCAGCATTTCTCTGTTAGTATTCCAGCTGTATGATCTTGTTAACTGACAATCAATTGTATTGAGTTTAGTGTTTTATACATAATCATTTCAGTGAGGTAAAGTATATGCTGTATATGTGATGAACTGTATTTGTTGTATTGTGTATATGTTGTTTCCGTGCACTTTGTTTGTGTATTTCAGGTCCAAAGTTCAATAAAGAATCGCAAGTTATTGCAAGGTAA

Function


NR:

description
PREDICTED: UNC93-like protein MFSD11

GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_022683398.1 True 3761 mRNA 0.38 13 37010695 37025525

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
zc3h7a zc3h7a coding upstream 36843 36951907 ~ 36973852 (+)
trnat-cgu_1 NA coding upstream 132801 36877823 ~ 36877894 (+)
LOC103040671 galr2b,LOC103040671,LOC108433115,LOC107674614,LOC107753547,LOC107564701,LOC107703387 coding upstream 332773 36651834 ~ 36677922 (+)
zfand2a zfand2a,LOC107568938 coding upstream 430324 36566207 ~ 36580371 (+)
mrm2 mrm2 coding upstream 1192109 35811037 ~ 35818586 (+)
nsmce1 nsmce1 coding downstream 62676 37088201 ~ 37096868 (+)
LOC103021790 LOC103021790,LOC108433116,LOC103481129 coding downstream 981996 38007521 ~ 38058413 (+)
LOC111195542 NA non-coding upstream 95957 36881360 ~ 36914738 (+)
G202341 NA non-coding upstream 338279 36671991 ~ 36672416 (+)
G202311 NA non-coding upstream 494767 36515648 ~ 36515928 (+)
G202307 NA non-coding upstream 540446 36409580 ~ 36470249 (+)
G202270 NA non-coding upstream 764052 36243616 ~ 36246643 (+)
G202394 NA non-coding downstream 5698 37031223 ~ 37032350 (+)
G202400 NA non-coding downstream 11863 37037388 ~ 37037645 (+)
G202405 NA non-coding downstream 33993 37059518 ~ 37060161 (+)
G202406 NA non-coding downstream 35730 37061255 ~ 37063186 (+)
G202483 NA non-coding downstream 109201 37134726 ~ 37134983 (+)
LOC103041887 NA other upstream 17363 36983323 ~ 36993332 (+)
G202336 NA other upstream 70416 36589448 ~ 36940279 (+)
LOC111195488 NA other upstream 1886077 35106038 ~ 35124618 (+)
psmg3 psmg3 other upstream 3195709 33811432 ~ 33814986 (+)
G201466 LOC102799139,LOC107581721 other upstream 3735788 33260173 ~ 33274907 (+)

Expression



Co-expression Network