G299477



Basic Information


Item Value
gene id G299477
gene name NA
gene type misc
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NW_019172830.1
NCBI id APWO02000048.1
chromosome length 5891159
location 2187333 ~ 2204255 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence


>TU411934
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>TU411938
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>TU411942
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>TU411944
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>TU411945
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>TU411947
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>TU411951
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>TU411955
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>TU411956
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>TU411957
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>TU411960
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>TU411966
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>TU411968
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>TU411969
atagggggcgctgtagagtcctctagctacacatgagaaaaacgacaaaatattcctaaatcaatttcaaagacttattgaatctgccaattatcaagaggctgagagcttttcataaatatgatataaaataggtggcgctagagagctgatgaaagACGAATTTACGAAATTCCAACTTACGGTCAAAGTATGGCCTAAGccaaatagctctgtaaaattttattagttttcaaacatcctaacccctccgaaacccagcaggaaactttttattttgcaacttcctgtcaaaatggccgacttcctgttgggcggagtcaaataaAACCTAGTGATTCTTGTTGTATATGAGGAGGTCAATGAGCgtaccaaagttggtgcacGTTGGACAAACTTCATCCCGGCCACTGCCGacgtttgggggcgctatagagctcctgaACAACGCCAAAGTCCAGCCTCTATGGAACTTTAAAATTTTCGCCGAGCTTGAGGCCTGTGCCAAAATGCGTGAGTTTTCGAGTATCggaaatgcctcaaaaatggACGCAAAGaggcagaataataataataacgagttgtccccctgtcacagggggacgtagggccctcgcacaacagcgcaaatcgtaccgggccaaaccgagaaaccggtaaaagtaattttgaggtcttattgagtgtgccaattttcaagagttttctatcctgttaaacatgtgaaatatccatttaaaatacaggtggcgctatagcgctgttaaaatacatgtatttgaaattctaattctacatcaaacaacagccttagataagcaggccggtcaaattttgtgagtttttctcCGTTATAACCTCCTCAAAACACCTGGCATTACCTAGGTTTTCACCTCCTGTTTTGATGTGGGATCTCAAAAATTCAACCAtctgccatttcgtcctcgtttgagatatcgactattccttc
>TU411971
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Function


GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU411934 True 1238 lncRNA 0.41 2 2187333 2193652
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TU411957 False 868 lncRNA 0.37 3 2188984 2196068
TU411960 False 867 lncRNA 0.37 2 2188984 2190808
TU411966 False 1153 lncRNA 0.40 4 2187333 2197832
TU411968 False 686 lncRNA 0.43 4 2195365 2203232
TU411969 False 970 lncRNA 0.42 5 2187333 2203232
TU411971 False 679 lncRNA 0.44 4 2194889 2203232

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
LOC103044644 NA coding upstream 606397 1579110 ~ 1580936 (+)
LOC111188231 NA coding upstream 625304 1558494 ~ 1562029 (+)
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LOC103044962 LOC108259203 coding upstream 773738 1384340 ~ 1413595 (+)
tshz3 tshz3,tshz3b,LOC108429148,LOC107570485,LOC107556246,LOC107696607 coding downstream 1453604 3657859 ~ 3745126 (+)
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G299475 NA non-coding upstream 332547 1854585 ~ 1854786 (+)
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LOC103025330 si:ch211-186j3.6,LOC108442966,LOC108259100,LOC106562040,LOC105022727,LOC107696606,LOC107572394,LOC107712488,LOC107680491,LOC107565684 other downstream 194462 2398717 ~ 2927862 (+)
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LOC111191164 NA other downstream 3339557 5543812 ~ 5548569 (+)

Expression



Co-expression Network