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Basic Information

Item Value
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gene type misc
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
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Function

symbol description
ptbp2b Predicted to enable mRNA binding activity. Predicted to be involved in regulation of RNA splicing. Predicted to act upstream of or within RNA splicing and mRNA processing. Predicted to be active in nucleus. Is expressed in central nervous system; cranial ganglion; retinal ganglion cell layer; and retinal inner nuclear layer. Orthologous to human PTBP2 (polypyrimidine tract binding protein 2).
ptbp2 Enables RNA binding activity. Involved in negative regulation of RNA splicing. Predicted to be integral component of membrane. Predicted to be part of spliceosomal complex. Predicted to be active in nucleus.

NR:

description
polypyrimidine tract-binding protein 2-like isoform X2

GO:

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KEGG: NA

RNA

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LOC103037029 NA coding downstream 392373 6946823 ~ 6961558 (+)
LOC103041009 NA coding downstream 460858 7015308 ~ 7020982 (+)
LOC111194639 NA coding downstream 607796 7162246 ~ 7167800 (+)
LOC103039155 NA coding downstream 627332 7181782 ~ 7188573 (+)
LOC103038844 NA coding downstream 635030 7189480 ~ 7202566 (+)
G1916 NA non-coding upstream 95579 6417323 ~ 6417565 (+)
G1902 NA non-coding upstream 162132 6350511 ~ 6351012 (+)
G1897 NA non-coding upstream 179064 6333189 ~ 6334080 (+)
G1873 NA non-coding upstream 584447 5928157 ~ 5928697 (+)
G1837 NA non-coding upstream 727087 5785826 ~ 5786057 (+)
G1945 NA non-coding downstream 3946 6558396 ~ 6565619 (+)
G1947 NA non-coding downstream 63902 6618352 ~ 6618666 (+)
G1963 NA non-coding downstream 115123 6669573 ~ 6669802 (+)
G1962 NA non-coding downstream 147650 6702100 ~ 6706375 (+)
G1975 NA non-coding downstream 278486 6832936 ~ 6833305 (+)
rwdd3 rwdd3 other upstream 98350 6408846 ~ 6414794 (+)
pnkp pnkp,LOC107749649,LOC107672387,LOC107561379,LOC107758514 other upstream 809961 5681026 ~ 5703183 (+)
LOC111192942 NA other upstream 1236156 5250484 ~ 5276988 (+)
LOC103026740 NA other upstream 1268957 5171375 ~ 5244187 (+)
G1127 LOC107669897,LOC107733923,LOC107558818 other upstream 2526416 3981824 ~ 3986728 (+)
G2304 NA other downstream 2005616 8560066 ~ 8560478 (+)
G2358 LOC108432992,LOC101077340,LOC100691215,LOC101465674 other downstream 2178273 8732723 ~ 8734952 (+)
lyrm9 lyrm9,LOC102789908 other downstream 2390011 8944461 ~ 8957392 (+)
G2509 NA other downstream 3077415 9631865 ~ 9670125 (+)
LOC103039705 gdpd5b,gdpd5,LOC103039705,LOC108433002,LOC108277648,LOC107666190,LOC107682503 other downstream 3079643 9634093 ~ 9743491 (+)

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