clip3 (clip3,LOC107714192,LOC107685098,LOC107548591,LOC107669746)



Basic Information


Item Value
gene id clip3
gene name clip3,LOC107714192,LOC107685098,LOC107548591,LOC107669746
gene type coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_035897.1
NCBI id CM008300.1
chromosome length 26953843
location 14731107 ~ 14753636 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence


>XM_007236834.3
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>XM_007236835.3
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TAATCCCCATAAACTTAAGAATTCTTCTCTGAATAATggatataacaataataaacatttgaTGTTTCGTAAA

Function


symbol description
clip3 Predicted to enable microtubule plus-end binding activity. Predicted to be involved in cytoplasmic microtubule organization. Predicted to be active in cytoplasm; microtubule plus-end; and nucleus. Orthologous to human CLIP3 (CAP-Gly domain containing linker protein 3).

NR:

description
PREDICTED: CAP-Gly domain-containing linker protein 3 isoform X1

GO: NA

KEGG:

id description
K10423 CLIP3_4; CAP-Gly domain-containing linker protein 3/4

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_007236835.3 False 5073 mRNA 0.42 14 14731107 14753636

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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LOC107197063 capns1,LOC108425806,LOC105901516,LOC107700232,LOC107548486 other downstream 86657 14840293 ~ 14845626 (+)
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Expression



Co-expression Network