G97929



Basic Information


Item Value
gene id G97929
gene name NA
gene type non-coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_035907.1
NCBI id CM008310.1
chromosome length 11650534
location 7119823 ~ 7125239 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence


>TU132003
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>TU132004
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>TU132005
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Function


GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU132003 False 4692 lncRNA 0.35 2 7119823 7125239
TU132004 False 4952 lncRNA 0.36 3 7119823 7125239
TU132005 True 5212 lncRNA 0.36 2 7119823 7125239

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
apoc2 NA coding upstream 30405 7084787 ~ 7089418 (+)
LOC103042602 NA coding upstream 38668 7076615 ~ 7081155 (+)
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LOC103045564 LOC107570829 coding downstream 611083 7736322 ~ 7759796 (+)
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LOC111193438 NA coding downstream 743794 7869033 ~ 7881591 (+)
smg9 smg9,LOC107699520,LOC107595308 coding downstream 766536 7891775 ~ 7900812 (+)
G97901 NA non-coding upstream 235248 6883243 ~ 6884575 (+)
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G97938 NA non-coding downstream 93993 7219232 ~ 7219527 (+)
G97940 NA non-coding downstream 114292 7239531 ~ 7239765 (+)
G97942 rps19,LOC107657656,LOC100689943 non-coding downstream 134752 7259991 ~ 7280844 (+)
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adar adar,LOC107723500 other upstream 438132 6654350 ~ 6681691 (+)
G97678 s10a1,LOC108429935,LOC106570100,LOC105901452,LOC105027143,LOC108437929,LOC106588175 other upstream 554820 6532516 ~ 6565003 (+)
efna3 efna3b,LOC108429914,LOC107699557,LOC108254910,LOC107723569,LOC107677021 other upstream 737106 6280322 ~ 6382717 (+)
G97931 NA other downstream 2565 7127804 ~ 7130809 (+)
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G98934 grik5,LOC107551699 other downstream 3047314 10172553 ~ 10178459 (+)

Expression



Co-expression Network