G98498


Basic Information

Item Value
gene id G98498
gene name NA
gene type non-coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035907.1
NCBI id CM008310.1
chromosome length 11650534
location 9086633 ~ 9096883 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>TU132769
TTGGAACTAACACTACTCACCACCAccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccaccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccaccctctaaaggtgttactgcacctgTTAGAACTAACACCACCGtctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccaccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccgccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccaccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactacacac
>TU132770
taaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccaccctctaaaggtgttactgcacctTTAGAACTAACACCACCGtctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccaccctctaaaggtgttactgcacctgttagaACTAACACTACTCCCCACCAccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccaccctctaaaggtgttactgcacctgttagaACTAACACTACTCACCA
>TU132771
ctaaccctaaccttaacccttaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccttaaccattaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaatcaaccttaaatctaaccctacacctaaccctaaccataaccttaacccttaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaacccttaccataaccttaacccttaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaacccttaccataaccttaaccctaatcaaccctaaaatctaacccta
>TU132774
ACACCAccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccaccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccgccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccaccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccgccctctaaaggtgttactgcacctgttagaACTAACACTACTCACCACCACCCTCTAAatgtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccaccctctaaaggtgttactgcacctgttagaACTAACACTACTCCCCACCAccctctaaaggtgttactgcacctgttagaACTAACATTACTCACCACCAccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccaccctctaaaggtgttactgcacctgttagaACTAACACTACTCAC
>TU132775
TTGGAACTAACACTACTCACCACCAccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccaccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccaccctctaaaggtgttactgcacctgTTAGAACTAACACCACCGtctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccaccctctaaaggtgttactgcacctgttagaACTAACACTACTCCCCACCAccctctaaaggtgttactgcacCTGTAAGAACTAACACTACTCACCACCACCCTCTAAAGGTGTTACTGCACCTGTTAGAGCTAACACTACTCA
>TU132777
TTGGAACTAACACTACTCACCACCAccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccaccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccaccctctaaaggtgttactgcacctgttagaACTAACACTACTCACCATCGCCCTCTAAatgtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccaccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccaccctctaaaggtgttactgcacctgttagaACTAACACTACTCACCA
>TU132778
ACACCAccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccaccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccgccctctaaaggtgttactgcacctgttagaACTAACACTACTCACCACCACCCTCTAAatgtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccaccctctaaaggtgttactgcacctgttagaACTAACACTACTCCCCACCAccctctaaaggtgttactgcacctgttagaACTAACATTACTCACCACCAccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccaccctctaaaggtgttactgcacctgttagaACTAACACTACTCAC
>TU132779
TTGGAACTAACACTACTCACCACCAccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccaccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccaccctctaaaggtgttactgcacCTGTTAGAACTAACcctaatcaacctaaaatctaaccctaaccttaaccattaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaaccataaccttaacccttaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccttaacccttaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaaccttaaccattaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaacccttaccataaccttaaccattaatcaatcctaaaatctaaccctaacacctaaccctaatcaaccctaaaatctaaccctacacttaaccctaaccataacccttaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaacccttaccataacccttaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaacccttaccataacccttaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccttaaccattaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaatcaaccctaaatctaaccctacacctaaccctaaccataacccttaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaaccttaaccattaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaaccttaaccattaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaaccttaaccattaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaaccttaaccattaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaaccttaaccattaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaaccttaaccattaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaaccttaaccattaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaaccttaaccattaatcaaccctaaaatctaaccctaca
>TU132780
TTGGAACTAACACTACTCACCACCAccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccaccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccaccctctaaaggtgttactgcacCTGTTAGAACTAACcctaatcaacctaaaatctaaccctaaccttaaccattaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaaccataaccttaacccttaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccttaacccttaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaaccttaaccattaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaacccttaccataaccttaaccattaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaaccttaaccattaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaaccttaacccttaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaaccttaaccattaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaaccttaacccttaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaaccttaaccattaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaaccttaacc
>TU132781
TTGGAACTAACACTACTCACCACCAccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccaccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccaccctctaaaggtgttactgcacctgttagaACTAACATTACTCACCACCACCCTCTTAAAGGTGTTACTGCCACCTGTTAGAACTAACATTACTCACCACCAccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccaccctctaaaggtgttactgcacctgttagaACTAACATTACTCACCACCAccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccgccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccaccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccgccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccgccctctaaaggtgttactgcacctgttagaACTAACACTACTCACCACCACCCTCTAAatgtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccaccctctaaaggtgttactgcacctgttagaACTAACACTACTCCCCACCAccctctaaaggtgttactgcacctgttagaACTAACATTACTCACCACCAccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccaccctctaaaggtgttactgcacctgttagaACTAACACTACTCAC
>TU132784
TTGGAACTAACACTACTCACCACCAccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccaccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccaccctctaaaggtgttactgcacCTGTTAGAACTAACcctaatcaacctaaaatctaaccctaaccttaaccattaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaaccataaccttaacccttaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccttaacccttaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaaccttaaccattaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaacccttaccataacccttaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccttaaccattaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaatcaaccttaaatctaaccctacacctaaccctaaccataaccttaacccttaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccttaaccattaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaaccataacccttaatcaaccctaaaatctaaccctacatctaaccttaaccattaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaaccttaacccttaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaaccttaaccattaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaaccttaacc
>TU132786
TTGGAACTAACACTACTCACCACCAccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccaccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccaccctctaaaggtgttactgcacctgTTAGAACTAACACCACCGtctaaaggtgttactgcacctgttagaACTAACATTACTCACCACCAccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccaccctctaaaggtgttactgcacctgttagaACTAACACTACTCAC
>TU132787
TTGGAACTAACACTACTCACCACCAccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccaccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccaccctctaaaggtgttactgcacCTGTTAGAACTAACcctaatcaacctaaaatctaaccctaaccttaaccattaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaaccataaccttaacccttaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccttaacccttaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaaccttaaccattaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaacccttaccataaccttaaccattaatcaatcctaaaatctaaccctaacacctaaccctaatcaaccctaaaatctaaccctacacttaaccctaaccataacccttaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaacccttaccataacccttaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaacccttaccataacccttaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaaccataacccttaatcaaccctaaaatctaaccctatacctaaccctaaccttaaccattaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaatcaaccctaaaatctaaccctaaccttaacccttaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaaccttaaccattaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaaccataacccttaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaaccttaaccattaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaaccttaaccattaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaaccttaaccattaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaaccttaaccattaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaaccttaaccattaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaaccttaaccattaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaaccttaaccattaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaaccttaaccattaatcaaccctaaaatctaaccctaca
>TU132788
taaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccaccctctaaaggtgttactgcacctTTAGAACTAACACCACCGtctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccaccctctaaaggtgttactgcacctgttagaACTAACACTACTCCCCACCAccctctaaaggtgttactgcacctgttagaACTAACATTACTCACCACCAccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccgccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccaccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactacacac
>TU132789
cctaaccctaaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaaccttaacccttaatcaaccctaaaatctaaccctaacacctaaccctaaccttaacccttaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaaccttaaccattaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaaccataacccttaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaaccttaaccattaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaaccttaaccattaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaaccttaaccattaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaaccttaaccattaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaaccttaaccattaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaaccttaaccattaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaaccttaaccattaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaaccttaaccattaatcaaccctaaaatctaaccctaca
>TU132790
TTGGAACTAACACTACTCACCACCAccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccaccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccaccctctaaaggtgttactgcacctgttagaACTAACATTACTCACCACCACCCTCTTAAAGGTGTTACTGCCACCTGTTAGAACTAACATTACTCACCACCAccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccaccctctaaaggtgttactgcacctgttagaACTAACATTACTCACCACCAccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccgccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccaccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccgccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactacacac
>TU132792
TTGGAACTAACACTACTCACCACCAccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccaccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccaccctctaaaggtgttactgcacCTGTTAGAACTAACcctaatcaacctaaaatctaaccctaaccttaaccattaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaaccataaccttaacccttaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaaccataacccttaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaacccttaccataacccttaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccttaaccattaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaatcaaccttaaatctaaccctacacctaaccctaaccataaccttaacccttaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaacccttaccataacccttaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccttaaccattaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaatcaaccctaaaatctaaccct
>TU132798
TTGGAACTAACACTACTCACCACCAccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccaccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccaccctctaaaggtgttactgcacctgttagaACTAACACTACTCACCATCGCCCTCTAAatgtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccaccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccgccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccaccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccgccctctaaaggtgttactgcacctgttagaactaacactactcaccaccaccctctaaaggtgttactgcacCTGTTAGAACTAACcctaatcaacctaaaatctaaccctaaccttaaccattaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaaccataacccttaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaacccttaccataacccttaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaacccttaccataacccttaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaatcaaccctaaaatctaaccctacacctaaccctaaccataacccttaatcaaccctaaaatctaaccctatacctaaccctaaccttaacccttaaatcaaccctaaaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU132769 False 360 lncRNA 0.46 4 9086633 9090683
TU132770 False 281 lncRNA 0.45 3 9087163 9088631
TU132771 False 282 lncRNA 0.38 2 9092631 9094381
TU132774 False 501 lncRNA 0.46 3 9088176 9091877
TU132775 False 359 lncRNA 0.46 4 9086633 9090486
TU132777 False 322 lncRNA 0.45 3 9086633 9088631
TU132778 False 401 lncRNA 0.46 2 9088176 9091877
TU132779 False 1111 lncRNA 0.39 5 9086633 9096493
TU132780 False 717 lncRNA 0.40 4 9086633 9096883
TU132781 False 822 lncRNA 0.46 5 9086633 9091877
TU132784 False 864 lncRNA 0.39 7 9086633 9096883
TU132786 False 310 lncRNA 0.45 3 9086633 9091877
TU132787 True 1285 lncRNA 0.39 7 9086633 9096493
TU132788 False 379 lncRNA 0.45 3 9087163 9090683
TU132789 False 613 lncRNA 0.38 2 9093862 9096493
TU132790 False 522 lncRNA 0.46 4 9086633 9090683
TU132792 False 627 lncRNA 0.40 6 9086633 9095886
TU132798 False 824 lncRNA 0.43 8 9086633 9093494

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC103035505 LOC108411721,LOC107658752 coding upstream 6395 9047865 ~ 9080238 (+)
ccdc107 LOC107555866 coding upstream 52332 9024387 ~ 9034301 (+)
krr1 krr1 coding upstream 160125 8916576 ~ 8926508 (+)
LOC111193444 NA coding upstream 191036 8862740 ~ 8895597 (+)
LOC103033147 phlda1 coding upstream 265444 8818913 ~ 8821189 (+)
cpsf6 cpsf6,LOC107729149 coding downstream 82902 9179785 ~ 9195720 (+)
LOC103042523 far1,LOC107590516,LOC103366393 coding downstream 117969 9214852 ~ 9268400 (+)
LOC111193395 NA coding downstream 266185 9363068 ~ 9365903 (+)
LOC103028562 ephb6,LOC108432347,LOC107724759,LOC107672963,LOC107549482,LOC107744289,LOC108270687 coding downstream 307937 9404820 ~ 9458769 (+)
LOC103028240 LOC108432345 coding downstream 376514 9473397 ~ 9508318 (+)
G98496 NA non-coding upstream 50 9083589 ~ 9086583 (+)
G98497 NA non-coding upstream 2334 9083769 ~ 9084299 (+)
G98483 NA non-coding upstream 121464 8963313 ~ 8965169 (+)
G98462 NA non-coding upstream 176348 8910008 ~ 8910285 (+)
G98460 NA non-coding upstream 178949 8907264 ~ 8907684 (+)
G98500 NA non-coding downstream 42451 9139334 ~ 9140580 (+)
G98508 yeats4,LOC107555875,LOC107590554 non-coding downstream 81623 9178506 ~ 9179318 (+)
G98630 NA non-coding downstream 190757 9287640 ~ 9292655 (+)
G98635 NA non-coding downstream 212375 9309258 ~ 9309691 (+)
LOC111193403 NA non-coding downstream 232024 9328907 ~ 9338005 (+)
G97931 NA other upstream 1955824 7127804 ~ 7130809 (+)
G97926 NA other upstream 2016504 7068688 ~ 7070129 (+)
apoc1 NA other upstream 2020604 7062132 ~ 7066029 (+)
adar adar,LOC107723500 other upstream 2404942 6654350 ~ 6681691 (+)
G97678 s10a1,LOC108429935,LOC106570100,LOC105901452,LOC105027143,LOC108437929,LOC106588175 other upstream 2521630 6532516 ~ 6565003 (+)
G98636 NA other downstream 215523 9312406 ~ 9312803 (+)
G98840 NA other downstream 899321 9996204 ~ 10002046 (+)
G98845 NA other downstream 963550 10060433 ~ 10069002 (+)
G98934 grik5,LOC107551699 other downstream 1075670 10172553 ~ 10178459 (+)
G98967 NA other downstream 1396908 10493791 ~ 10498518 (+)

Expression


Co-expression Network