G155233


Basic Information

Item Value
gene id G155233
gene name NA
gene type non-coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035914.1
NCBI id CM008317.1
chromosome length 41377133
location 344963 ~ 360697 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>TU210439
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>TU210440
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>TU210443
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>TU210444
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU210439 False 3892 lncRNA 0.36 3 345018 350247
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TU210443 False 3876 lncRNA 0.36 3 345018 350247
TU210444 True 5208 lncRNA 0.36 2 345018 350247

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC103033531 NA coding downstream 60831 421528 ~ 537878 (+)
LOC103040340 LOC108410554,LOC107566291 coding downstream 191232 551929 ~ 563776 (+)
LOC103034482 NA coding downstream 318298 678995 ~ 681903 (+)
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G155234 NA non-coding upstream 13689 330837 ~ 331274 (+)
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G155217 NA non-coding upstream 132909 211852 ~ 212054 (+)
G155189 NA non-coding upstream 298165 46589 ~ 46798 (+)
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G155328 NA non-coding downstream 334829 695526 ~ 703112 (+)
G155206 NA other upstream 191700 149347 ~ 153263 (+)
LOC103044527 NA other downstream 742753 1103450 ~ 1106792 (+)
G155491 akt2,LOC107711004,LOC107557843,LOC107692744,LOC107572728,LOC107714435,LOC108264340 other downstream 826449 1187146 ~ 1278262 (+)
LOC103036073 LOC106581333,LOC102227031,LOC105940324 other downstream 843044 1203741 ~ 1223350 (+)
G155776 NA other downstream 2377664 2738361 ~ 2755112 (+)
LOC111194753 NA other downstream 3250321 3611018 ~ 3614491 (+)

Expression


Co-expression Network