G161243


Basic Information

Item Value
gene id G161243
gene name NA
gene type non-coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035914.1
NCBI id CM008317.1
chromosome length 41377133
location 28366168 ~ 28394028 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>TU218490
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>TU218491
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>TU218493
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU218490 False 3774 lncRNA 0.36 2 28388651 28392768
TU218491 True 3806 lncRNA 0.36 2 28388651 28392768
TU218493 False 1499 lncRNA 0.37 2 28366168 28394028

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
gpr149 gpr149 coding upstream 82850 28255972 ~ 28283318 (+)
LOC111194790 LOC108434085,LOC108264118,LOC108434032 coding upstream 170454 28185750 ~ 28195714 (+)
LOC103044051 LOC108434085,LOC108264118,LOC108434032 coding upstream 181261 28180682 ~ 28184907 (+)
LOC107196882 LOC108434085,LOC108264118,LOC108434032 coding upstream 188182 28173610 ~ 28177986 (+)
LOC103045576 LOC108437981,LOC108264123 coding upstream 288436 28071491 ~ 28077732 (+)
arid3b LOC108439030,LOC108264089 coding downstream 374578 28768606 ~ 28859096 (+)
LOC103037946 LOC108439022 coding downstream 560689 28954717 ~ 28969395 (+)
LOC103022881 LOC108439021 coding downstream 624032 29018060 ~ 29063139 (+)
LOC103023184 NA coding downstream 739600 29133628 ~ 29143190 (+)
LOC103038575 LOC108439020 coding downstream 758268 29152296 ~ 29159185 (+)
LOC111194734 NA non-coding upstream 330973 28030613 ~ 28035195 (+)
G161129 NA non-coding upstream 472691 27893087 ~ 27893477 (+)
G161115 NA non-coding upstream 582979 27780854 ~ 27783189 (+)
G161080 NA non-coding upstream 738746 27602859 ~ 27627422 (+)
G161079 NA non-coding upstream 779398 27586529 ~ 27586770 (+)
LOC111194802 NA non-coding downstream 249293 28643321 ~ 28652309 (+)
LOC111194803 NA non-coding downstream 258524 28652552 ~ 29213664 (+)
G161302 NA non-coding downstream 274145 28668173 ~ 28764043 (+)
G161314 NA non-coding downstream 492414 28886442 ~ 28886800 (+)
G161312 NA non-coding downstream 492944 28886972 ~ 28889126 (+)
c18h3orf33 NA other upstream 569664 27784896 ~ 27796504 (+)
ccnl1 ccnl1,LOC107684610,LOC107557837,LOC107710830 other upstream 1246904 27109671 ~ 27119264 (+)
G160919 ptx3 other upstream 1458541 26905244 ~ 26907627 (+)
LOC103021732 gramd1b,gramd1bb,LOC108264679 other upstream 1610855 26617262 ~ 26755313 (+)
LOC103037315 LOC108435313,LOC107551446,LOC107714780 other upstream 2020486 26323820 ~ 26345682 (+)
G161292 rap2b,LOC107757383 other downstream 228100 28622128 ~ 28624785 (+)
fam219b fam219b other downstream 351668 28745696 ~ 28759007 (+)
G161331 NA other downstream 676792 29070820 ~ 29116795 (+)
LOC103042463 tmod3,LOC108440576,LOC108264495 other downstream 1959658 30353686 ~ 30414212 (+)
dhdds dhdds,LOC106582847,LOC106605152 other downstream 2460530 30854558 ~ 30894506 (+)

Expression


Co-expression Network