kiaa0513 (kiaa0513,LOC107740318,LOC107583795)


Basic Information

Item Value
gene id kiaa0513
gene name kiaa0513,LOC107740318,LOC107583795
gene type coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035914.1
NCBI id CM008317.1
chromosome length 41377133
location 15691503 ~ 15717211 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>XM_007249206.3
TTGCTGCTGGCTCTGTTCTTGCGAAATAGAAAGggaattttaattattaatggcAAAAGTGAGCACCTTGTGCTTATAAGCAATGTGAGTGTAGATTCAGAGCCCCAACCTAtcaaaacctttaaatgaacGTCAGAATTCAACATTAACAGATGtctattaaaatatgtaatgcaACCAGTAAATGCACGTTCTTTGCTTTCTGGGAGGACAAACACATaaaggatgatgatgatgatgaggatgggAATCACCGACCCCCCTCTCGTGTCGTCGTGTCCATCGACAAGTGCGCAGTGCTCGCGCACAACCCGGTCACGTGCTTCTTTCTGTCGACGTAACTGGATTCCCCCCTCCTCGTCCACTCGAGCTATCGCGCGTGCGCAGTTACCGCTGACTGGAGTGAGCGGAGTGAGAAGAGACGGGAGCGCGCGCGCACGGCGGGTTGAGAGAGAGCACGTAGTTCAGCCTGGAACTGTTCTGGTACAGCTGTAGGATAAAGAGACGTGGTACAGCAGCTTCTCCACTGTGGGTTGTTAGCTGAGGTGGGCCCACCTGCTTTCGTGTGACCTCAACAGTCCACCTGTATCTCCCTCTTGGATCAGTATGGAGGGGGCTGCAGTGGAAAACCTCATAGACTTTGACATTCCCTCCAGCACAGAAGGGACAGCACCCTCTGCTGTTGGTCTTCCTGGTGGAGCAGACTTGTTCTTTGGGGAGCCTCTTGTTCCAGAGCCGATTGCAGCCCCTATGAAGCTTCCTGAGCCTATTGCCCCAACACTGGCTGCTCACGAGTCAGAGGAGGGTGCAGACGACAGCGATGCCACAGAGTCTGCGGACAGTGAGAATGAAGCCATAGATTCTCCATCCCACCATTCACAGTCACGCCGGTCTTCTTCctcatccaatcacagtgcTGAGGACCCAGATGTGACAGAACGGCGAGAATTTATGAAGGCCTACGTAGAGAAGTTGTTTCATGGAAAggagGACTTTGACCAGGAGGAGAAGGCCCGTTTTGGCGAGCTGTGCAGTGGAGAGAATGGCAAAGGCAGAGAGTGGTTCGCCAAATACGTCAGTGTCCAGcgctGTAACTCCAAGTGTGTAAGTGAGCAGACGTTCTACAGGCTGGTCCAGTCCTTTGCAGTCGTTCTGTTTGAATGCTACCAGATGGATGATTATGTCCCTGCCAAGCATTTAATGACCATGTGCTTTACGTACTACTACTTTGGGAAGCTACATCTGTCACCCACAGAGCTCCTGGACAGGCCGAGTGCAGGCATTGACTCGTACCTGCGCAGTGGAAAGGTCTGGCTCTCGGGCAAGAAGGACATCGCTGAGAAGCTGCTAAAAAATACAACGGCTAAGACTGACATGAAGAGCTTTTTTGGGGGTCTAGAGAGCAAACTGAGAGGCCCCTCCACCCGCAAGAATGATGAGCCAGAGAGTCCAGCAGAAGGAAAAGCAAAAACACCAGCCTCTCCACCTGCATCACCAgagaagaaagagggagagaagattTACTTGTATACACACCTCAAGCAGCAGCCGATCTGGCACACATTGAGGTTTTGGAATGCTGCGTTCTTCGATGCTGTGCACTGCGAGAGGAACAAGAGATCCCCAACCACCAGGCGGACGGCTGAGGAGGAGAAAGATGAGAGGGAAAAGTGGTGTCACATGACTCAGGAAGAGAAAGACGACAGCTCCAGAATAGACGAAAACATCACCTTCGGACAGCTGGGgacCTTTACTCATAATATGCTGGCCTTTGGCTTGACTAAGAAGCTCTGCAACGACTTTCTCAAGAAGCAGGCCGTTATTGGACACTTGAATGAAGAGCAATACAAATTGCTGAGTGACCATATTGAACAGATGGCCGTGGAGTGAGCAGCAGATACAGAACACACCTGTTCTTCTATACTTGCACATTCAATCCAGCCTCCCTCATCAGTTCCTTATAAACACTCCTGCTCAGCTTCAGCTGGCAACTCCGTACAATATCATATCAGATCGTGCGACAACCGTCCTGCACACAGCTGAACAGCTGTAGGTGATAAAATATTCAGAAGGTGGCAATAACTTTTCATCATCATGCATCATCTTACTTCAGTGACACTCCAGTGAGTTGCTGCAGCTCTGTCACAGCAATTACGTGAATTCAAATATATCAGTATCTGATGGATCAGCCATATTCCTGATGGTTCTGTGTTGTgcaatatatgtacagtatatcataGATCCAATAACCTATGAATTGCTGGTTTAGCTAATATACAGAAAGTGTCCTTTACCCCAGTGAAGTTAAGCTGAAAAAATGACAAACCCTTTCAGATATGCTCTTCAGCCTCACTGTCCCTCTGGTTTCTCTCCAGAAGATCTTAGTCAGGTGCATGCAGTTCAGAAAGAGTTTTCCTCTTTATTCCATGTGTCCTATTTATTGCATGTGTTCAGCACCTATTTATAGAGCTGATCCTTTTAGTCCTTTTAATATTACACAATAGTAGCTCTACTGGTACTGCAAAacaataggcctgtcacaataactatgcTGTTTGGACAGTATATTGCTCTGGAAATTATTGTAATAAGTGagattgtaattgtaattgtttaGACCTTGATTACTAAGAACAATTTGACATTGATATTAACAAAGCACTTAAATGTTCCAAATATATGTtcatatgttaatttattataatctataatgtaactattgtgacaggcctactaaTGCAACATCATAAAGAATTCTACAGTATTGTGACAGACTGACCAACCAGCCACAGCCCTGTTCTACATTTCCAGGCTGTTTTTAGTCTTTTAGTCTCAATGAGTTGAAATGTGACCCTGTATCAATCATGTGTGAAACAGTATTAATATGATTTGTTTAATATGTGTCTCCTACACGTGGTGTGCGAGCCTCCAAAGAGAACATTGTAACTCCGGTCTGTTTAAAGTGCCTTTAATGACTTACCCTTTCCTCGTGCAGTGTTGCAGATGTAAGCCTTTTCCGTCCACATGAAACCCTCtcagtaaatgtatgtatggatCCTGTTTGCTGTAGTGGGGTGTAGTTATCTTTGCATTTGTGTGTATTGTACATGTTTGCTGTATGTCTGTTCTGTGTGTGGTTGTCGAGTATTTGTAATAGACTAGGTCAGGACTGTCTGTAGTGGTTATAGGATCAGCATGACCTTCTGGAGCTGCTGTTTGTGTTCCTCTCGGTGTGCATGATTGTAAATGGTTTCCTGTCAGCATGGTGAGTAGAACATTGTGAGTTGTAGTGTAGTTCCATTTGCAGCCAACTGAGGGTGATCATGTTGCTCCTCTTCCTTGGACTGCTGGGCTGTGGAGGAGAAGGTTAACTACAGAAGTGAGGTGTTTCTGGAAGGTTTTATGAATTTACTGAAGTCTCCTCTGTGTGAGGATAATGAAAAGTTAATATATTCAGTTTGTAAATACAGAGTTTTTATCAGTGTTGTGGTTCGTATTGCATATGATGCGTTTTTTGCAACACAGTTCAAGTAGCTGGTTCAAAAAAGGGATCACTGGATTGTTAACTGTTAACAGTTTATACAGTGTTTACGTGTtgtgtctcatgtctcatggtGTGCATGGACATAATAGGATGGGCTGCAACCATTTTAATAGTGAAACGTGCTTTTCAAATCATGGTGTAacttttaatgttatattatgtaatgtaatttaatgtgaaTGGATGTGATTTAGTGTCTTAAATACATTTCCCCTTAAGTGCCCTCCAATTCCCTACTGGAATGTACCACTCAGAGCCTGTTATCCCCATACCATTATGTGGAACATATGTTGTtattgtgtttataataaaatatgcctAAAATCA
>XM_007249207.3
GCTGCTGGCTCTGTTCTTGCGAAATAGAAAGggaattttaattattaatggcAAAAGTGAGCACCTTGTGCTTATAAGCAATGTGAGTGTAGATTCAGAGCCCCAACCTAtcaaaacctttaaatgaacGTCAGAATTCAACATTAACAGATGtctattaaaatatgtaatgcaACCAGTAAATGCACGTTCTTTGCTTTCTGGGAGGACAAACACATaaaggatgatgatgatgatgaggatgggAATCACCGACCCCCCTCTCGTGTCGTCGTGTCCATCGACAAGTGCGCAGTGCTCGCGCACAACCCGGTCACGTGCTTCTTTCTGTCGACGTAACTGGATTCCCCCCTCCTCGTCCACTCGAGCTATCGCGCGTGCGCAGTTACCGCTGACTGGAGTGAGCGGAGTGAGAAGAGACGGGAGCGCGCGCGCACGGCGGGTTGAGAGAGAGCACGTAGTTCAGCCTGGAACTGTTCTGGTACAGCTGTAGGATAAAGAGACGTGGTACAGCAGCTTCTCCACTGTGGGTTGTTAGCTGAGGTGGGCCCACCTGCTTTCGTGTGACCTCAACAGTCCACCTGTATCTCCCTCTTGGATCAGTATGGAGGGGGCTGCAGTGGAAAACCTCATAGACTTTGACATTCCCTCCAGCACAGAAGGGACAGCACCCTCTGCTGTTGGTCTTCCTGGTGGAGCAGACTTGTTCTTTGGGGAGCCTCTTGTTCCAGAGCCGATTGCAGCCCCTATGAAGCTTCCTGAGCCTATTGCCCCAACACTGGCTGCTCACGAGTCAGAGGAGGGTGCAGACGACAGCGATGCCACAGAGTCTGCGGACAGTGAGAATGAAGCCATAGATTCTCCATCCCACCATTCACAGTCACGCCGGTCTTCTTCctcatccaatcacagtgcTGAGGACCCAGATGTGACAGAACGGCGAGAATTTATGAAGGCCTACGTAGAGAAGTTGTTTCATGGAAAggagGACTTTGACCAGGAGGAGAAGGCCCGTTTTGGCGAGCTGTGCAGTGGAGAGAATGGCAAAGGCAGAGAGTGGTTCGCCAAATACGTCAGTGTCCAGcgctGTAACTCCAAGTGTGTAAGTGAGCAGACGTTCTACAGGCTGGTCCAGTCCTTTGCAGTCGTTCTGTTTGAATGCTACCAGATGGATGATTATGTCCCTGCCAAGCATTTAATGACCATGTGCTTTACGTACTACTACTTTGGGAAGCTACATCTGTCACCCACAGAGCTCCTGGACAGGCCGAGTGCAGGCATTGACTCGTACCTGCGCAGTGGAAAGGTCTGGCTCTCGGGCAAGAAGGACATCGCTGAGAAGCTGCTAAAAAATACAACGGCTAAGACTGACATGAAGAGCTTTTTTGGGGGTCTAGAGAGCAAACTGAGAGGCCCCTCCACCCGCAAGAATGATGAGCCAGAGAGTCCAGCAGAAGGAAAAGCAAAAACACCAGCCTCTCCACCTGCATCACCAgagaagaaagagggagagaagattTACTTGTATACACACCTCAAGCAGCAGCCGATCTGGCACACATTGAGGTTTTGGAATGCTGCGTTCTTCGATGCTGTGCACTGCGAGAGGAACAAGAGATCCCCAACCACCAGGGAAAAGTGGTGTCACATGACTCAGGAAGAGAAAGACGACAGCTCCAGAATAGACGAAAACATCACCTTCGGACAGCTGGGgacCTTTACTCATAATATGCTGGCCTTTGGCTTGACTAAGAAGCTCTGCAACGACTTTCTCAAGAAGCAGGCCGTTATTGGACACTTGAATGAAGAGCAATACAAATTGCTGAGTGACCATATTGAACAGATGGCCGTGGAGTGAGCAGCAGATACAGAACACACCTGTTCTTCTATACTTGCACATTCAATCCAGCCTCCCTCATCAGTTCCTTATAAACACTCCTGCTCAGCTTCAGCTGGCAACTCCGTACAATATCATATCAGATCGTGCGACAACCGTCCTGCACACAGCTGAACAGCTGTAGGTGATAAAATATTCAGAAGGTGGCAATAACTTTTCATCATCATGCATCATCTTACTTCAGTGACACTCCAGTGAGTTGCTGCAGCTCTGTCACAGCAATTACGTGAATTCAAATATATCAGTATCTGATGGATCAGCCATATTCCTGATGGTTCTGTGTTGTgcaatatatgtacagtatatcataGATCCAATAACCTATGAATTGCTGGTTTAGCTAATATACAGAAAGTGTCCTTTACCCCAGTGAAGTTAAGCTGAAAAAATGACAAACCCTTTCAGATATGCTCTTCAGCCTCACTGTCCCTCTGGTTTCTCTCCAGAAGATCTTAGTCAGGTGCATGCAGTTCAGAAAGAGTTTTCCTCTTTATTCCATGTGTCCTATTTATTGCATGTGTTCAGCACCTATTTATAGAGCTGATCCTTTTAGTCCTTTTAATATTACACAATAGTAGCTCTACTGGTACTGCAAAacaataggcctgtcacaataactatgcTGTTTGGACAGTATATTGCTCTGGAAATTATTGTAATAAGTGagattgtaattgtaattgtttaGACCTTGATTACTAAGAACAATTTGACATTGATATTAACAAAGCACTTAAATGTTCCAAATATATGTtcatatgttaatttattataatctataatgtaactattgtgacaggcctactaaTGCAACATCATAAAGAATTCTACAGTATTGTGACAGACTGACCAACCAGCCACAGCCCTGTTCTACATTTCCAGGCTGTTTTTAGTCTTTTAGTCTCAATGAGTTGAAATGTGACCCTGTATCAATCATGTGTGAAACAGTATTAATATGATTTGTTTAATATGTGTCTCCTACACGTGGTGTGCGAGCCTCCAAAGAGAACATTGTAACTCCGGTCTGTTTAAAGTGCCTTTAATGACTTACCCTTTCCTCGTGCAGTGTTGCAGATGTAAGCCTTTTCCGTCCACATGAAACCCTCtcagtaaatgtatgtatggatCCTGTTTGCTGTAGTGGGGTGTAGTTATCTTTGCATTTGTGTGTATTGTACATGTTTGCTGTATGTCTGTTCTGTGTGTGGTTGTCGAGTATTTGTAATAGACTAGGTCAGGACTGTCTGTAGTGGTTATAGGATCAGCATGACCTTCTGGAGCTGCTGTTTGTGTTCCTCTCGGTGTGCATGATTGTAAATGGTTTCCTGTCAGCATGGTGAGTAGAACATTGTGAGTTGTAGTGTAGTTCCATTTGCAGCCAACTGAGGGTGATCATGTTGCTCCTCTTCCTTGGACTGCTGGGCTGTGGAGGAGAAGGTTAACTACAGAAGTGAGGTGTTTCTGGAAGGTTTTATGAATTTACTGAAGTCTCCTCTGTGTGAGGATAATGAAAAGTTAATATATTCAGTTTGTAAATACAGAGTTTTTATCAGTGTTGTGGTTCGTATTGCATATGATGCGTTTTTTGCAACACAGTTCAAGTAGCTGGTTCAAAAAAGGGATCACTGGATTGTTAACTGTTAACAGTTTATACAGTGTTTACGTGTtgtgtctcatgtctcatggtGTGCATGGACATAATAGGATGGGCTGCAACCATTTTAATAGTGAAACGTGCTTTTCAAATCATGGTGTAacttttaatgttatattatgtaatgtaatttaatgtgaaTGGATGTGATTTAGTGTCTTAAATACATTTCCCCTTAAGTGCCCTCCAATTCCCTACTGGAATGTACCACTCAGAGCCTGTTATCCCCATACCATTATGTGGAACATATGTTGTtattgtgtttataataaaatatgcctAAAATCA

Function

symbol description
kiaa0513 Predicted to be located in cytoplasm.

NR:

description
PREDICTED: uncharacterized protein KIAA0513 homolog isoform X1

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_007249206.3 True 3871 mRNA 0.44 13 15691503 15717211
XM_007249207.3 False 3839 mRNA 0.44 12 15691505 15717211

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC103043506 LOC108423614 coding upstream 2789 15678723 ~ 15688714 (+)
LOC103031192 LOC108423591,LOC105018602,LOC103466747,LOC108229128 coding upstream 190290 15482444 ~ 15501213 (+)
chtf8 chtf8,LOC107583916,LOC107569647 coding upstream 315339 15373349 ~ 15376164 (+)
LOC103046975 NA coding upstream 344394 15342494 ~ 15347109 (+)
LOC111194727 NA coding upstream 356501 15333873 ~ 15335002 (+)
c18h16orf70 c4h16orf70,clg19h16orf70,si:dkey-102f14.5,LOC103042166,LOC107686270,LOC106573725,LOC105892482 coding downstream 20777 15737988 ~ 15750462 (+)
nup93 nup93,LOC107549634 coding downstream 60514 15777725 ~ 15804576 (+)
slc12a3 slc12a3,LOC107583876 coding downstream 90978 15808189 ~ 15822339 (+)
herpud1 NA coding downstream 106508 15823719 ~ 15833040 (+)
cetp cetp coding downstream 115942 15833153 ~ 15846690 (+)
G158582 NA non-coding upstream 106509 15583441 ~ 15584994 (+)
G158580 NA non-coding upstream 119165 15571534 ~ 15572338 (+)
G158576 NA non-coding upstream 187459 15503526 ~ 15504044 (+)
G158565 zc3h18,LOC107672267 non-coding upstream 230497 15452216 ~ 15461006 (+)
G158555 NA non-coding upstream 298338 15391659 ~ 15393165 (+)
G158624 NA non-coding downstream 55015 15772226 ~ 15772440 (+)
G158627 NA non-coding downstream 90108 15807319 ~ 15807533 (+)
G158640 NA non-coding downstream 189942 15907153 ~ 15907900 (+)
G158641 NA non-coding downstream 191792 15909003 ~ 15909291 (+)
G158644 fam192a non-coding downstream 218867 15936078 ~ 15942262 (+)
c18h11orf16 NA other upstream 375951 15306212 ~ 15315552 (+)
LOC111194769 NA other upstream 554233 15128368 ~ 15137270 (+)
G158369 NA other upstream 640785 15050222 ~ 15050718 (+)
LOC103042073 LOC103042073,LOC108418727 other upstream 1711478 13973821 ~ 13980025 (+)
LOC107197649 LOC108416831 other upstream 1949003 13733945 ~ 13742500 (+)
LOC103041858 NA other downstream 50844 15768055 ~ 15768661 (+)
LOC107197617 NA other downstream 54084 15771295 ~ 15771945 (+)
LOC103041352 NA other downstream 58213 15775424 ~ 15776166 (+)
G158779 NA other downstream 662048 16379259 ~ 16379823 (+)
siah1 siah1,LOC107549647,LOC107742888,LOC106573709 other downstream 825667 16542878 ~ 16571458 (+)

Expression


Co-expression Network