thsd4 (thsd4)



Basic Information


Item Value
gene id thsd4
gene name thsd4
gene type coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_035914.1
NCBI id CM008317.1
chromosome length 41377133
location 29606057 ~ 29715602 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence


>XM_007251880.3
gtgtgtgtgtgtgtgtgttggagctgTTGCTGGTCTCATGCTCAGGGAACTGTACGGATCAGAGTCATGGAGGAGGTGAAGGTGGGGGGCTGCAGGGGGTCTGTCTGCCTTTTTATATTTGCTGTAAACTTTAAATCAGCTGGAACTGAATGAATAACATCTCCATTAGAGGAGCGCGCGCTCTGGAGGAACCGCAGGCACGGTAGAGCTGCCCACTTTCTCTCCAGTATGAGCAGAAGAGTCTCCATGGTGAGTTTCGCCATGGTTATGGCCCTGCTTTGGTCAATCCCCACTGACTGTCAGCTCCCAGCAAACCACAAGAAGGTTTCTCCTAGGTCAGAATCCCAGCCGGGAGTTAATGATGACGTCCCTCAGGGGTCGTGGGGCTCCTGGGGCCCATGGGGTGAATGTTCCCGCTCCTGTGGTGGGGGGGTCCACCAGCAAACGAGGCCGTGCCTCCCAACCGTCACCCCTCTAGCTGCAGCATACACTCCCAGACAGGCTCCTCATGTGGGGCACCAGGAACCGGGACACGTGGAATCAGCCTTGAGGCCCTCTGTGCCAGTGCATCGCGGGAATACACACCTCACCAGCCGTGGGCAGCCTAGGAAGCAGCAGAATGAAGTACGACCTGGGCGACGgcGGAGCAGCAGCCGCATCACTCCTGGAATGTACGGCTACGGGAAGATGCCGTATGTGATGTCCTCACAGAGCGACCAAAATATACACACCAACCTGCACCAGTATCGCCCCCCATCCGACTACAGACACCACAGCTACAgacgacagcagcagcagcagcagctgaacaACAGAAATACTCACCAAATCACCCACCACAACTCTCACCACAACACCAACCAGCAGACCTGGGTTCCTTTATATCAGCCCAGCTCTGGCCTTCAGAGTCAAACCGAGCAGCAGTATCCTACTGGCACTCAGACGTCAGGGTCCAGCCAAACGTCCACTCAGACCAGACCCTACAACCCCCTGCCAGCTTCCTCCTGCTCCGGAGAGTCCAGCCTGTACAAGAAGTGCAACACAAATCCCTGTCCTCCAGCCAGTAAGCCTGTCAGAGACGTCCAGTGTTCCTCCCATAACAGCCACCCGTTTATGGGCCGACTCTACGAATGGGAACCTTTCAATGAGGTTCCTGAAGATCAGCTGTGTGAGCTAAACTGCCGGGCGATTGGGTACCGCTTCTACGTCCGGCTGTCAGAGCGGGTCATCGATGGGACTCCATGTGGACAGAATGAGACGTCCATCTGTGTGGCTGGGAAATGTCAGagTCCTGGCTGTGATGAGTTCCTGGGCTCGGGGAAGGAGATGGATAAGTGTGGGGTGTGTGGAGGGGATAACACCGCCTGCAAGCTGGTCTCTGGCATGTTCCAGCACAGCCTGTCCAAAGTGGGCTACCACAAGATCGTGGAGATTCCAGAGGGAGCTACCAAGATCAACGTCACCGAGATGGTCAAGAGCCAGAACTACCTTGCCCTGCGGAGCCGTGCTGGACGATCCATCATAAACGGAAACTGGGCCATCGACCGGCCAGGAAAGTACGAGGGAGGGGGGACCATGTTCACATACCGGCGGCCCAATGAAATCAGCAGCACAGCTGGAGAGTCCTTTCTGGCAGAGGGGCCGACCAATGAAGTCCTGGACGTCTATATGATCTACCAGCAGCCCAATCCTGGagtgcattatgaatacatCCTTCCATCAGAAAACTCAGTTTTGCAGGGCAGTGCAGATGATGCAGGTAACACAGTGACCAGTGAAACAGGATATGATCAGTACGGTCGGCCGTCTCAGGAAGGATACGAACAAGGAGGAGGACACAGGTACCCTCCTCACACACCCGACAACCAGGTACCTGCAGCCCAGCCCCCacgcagacagagagagcataACTGGAAACTTATTGGAACAACTGACTGCAGCGCCTCCTGTGGTAGAGGTAGCAGGTATACTGTGTTTGGCTGTGTTCACCGCATCACTCACGACCGTGTGTCGGACACTCTGTGTGACAGCAGTACCAAGCCCAGCGCTCAGGAGGAGCCCTGCAACGTCCAGCCATGCCCTGCATTTTGGGATATTGGCGAGTGGTCAGAGTGCAGTAAGACGTGTGGCCTCGGCATGCAGCACCGTCAGATCCTCTGCCGCCAGGTTTACGCCAACCGCACCCTCAACGTGCAGTCCAGCCGCTGCCGCCACCTCGAGCGCCCCGAGAGTAGCGGCACCTGCCAAATGAAGATCTGCAGCGAGTGGCAGATCCGCTCCGAGTGGAGCCCTTGCTCGGTGCCCTGTGGGGTGGGTCAGAGGTCGCGGGAGGTGCGCTGCGTCAGTAACGTGGGTGATTTTGTGGAGGATGAGGAGTGTAACATGAAGCTTCGTCCCAGCGATGCGGAGAACTGTGACATGGGACCGTGTGCAAAGAGCTGGTTCCACACAGACTGGGCCAACAGAtgctctGCAGAGTGTGGGATGGGTGTACGGAGTCGTAGTGTGGTTTGTCTTATTAACCACATCAGCAGTCTGCCTCTAGAAGGCTGTGGGTCAGAGCGCCCCCCAGAGGTTCAGGCCTGCAACAACGGGCCCTGTGAGAGCCGCACTGAGTGGTTCACTGGGCCGTGGGGTCAGGTGAGCAAAGGACAGCTTCTGAAATGTGAAAATACATATTCAACTGTAGTTTTgaatacatacacactacagttgtgacgagacactaatatcatgagacgagacaagacacgatactgggttcacgagaa
>XM_022679829.1
gtgtgtgtgtgtgtgtgttggagctgTTGCTGGTCTCATGCTCAGGGAACTGTACGGATCAGAGTCATGGAGGAGGTGAAGGTGGGGGGCTGCAGGGGGTCTGTCTGCCTTTTTATATTTGCTGTAAACTTTAAATCAGCTGGAACTGAATGAATAACATCTCCATTAGAGGAGCGCGCGCTCTGGAGGAACCGCAGGCACGGTAGAGCTGCCCACTTTCTCTCCAGTATGAGCAGAAGAGTCTCCATGGTGAGTTTCGCCATGGTTATGGCCCTGCTTTGGTCAATCCCCACTGACTGTCAGCTCCCAGCAAACCACAAGAAGGTTTCTCCTAGGTCAGAATCCCAGCCGGGAGTTAATGATGACGTCCCTCAGGGGTCGTGGGGCTCCTGGGGCCCATGGGGTGAATGTTCCCGCTCCTGTGGTGGGGGGGTCCACCAGCAAACGAGGCCGTGCCTCCCAACCGTCACCCCTCTAGCTGCAGCATACACTCCCAGACAGGCTCCTCATGTGGGGCACCAGGAACCGGGACACGTGGAATCAGCCTTGAGGCCCTCTGTGCCAGTGCATCGCGGGAATACACACCTCACCAGCCGTGGGCAGCCTAGGAAGCAGCAGAATGAAGTACGACCTGGGCGACGgcGGAGCAGCAGCCGCATCACTCCTGGAATGTACGGCTACGGGAAGATGCCGTATGTGATGTCCTCACAGAGCGACCAAAATATACACACCAACCTGCACCAGTATCGCCCCCCATCCGACTACAGACACCACAGCTACAgacgacagcagcagcagcagcagctgaacaACAGAAATACTCACCAAATCACCCACCACAACTCTCACCACAACACCAACCAGCAGACCTGGGTTCCTTTATATCAGCCCAGCTCTGGCCTTCAGAGTCAAACCGAGCAGCAGTATCCTACTGGCACTCAGACGTCAGGGTCCAGCCAAACGTCCACTCAGACCAGACCCTACAACCCCCTGCCAGCTTCCTCCTGCTCCGGAGAGTCCAGCCTGTACAAGAAGTGCAACACAAATCCCTGTCCTCCAGCCAGTAAGCCTGTCAGAGACGTCCAGTGTTCCTCCCATAACAGCCACCCGTTTATGGGCCGACTCTACGAATGGGAACCTTTCAATGAGGTTCCTGAAGATCAGCTGTGTGAGCTAAACTGCCGGGCGATTGGGTACCGCTTCTACGTCCGGCTGTCAGAGCGGGTCATCGATGGGACTCCATGTGGACAGAATGAGACGTCCATCTGTGTGGCTGGGAAATGTCAGagTCCTGGCTGTGATGAGTTCCTGGGCTCGGGGAAGGAGATGGATAAGTGTGGGGTGTGTGGAGGGGATAACACCGCCTGCAAGCTGGTCTCTGGCATGTTCCAGCACAGCCTGTCCAAAGTGGGCTACCACAAGATCGTGGAGATTCCAGAGGGAGCTACCAAGATCAACGTCACCGAGATGGTCAAGAGCCAGAACTACCTTGCCCTGCGGAGCCGTGCTGGACGATCCATCATAAACGGAAACTGGGCCATCGACCGGCCAGGAAAGTACGAGGGAGGGGGGACCATGTTCACATACCGGCGGCCCAATGAAATCAGCAGCACAGCTGGAGAGTCCTTTCTGGCAGAGGGGCCGACCAATGAAGTCCTGGACGTCTATATGATCTACCAGCAGCCCAATCCTGGagtgcattatgaatacatCCTTCCATCAGAAAACTCAGTTTTGCAGGGCAGTGCAGATGATGCAGGTAACACAGTGACCAGTGAAACAGGATATGATCAGTACGGTCGGCCGTCTCAGGAAGGATACGAACAAGGAGGAGGACACAGGTACCCTCCTCACACACCCGACAACCAGGTACCTGCAGCCCAGCCCCCacgcagacagagagagcataACTGGAAACTTATTGGAACAACTGACTGCAGCGCCTCCTGTGGTAGAGGTAGCAGGTATACTGTGTTTGGCTGTGTTCACCGCATCACTCACGACCGTGTGTCGGACACTCTGTGTGACAGCAGTACCAAGCCCAGCGCTCAGGAGGAGCCCTGCAACGTCCAGCCATGCCCTGCATTTTGGGATATTGGCGAGTGGTCAGAGTGCAGTAAGACGTGTGGCCTCGGCATGCAGCACCGTCAGATCCTCTGCCGCCAGGTTTACGCCAACCGCACCCTCAACGTGCAGTCCAGCCGCTGCCGCCACCTCGAGCGCCCCGAGAGTAGCGGCACCTGCCAAATGAAGATCTGCAGCGAGTGGCAGATCCGCTCCGAGTGGAGCCCTTGCTCGGTGCCCTGTGGGGTGGGTCAGAGGTCGCGGGAGGTGCGCTGCGTCAGTAACGTGGGTGATTTTGTGGAGGATGAGGAGTGTAACATGAAGCTTCGTCCCAGCGATGCGGAGAACTGTGACATGGGACCGTGTGCAAAGAGCTGGTTCCACACAGACTGGGCCAACAGAtgctctGCAGAGTGTGGGATGGGTGTACGGAGTCGTAGTGTGGTTTGTCTTATTAACCACATCAGCAGTCTGCCTCTAGAAGGCTGTGGGTCAGAGCGCCCCCCAGAGGTTCAGGCCTGCAACAACGGGCCCTGTGAGAGCCGCACTGAGTGGTTCACTGGGCCGTGGGGTCAGTGCTCTGCAGAGTGTGGAACAGGCAGCCAGCAGAGGGCTGTAGTGTGTCTGATGAAGTCGGATGAAGGATATAATGTGATGCCTCCGTATGAATGCTCTTCCTTGGACAAGCCCCTCGGTCAGCAGAGCTGCCACATGAAAGCCTGTGGAGCCAAGTGGTACTACACGTCCTGGAGTGCATGCTCAAAGACGTGTGAGGGGGGGTTCCGTGTACGAGAAGTGCGCTGTCTCTCTGATGAAATGACGCCGAGTGAGGGATGTGAAGAAGGACTGAAACCAGAGGAGAAAGAAGAGTGTAACACTCAGCCGTGTGTTCCACAAATAGATGAAAACTGTCGAGATAAGTACTTCAACTGTAATGTGGTGGTCCAGGCGCgcctgtgtgtgtataactACTACAAGATGGCGTGCTGTGCCTCCTGCACACGCGTGGCACAGCGACAGTCAGCATCCAGAAGCTACAGATAGGACTGAGCCTCTGGGAGCTTCACCCACCTCCAGCCTGCCACTAGAGGGTGCCATGAGCAGAGAAACAGCATCACTCCGAGAGAAGCAGCTTTGGGGGCTGTCAAACAAACAATGGGGTCACGAGGAGAAAATAATTTTGACGCAGCTTTATGGGAACTGAAAAAGTTGGATAACGCTGTGAAGGAACTTTCTAGAGGACTCGTTTTTGGCCGAGGGTTCTGACCTGGGACTTCAGAAGCAGAGCGTCTTGGATTTTGATTctcctggatttaactaagtgtAGTCGGTCATGGGACACTTGTGTAAGAGTGATGACCACAGTGACTCAAAGTGGCCCATCGGGGTCATTAAAcggtgcttttttattattaactcaAGGTGAAGAATCTGAGAGATTCTTACAGAATTTCAcagaacatgtgtgtgtgtgtgtgtatatagtgatCTACAAATGCAAACCCAGCAAATCAACAGCATTCATACCTGAAAATATAATTCACTGATtaaatacaacagaaaaaactacagaaaagctgccaaaccttttttttcaggCATTCTGCTAATAAGCTCTGAcgaatctgatttttttacttCAGGTTCTTAAGTTATGATACTTACTTAAGATACTTACATACCCAGCCCAGTTATTGGTAATCAAATGTTTaacccattcattcatccatccgtCTAATCAGCTTCTTCCTGATACAGAACCTAACCTGAAATTATTGGGTGCAAATTAGAAATACCCTCTGAAAGGTGCTTCATTCAATCACATGGTGCCACACATATACAATCACTCACAATTTTAAACCTAGTGCTCATTTTAAATCTTTTAGAAGCTGTACAAAACTACTGTGACAAAAACACCCAAACTCATAATATTATaatgaaattatataaaaattaagctttttaaacaatttctgaaaattaaattaatcagtTGATCCAACTAGTCAAAAACAGACTTATTCAGttgaaattataaattaaaatgtttttatattaatttttcacAATAACCATTTTTACAAATGATGACAGAATAATTCCACATTAGTGATCTTTATTGCATTCAACCCACAGCCACACTCAGCGCATCAAAATAAGCTGTAATCTGTCCTACAGCCTTCAACACTATCTAACCATATAGGGGATGGTAGTATGGGAAGAACACTACACAGTAATGGTGAATAAAGGGAAAAGACACACCCAGTACTAAAATACTATCTAATATCAAGGTCACACTGCTCAAAAAGTGTACCCAAAATTAGTTCTGGGCACAGCCCTGTCAGATCATACTAAATCTATAAATATAAGATAATTCTATGTGCAAATTAATTAGATTGTGTAtgcaaaaaagtattaaaaaacactagATTCATTGGGTTTCATACCAGCATATTTTCTCTTTATGTTAGACCAACAGCTTCTCAAAACCGTTTTCTTTAGTGCAGACACATAGagaacacacaccacatacCCCCACAGACAGTGACTGAAGCAGTGATCGAACCCGCATAAAAAAAACGTAGGTTACAcgggacataaaaaaaaaaaacgtataagCTTCCAagtctacactctaaaaaataagGTGAAATATGTGATTTAAACCAAATTTTAGTTATACTACACGTGTCAAAGCTCTTTCTACAATGTTGGTTTATAAAGCTTTCCTATaaggctcctggtaccatatatttgcatattgggtgtggcctctcccttacttaccatctttgtgttctATGTTGCTCAAAACTACCTTATCTTAGACATGCGTGAGACATTGGTGAGATGTGTTTCTTAATTGCCAATTCTCTATGTTGTAGGACTGTGGTTGTTTTCTAGCTTTGGCTCAGCTAAACCTGAATTtcaagttttttatatatttaccagTTATTCAAGTCAAAATAATAAGTGAATTAAGTTTAACCTTTTTTATAGTCATCTGTTGTTTATCATGAAACTACAGGTGCCATGCTAATACTCCTAAATTCACTACGGTTCCCACAATACCATTCAGTTCCAATATCTCACAACTTCTTAAATTTAGTATTTGTGCATACTTTGTATTTTCTATGCAACAGCATGCACTGAACCTGGTCTGTTACACTATTTTACtcttcagtgtttttcaatttcatatttttaccaAAGGGGTTGCCAAATCCTCAGATTTTACACAGAAtggatttaatataaaaataaaaataaaagtttttttttttaaatcagtaataCTAATGATACTGCATACTGTGTTTCTTATCTACATTGAACATCCACTCTAAAACAAGTCTTATTAAAAACTGATATACCAAAATAATCCAGATAATGATGATACTTTCAGTGTGGATTAAATAGATCTTTATTTCCAggttatgttttatttgtacattaattccagttacttttttttttaaagtatataacAATGTACAGGGTCATTCTTATACCCTCATAATGTCAAAGAAGCCCCTAAGAATTAGAAAACTAGGAAGcagattttactatttttttttttttttttgtatctcagGAACAGAGTCTGATTTTCAGGTTCATATACAAGCATTTCTTTTACAGACAGACGAGCAGCTGAGCAGAAAGCTAGTATTCAGATCTGTACCGGCCTTATAGCAGCTATAACATAAAGCCTTTATGACTATTCAGCTTCTTTATCATAACGATAGCTGAGATTTAGAACAGATGTACTGTACCTGTTTATAAGGAGAAAGTCAACATAGGAGAACTGAGGTTTTGCAGCTGTATTGTATGTATAAGCACATAGACTGACAGCTATACAGTGTATAAACATAACCACTAATTtatatttctgtatgttttgtttaattcagTGATATTTATATGGTGAAGCTATTCAGACATGTTTACAGTTGTAATGGTTTGTTTATCACAACACTCAGCCTCATCATAATCCATTCAGagaatgttttactgttttatagaACCGATTAAAGCCTTACGATTGAAAAATCAA
>XM_022679830.1
gtgtgtgtgtgtgtgtgttggagctgTTGCTGGTCTCATGCTCAGGGAACTGTACGGATCAGAGTCATGGAGGAGGTGAAGGTGGGGGGCTGCAGGGGGTCTGTCTGCCTTTTTATATTTGCTGTAAACTTTAAATCAGCTGGAACTGAATGAATAACATCTCCATTAGAGGAGCGCGCGCTCTGGAGGAACCGCAGGCACGGTAGAGCTGCCCACTTTCTCTCCAGTATGAGCAGAAGAGTCTCCATGGTGAGTTTCGCCATGGTTATGGCCCTGCTTTGGTCAATCCCCACTGACTGTCAGCTCCCAGCAAACCACAAGAAGGTTTCTCCTAGGTCAGAATCCCAGCCGGGAGTTAATGATGACGTCCCTCAGGGGTCGTGGGGCTCCTGGGGCCCATGGGGTGAATGTTCCCGCTCCTGTGGTGGGGGGGTCCACCAGCAAACGAGGCCGTGCCTCCCAACCGTCACCCCTCTAGCTGCAGCATACACTCCCAGACAGGCTCCTCATGTGGGGCACCAGGAACCGGGACACGTGGAATCAGCCTTGAGGCCCTCTGTGCCAGTGCATCGCGGGAATACACACCTCACCAGCCGTGGGCAGCCTAGGAAGCAGCAGAATGAAGTACGACCTGGGCGACGgcGGAGCAGCAGCCGCATCACTCCTGGAATGTACGGCTACGGGAAGATGCCGTATGTGATGTCCTCACAGAGCGACCAAAATATACACACCAACCTGCACCAGTATCGCCCCCCATCCGACTACAGACACCACAGCTACAgacgacagcagcagcagcagcagctgaacaACAGAAATACTCACCAAATCACCCACCACAACTCTCACCACAACACCAACCAGCAGACCTGGGTTCCTTTATATCAGCCCAGCTCTGGCCTTCAGAGTCAAACCGAGCAGCAGTATCCTACTGGCACTCAGACGTCAGGGTCCAGCCAAACGTCCACTCAGACCAGACCCTACAACCCCCTGCCAGCTTCCTCCTGCTCCGGAGAGTCCAGCCTGTACAAGAAGTGCAACACAAATCCCTGTCCTCCAGCCAGTAAGCCTGTCAGAGACGTCCAGTGTTCCTCCCATAACAGCCACCCGTTTATGGGCCGACTCTACGAATGGGAACCTTTCAATGAGGTTCCTGAAGATCAGCTGTGTGAGCTAAACTGCCGGGCGATTGGGTACCGCTTCTACGTCCGGCTGTCAGAGCGGGTCATCGATGGGACTCCATGTGGACAGAATGAGACGTCCATCTGTGTGGCTGGGAAATGTCAGagTCCTGGCTGTGATGAGTTCCTGGGCTCGGGGAAGGAGATGGATAAGTGTGGGGTGTGTGGAGGGGATAACACCGCCTGCAAGCTGGTCTCTGGCATGTTCCAGCACAGCCTGTCCAAAGTGGGCTACCACAAGATCGTGGAGATTCCAGAGGGAGCTACCAAGATCAACGTCACCGAGATGGTCAAGAGCCAGAACTACCTTGCCCTGCGGAGCCGTGCTGGACGATCCATCATAAACGGAAACTGGGCCATCGACCGGCCAGGAAAGTACGAGGGAGGGGGGACCATGTTCACATACCGGCGGCCCAATGAAATCAGCAGCACAGCTGGAGAGTCCTTTCTGGCAGAGGGGCCGACCAATGAAGTCCTGGACGTCTATATGATCTACCAGCAGCCCAATCCTGGagtgcattatgaatacatCCTTCCATCAGAAAACTCAGTTTTGCAGGGCAGTGCAGATGATGGTAACACAGTGACCAGTGAAACAGGATATGATCAGTACGGTCGGCCGTCTCAGGAAGGATACGAACAAGGAGGAGGACACAGGTACCCTCCTCACACACCCGACAACCAGGTACCTGCAGCCCAGCCCCCacgcagacagagagagcataACTGGAAACTTATTGGAACAACTGACTGCAGCGCCTCCTGTGGTAGAGGTAGCAGGTATACTGTGTTTGGCTGTGTTCACCGCATCACTCACGACCGTGTGTCGGACACTCTGTGTGACAGCAGTACCAAGCCCAGCGCTCAGGAGGAGCCCTGCAACGTCCAGCCATGCCCTGCATTTTGGGATATTGGCGAGTGGTCAGAGTGCAGTAAGACGTGTGGCCTCGGCATGCAGCACCGTCAGATCCTCTGCCGCCAGGTTTACGCCAACCGCACCCTCAACGTGCAGTCCAGCCGCTGCCGCCACCTCGAGCGCCCCGAGAGTAGCGGCACCTGCCAAATGAAGATCTGCAGCGAGTGGCAGATCCGCTCCGAGTGGAGCCCTTGCTCGGTGCCCTGTGGGGTGGGTCAGAGGTCGCGGGAGGTGCGCTGCGTCAGTAACGTGGGTGATTTTGTGGAGGATGAGGAGTGTAACATGAAGCTTCGTCCCAGCGATGCGGAGAACTGTGACATGGGACCGTGTGCAAAGAGCTGGTTCCACACAGACTGGGCCAACAGAtgctctGCAGAGTGTGGGATGGGTGTACGGAGTCGTAGTGTGGTTTGTCTTATTAACCACATCAGCAGTCTGCCTCTAGAAGGCTGTGGGTCAGAGCGCCCCCCAGAGGTTCAGGCCTGCAACAACGGGCCCTGTGAGAGCCGCACTGAGTGGTTCACTGGGCCGTGGGGTCAGTGCTCTGCAGAGTGTGGAACAGGCAGCCAGCAGAGGGCTGTAGTGTGTCTGATGAAGTCGGATGAAGGATATAATGTGATGCCTCCGTATGAATGCTCTTCCTTGGACAAGCCCCTCGGTCAGCAGAGCTGCCACATGAAAGCCTGTGGAGCCAAGTGGTACTACACGTCCTGGAGTGCATGCTCAAAGACGTGTGAGGGGGGGTTCCGTGTACGAGAAGTGCGCTGTCTCTCTGATGAAATGACGCCGAGTGAGGGATGTGAAGAAGGACTGAAACCAGAGGAGAAAGAAGAGTGTAACACTCAGCCGTGTGTTCCACAAATAGATGAAAACTGTCGAGATAAGTACTTCAACTGTAATGTGGTGGTCCAGGCGCgcctgtgtgtgtataactACTACAAGATGGCGTGCTGTGCCTCCTGCACACGCGTGGCACAGCGACAGTCAGCATCCAGAAGCTACAGATAGGACTGAGCCTCTGGGAGCTTCACCCACCTCCAGCCTGCCACTAGAGGGTGCCATGAGCAGAGAAACAGCATCACTCCGAGAGAAGCAGCTTTGGGGGCTGTCAAACAAACAATGGGGTCACGAGGAGAAAATAATTTTGACGCAGCTTTATGGGAACTGAAAAAGTTGGATAACGCTGTGAAGGAACTTTCTAGAGGACTCGTTTTTGGCCGAGGGTTCTGACCTGGGACTTCAGAAGCAGAGCGTCTTGGATTTTGATTctcctggatttaactaagtgtAGTCGGTCATGGGACACTTGTGTAAGAGTGATGACCACAGTGACTCAAAGTGGCCCATCGGGGTCATTAAAcggtgcttttttattattaactcaAGGTGAAGAATCTGAGAGATTCTTACAGAATTTCAcagaacatgtgtgtgtgtgtgtgtatatagtgatCTACAAATGCAAACCCAGCAAATCAACAGCATTCATACCTGAAAATATAATTCACTGATtaaatacaacagaaaaaactacagaaaagctgccaaaccttttttttcaggCATTCTGCTAATAAGCTCTGAcgaatctgatttttttacttCAGGTTCTTAAGTTATGATACTTACTTAAGATACTTACATACCCAGCCCAGTTATTGGTAATCAAATGTTTaacccattcattcatccatccgtCTAATCAGCTTCTTCCTGATACAGAACCTAACCTGAAATTATTGGGTGCAAATTAGAAATACCCTCTGAAAGGTGCTTCATTCAATCACATGGTGCCACACATATACAATCACTCACAATTTTAAACCTAGTGCTCATTTTAAATCTTTTAGAAGCTGTACAAAACTACTGTGACAAAAACACCCAAACTCATAATATTATaatgaaattatataaaaattaagctttttaaacaatttctgaaaattaaattaatcagtTGATCCAACTAGTCAAAAACAGACTTATTCAGttgaaattataaattaaaatgtttttatattaatttttcacAATAACCATTTTTACAAATGATGACAGAATAATTCCACATTAGTGATCTTTATTGCATTCAACCCACAGCCACACTCAGCGCATCAAAATAAGCTGTAATCTGTCCTACAGCCTTCAACACTATCTAACCATATAGGGGATGGTAGTATGGGAAGAACACTACACAGTAATGGTGAATAAAGGGAAAAGACACACCCAGTACTAAAATACTATCTAATATCAAGGTCACACTGCTCAAAAAGTGTACCCAAAATTAGTTCTGGGCACAGCCCTGTCAGATCATACTAAATCTATAAATATAAGATAATTCTATGTGCAAATTAATTAGATTGTGTAtgcaaaaaagtattaaaaaacactagATTCATTGGGTTTCATACCAGCATATTTTCTCTTTATGTTAGACCAACAGCTTCTCAAAACCGTTTTCTTTAGTGCAGACACATAGagaacacacaccacatacCCCCACAGACAGTGACTGAAGCAGTGATCGAACCCGCATAAAAAAAACGTAGGTTACAcgggacataaaaaaaaaaaacgtataagCTTCCAagtctacactctaaaaaataagGTGAAATATGTGATTTAAACCAAATTTTAGTTATACTACACGTGTCAAAGCTCTTTCTACAATGTTGGTTTATAAAGCTTTCCTATaaggctcctggtaccatatatttgcatattgggtgtggcctctcccttacttaccatctttgtgttctATGTTGCTCAAAACTACCTTATCTTAGACATGCGTGAGACATTGGTGAGATGTGTTTCTTAATTGCCAATTCTCTATGTTGTAGGACTGTGGTTGTTTTCTAGCTTTGGCTCAGCTAAACCTGAATTtcaagttttttatatatttaccagTTATTCAAGTCAAAATAATAAGTGAATTAAGTTTAACCTTTTTTATAGTCATCTGTTGTTTATCATGAAACTACAGGTGCCATGCTAATACTCCTAAATTCACTACGGTTCCCACAATACCATTCAGTTCCAATATCTCACAACTTCTTAAATTTAGTATTTGTGCATACTTTGTATTTTCTATGCAACAGCATGCACTGAACCTGGTCTGTTACACTATTTTACtcttcagtgtttttcaatttcatatttttaccaAAGGGGTTGCCAAATCCTCAGATTTTACACAGAAtggatttaatataaaaataaaaataaaagtttttttttttaaatcagtaataCTAATGATACTGCATACTGTGTTTCTTATCTACATTGAACATCCACTCTAAAACAAGTCTTATTAAAAACTGATATACCAAAATAATCCAGATAATGATGATACTTTCAGTGTGGATTAAATAGATCTTTATTTCCAggttatgttttatttgtacattaattccagttacttttttttttaaagtatataacAATGTACAGGGTCATTCTTATACCCTCATAATGTCAAAGAAGCCCCTAAGAATTAGAAAACTAGGAAGcagattttactatttttttttttttttttgtatctcagGAACAGAGTCTGATTTTCAGGTTCATATACAAGCATTTCTTTTACAGACAGACGAGCAGCTGAGCAGAAAGCTAGTATTCAGATCTGTACCGGCCTTATAGCAGCTATAACATAAAGCCTTTATGACTATTCAGCTTCTTTATCATAACGATAGCTGAGATTTAGAACAGATGTACTGTACCTGTTTATAAGGAGAAAGTCAACATAGGAGAACTGAGGTTTTGCAGCTGTATTGTATGTATAAGCACATAGACTGACAGCTATACAGTGTATAAACATAACCACTAATTtatatttctgtatgttttgtttaattcagTGATATTTATATGGTGAAGCTATTCAGACATGTTTACAGTTGTAATGGTTTGTTTATCACAACACTCAGCCTCATCATAATCCATTCAGagaatgttttactgttttatagaACCGATTAAAGCCTTACGATTGAAAAATCAA
>XM_022679831.1
ctctctgttgctcagTGTTTTTGGCAGTGGTAGAGACGCTGGCTGTGGGTCGGGGCGGCTCCTGGGCTTGTCTGAATGTGTGCTGAGTTGAATGAAGGAGgcagaggatgagagagagagagtgagagagagagagagagagagagagagagagagagtgagtgagtgagtggtcgACATTGAGAGAAAGCTGACTAAGGAGCAGGACGTAGGAAGTGTGTGgatagctgtttttctgctgttaTCCTGCTggttttctgctgctgctggtgatcTTCTGCAATGCTGTCAGTTCTggctcttctgctgctgctcggTCTTCACACACGGATACTGGTCAAGCCCTGGCCACAGagTCCTGGCTGTGATGAGTTCCTGGGCTCGGGGAAGGAGATGGATAAGTGTGGGGTGTGTGGAGGGGATAACACCGCCTGCAAGCTGGTCTCTGGCATGTTCCAGCACAGCCTGTCCAAAGTGGGCTACCACAAGATCGTGGAGATTCCAGAGGGAGCTACCAAGATCAACGTCACCGAGATGGTCAAGAGCCAGAACTACCTTGCCCTGCGGAGCCGTGCTGGACGATCCATCATAAACGGAAACTGGGCCATCGACCGGCCAGGAAAGTACGAGGGAGGGGGGACCATGTTCACATACCGGCGGCCCAATGAAATCAGCAGCACAGCTGGAGAGTCCTTTCTGGCAGAGGGGCCGACCAATGAAGTCCTGGACGTCTATATGATCTACCAGCAGCCCAATCCTGGagtgcattatgaatacatCCTTCCATCAGAAAACTCAGTTTTGCAGGGCAGTGCAGATGATGCAGGTAACACAGTGACCAGTGAAACAGGATATGATCAGTACGGTCGGCCGTCTCAGGAAGGATACGAACAAGGAGGAGGACACAGGTACCCTCCTCACACACCCGACAACCAGGTACCTGCAGCCCAGCCCCCacgcagacagagagagcataACTGGAAACTTATTGGAACAACTGACTGCAGCGCCTCCTGTGGTAGAGGTAGCAGGTATACTGTGTTTGGCTGTGTTCACCGCATCACTCACGACCGTGTGTCGGACACTCTGTGTGACAGCAGTACCAAGCCCAGCGCTCAGGAGGAGCCCTGCAACGTCCAGCCATGCCCTGCATTTTGGGATATTGGCGAGTGGTCAGAGTGCAGTAAGACGTGTGGCCTCGGCATGCAGCACCGTCAGATCCTCTGCCGCCAGGTTTACGCCAACCGCACCCTCAACGTGCAGTCCAGCCGCTGCCGCCACCTCGAGCGCCCCGAGAGTAGCGGCACCTGCCAAATGAAGATCTGCAGCGAGTGGCAGATCCGCTCCGAGTGGAGCCCTTGCTCGGTGCCCTGTGGGGTGGGTCAGAGGTCGCGGGAGGTGCGCTGCGTCAGTAACGTGGGTGATTTTGTGGAGGATGAGGAGTGTAACATGAAGCTTCGTCCCAGCGATGCGGAGAACTGTGACATGGGACCGTGTGCAAAGAGCTGGTTCCACACAGACTGGGCCAACAGAtgctctGCAGAGTGTGGGATGGGTGTACGGAGTCGTAGTGTGGTTTGTCTTATTAACCACATCAGCAGTCTGCCTCTAGAAGGCTGTGGGTCAGAGCGCCCCCCAGAGGTTCAGGCCTGCAACAACGGGCCCTGTGAGAGCCGCACTGAGTGGTTCACTGGGCCGTGGGGTCAGTGCTCTGCAGAGTGTGGAACAGGCAGCCAGCAGAGGGCTGTAGTGTGTCTGATGAAGTCGGATGAAGGATATAATGTGATGCCTCCGTATGAATGCTCTTCCTTGGACAAGCCCCTCGGTCAGCAGAGCTGCCACATGAAAGCCTGTGGAGCCAAGTGGTACTACACGTCCTGGAGTGCATGCTCAAAGACGTGTGAGGGGGGGTTCCGTGTACGAGAAGTGCGCTGTCTCTCTGATGAAATGACGCCGAGTGAGGGATGTGAAGAAGGACTGAAACCAGAGGAGAAAGAAGAGTGTAACACTCAGCCGTGTGTTCCACAAATAGATGAAAACTGTCGAGATAAGTACTTCAACTGTAATGTGGTGGTCCAGGCGCgcctgtgtgtgtataactACTACAAGATGGCGTGCTGTGCCTCCTGCACACGCGTGGCACAGCGACAGTCAGCATCCAGAAGCTACAGATAGGACTGAGCCTCTGGGAGCTTCACCCACCTCCAGCCTGCCACTAGAGGGTGCCATGAGCAGAGAAACAGCATCACTCCGAGAGAAGCAGCTTTGGGGGCTGTCAAACAAACAATGGGGTCACGAGGAGAAAATAATTTTGACGCAGCTTTATGGGAACTGAAAAAGTTGGATAACGCTGTGAAGGAACTTTCTAGAGGACTCGTTTTTGGCCGAGGGTTCTGACCTGGGACTTCAGAAGCAGAGCGTCTTGGATTTTGATTctcctggatttaactaagtgtAGTCGGTCATGGGACACTTGTGTAAGAGTGATGACCACAGTGACTCAAAGTGGCCCATCGGGGTCATTAAAcggtgcttttttattattaactcaAGGTGAAGAATCTGAGAGATTCTTACAGAATTTCAcagaacatgtgtgtgtgtgtgtgtatatagtgatCTACAAATGCAAACCCAGCAAATCAACAGCATTCATACCTGAAAATATAATTCACTGATtaaatacaacagaaaaaactacagaaaagctgccaaaccttttttttcaggCATTCTGCTAATAAGCTCTGAcgaatctgatttttttacttCAGGTTCTTAAGTTATGATACTTACTTAAGATACTTACATACCCAGCCCAGTTATTGGTAATCAAATGTTTaacccattcattcatccatccgtCTAATCAGCTTCTTCCTGATACAGAACCTAACCTGAAATTATTGGGTGCAAATTAGAAATACCCTCTGAAAGGTGCTTCATTCAATCACATGGTGCCACACATATACAATCACTCACAATTTTAAACCTAGTGCTCATTTTAAATCTTTTAGAAGCTGTACAAAACTACTGTGACAAAAACACCCAAACTCATAATATTATaatgaaattatataaaaattaagctttttaaacaatttctgaaaattaaattaatcagtTGATCCAACTAGTCAAAAACAGACTTATTCAGttgaaattataaattaaaatgtttttatattaatttttcacAATAACCATTTTTACAAATGATGACAGAATAATTCCACATTAGTGATCTTTATTGCATTCAACCCACAGCCACACTCAGCGCATCAAAATAAGCTGTAATCTGTCCTACAGCCTTCAACACTATCTAACCATATAGGGGATGGTAGTATGGGAAGAACACTACACAGTAATGGTGAATAAAGGGAAAAGACACACCCAGTACTAAAATACTATCTAATATCAAGGTCACACTGCTCAAAAAGTGTACCCAAAATTAGTTCTGGGCACAGCCCTGTCAGATCATACTAAATCTATAAATATAAGATAATTCTATGTGCAAATTAATTAGATTGTGTAtgcaaaaaagtattaaaaaacactagATTCATTGGGTTTCATACCAGCATATTTTCTCTTTATGTTAGACCAACAGCTTCTCAAAACCGTTTTCTTTAGTGCAGACACATAGagaacacacaccacatacCCCCACAGACAGTGACTGAAGCAGTGATCGAACCCGCATAAAAAAAACGTAGGTTACAcgggacataaaaaaaaaaaacgtataagCTTCCAagtctacactctaaaaaataagGTGAAATATGTGATTTAAACCAAATTTTAGTTATACTACACGTGTCAAAGCTCTTTCTACAATGTTGGTTTATAAAGCTTTCCTATaaggctcctggtaccatatatttgcatattgggtgtggcctctcccttacttaccatctttgtgttctATGTTGCTCAAAACTACCTTATCTTAGACATGCGTGAGACATTGGTGAGATGTGTTTCTTAATTGCCAATTCTCTATGTTGTAGGACTGTGGTTGTTTTCTAGCTTTGGCTCAGCTAAACCTGAATTtcaagttttttatatatttaccagTTATTCAAGTCAAAATAATAAGTGAATTAAGTTTAACCTTTTTTATAGTCATCTGTTGTTTATCATGAAACTACAGGTGCCATGCTAATACTCCTAAATTCACTACGGTTCCCACAATACCATTCAGTTCCAATATCTCACAACTTCTTAAATTTAGTATTTGTGCATACTTTGTATTTTCTATGCAACAGCATGCACTGAACCTGGTCTGTTACACTATTTTACtcttcagtgtttttcaatttcatatttttaccaAAGGGGTTGCCAAATCCTCAGATTTTACACAGAAtggatttaatataaaaataaaaataaaagtttttttttttaaatcagtaataCTAATGATACTGCATACTGTGTTTCTTATCTACATTGAACATCCACTCTAAAACAAGTCTTATTAAAAACTGATATACCAAAATAATCCAGATAATGATGATACTTTCAGTGTGGATTAAATAGATCTTTATTTCCAggttatgttttatttgtacattaattccagttacttttttttttaaagtatataacAATGTACAGGGTCATTCTTATACCCTCATAATGTCAAAGAAGCCCCTAAGAATTAGAAAACTAGGAAGcagattttactatttttttttttttttttgtatctcagGAACAGAGTCTGATTTTCAGGTTCATATACAAGCATTTCTTTTACAGACAGACGAGCAGCTGAGCAGAAAGCTAGTATTCAGATCTGTACCGGCCTTATAGCAGCTATAACATAAAGCCTTTATGACTATTCAGCTTCTTTATCATAACGATAGCTGAGATTTAGAACAGATGTACTGTACCTGTTTATAAGGAGAAAGTCAACATAGGAGAACTGAGGTTTTGCAGCTGTATTGTATGTATAAGCACATAGACTGACAGCTATACAGTGTATAAACATAACCACTAATTtatatttctgtatgttttgtttaattcagTGATATTTATATGGTGAAGCTATTCAGACATGTTTACAGTTGTAATGGTTTGTTTATCACAACACTCAGCCTCATCATAATCCATTCAGagaatgttttactgttttatagaACCGATTAAAGCCTTACGATTGAAAAATCAA

Function


symbol description
thsd4 Predicted to enable hydrolase activity. Predicted to be an extracellular matrix structural constituent. Predicted to act upstream of or within elastic fiber assembly. Located in collagen-containing extracellular matrix and extracellular exosome.

NR:

description
PREDICTED: thrombospondin type-1 domain-containing protein 4

GO: NA

KEGG:

id description
K23377 THSD4, ADAMTSL6; thrombospondin type-1 domain-containing protein 4

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_007251880.3 False 2771 mRNA 0.56 15 29606057 29709112
XM_022679829.1 True 6121 mRNA 0.45 18 29606057 29715602
XM_022679830.1 False 6118 mRNA 0.45 18 29606057 29715602
XM_022679831.1 False 5188 mRNA 0.43 12 29676180 29715602

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
lrrc49 lrrc49 coding upstream 7150 29521777 ~ 29598907 (+)
tm2d3 tm2d3,LOC108439026 coding upstream 120043 29476685 ~ 29486014 (+)
LOC103023825 tarsl2,LOC108413626 coding upstream 132376 29449150 ~ 29473681 (+)
LOC103039409 NA coding upstream 204476 29398412 ~ 29401581 (+)
LOC103039106 cplx3b,cplx3,cplx3a,LOC108439029,LOC103033419,LOC108264002,LOC107753702,LOC107665490 coding upstream 214091 29371065 ~ 29391966 (+)
LOC111194806 NA coding downstream 13748 29729350 ~ 29734672 (+)
LOC111194842 NA coding downstream 25459 29741061 ~ 29743027 (+)
LOC107196975 NA coding downstream 160172 29875774 ~ 29884606 (+)
LOC103032796 arpp19a,LOC108413875,LOC107704273,LOC108264505,LOC107676482,LOC107712699,LOC103358163 coding downstream 174291 29889893 ~ 29898429 (+)
myo5a myo5a coding downstream 185714 29901316 ~ 30027748 (+)
G161484 NA non-coding upstream 73811 29502120 ~ 29532246 (+)
G161476 NA non-coding upstream 115237 29483514 ~ 29490820 (+)
G161425 NA non-coding upstream 251766 29333111 ~ 29354291 (+)
LOC111194801 NA non-coding upstream 391322 29210264 ~ 29214735 (+)
G161417 NA non-coding upstream 397767 29207963 ~ 29208290 (+)
G161511 NA non-coding downstream 8292 29723894 ~ 29724121 (+)
G161532 NA non-coding downstream 98019 29813621 ~ 29816600 (+)
LOC111194812 NA non-coding downstream 155308 29870910 ~ 29874312 (+)
G161599 NA non-coding downstream 249699 29965301 ~ 30033221 (+)
LOC111194809 NA non-coding downstream 315321 30030923 ~ 30033401 (+)
G161331 NA other upstream 489262 29070820 ~ 29116795 (+)
fam219b fam219b other upstream 847050 28745696 ~ 28759007 (+)
G161292 rap2b,LOC107757383 other upstream 981272 28622128 ~ 28624785 (+)
c18h3orf33 NA other upstream 1809553 27784896 ~ 27796504 (+)
ccnl1 ccnl1,LOC107684610,LOC107557837,LOC107710830 other upstream 2486793 27109671 ~ 27119264 (+)
LOC103042463 tmod3,LOC108440576,LOC108264495 other downstream 638084 30353686 ~ 30414212 (+)
dhdds dhdds,LOC106582847,LOC106605152 other downstream 1138956 30854558 ~ 30894506 (+)
hmgn2 NA other downstream 1159436 30875038 ~ 30878327 (+)
efhb NA other downstream 1869144 31584746 ~ 31605490 (+)
G162017 NA other downstream 2353260 32068862 ~ 32148190 (+)

Expression



Co-expression Network