mpzl1 (LOC108423808)


Basic Information

Item Value
gene id mpzl1
gene name LOC108423808
gene type coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035916.1
NCBI id CM008319.1
chromosome length 36262418
location 31295065 ~ 31314439 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>XM_007247276.3
GCCGTGTGTAAAGGCTTCTTTCACACAGAGAAATCCCAGGAAGACACTCTCAGACTGTAGGGTGTAAACACACGGCTTCAACAGAGATCTGGCCTTTTATCTATGTACTCCTAAGGATGGAACTGCGGCTCTCAAATACTGCATATCACCTTGTTTTAACTGGCAGCTTCTTGATATGCGCCATCATCGGTATGCACCCTGCTGCTGGTATAGATGTGAGTACTGCTGGTGAGATGTTTGTAGAAAATGGAACCACAGGGACGCTTAAGTGTTCATTCAAATCCACTGAAGTGGTCAGTAGTCAAGCATCAGTGTCCTGGTCCTTCATTCCCGAGGGGTCCCCAGAGTCTACTGGCGTAGCTatcTTTTACTATACTGGTGGAAGAGCTTTCCCAGACAACAGTCCACAATTTAAGGCCAGAGTACAATGGGCGGGTGATATGAACAAAAAGGATGCATCTATCCGCGTCAATCAGATGCAGTTCTTGGATAATGGAACCTACTCCTGTGACGTGAAGAACCCTCCAGATATAAGCGGTAAACCTTCACTGATTAAAGTGTGGGTTGTAAATAGAGaAGCACTCCCTCAGACAAGCCCAGTTGTGATAGTGGGTGCTGTCATTGGTGCAATCATTGGAGTCATCATCATTGCATTTGTTGCATATCTGCTGATAAGATTAATACAGCCTCCTCGTGACTATGAAGGCTGCACCTCCATAGAGAGTGTAAGCACACAGCCTTCTCGACCGGGGAAGAAAGCCGAGTCCAGCACGGAGGGCTCGCGCTGTAGCAGTCCCTCAGCCCCTGTACAGGGCCCGGTGATATACGCCCAGCTGGATCACTCTGGCAGCAAGAATCAGAACTCCGTCCACAAGGTGGAGCCTGTGGTATATGCTGACATCCGTAAGAactaagaagagagagagaaaagagaaaacggAGACGGTGGTTTTGACACTCCACCAGCAACACTCCATTTCACTATAGGTCTCTATAGGTTTTATTTTCTAAGTGACAGTGTCTCATGCCAGTCATATCCATCCCCATATCTGCAGAGGCTTCAAACAGCTTAGCCCAACTAATCTCACACATCAAATACCTGCCACTAAGAATGTATAGTTACTGATTTTGCAGCCGTCCTCATCAGCTTCCCCTTCTCCCTCCTGTCACTGCATGCAGCTGACCgtgctacctccaccatgtttattTCAAAATGAGGGTACAACaatgacaacaaaaaaaaaatactgaaaacaaCTTCAGGGACAACGTTCCTATTACTGCCGCTGTGCTTTAACCCACTGACAAAACGACAAACATCAAATCCTAAAGGTGCCACATTGTATAATAGATGAATATATGTGTTGTAAATGTCTTACGTGATTCCGTAGGTTACTGACGTAGAAGTGATGGTAGTGATCATGGTAGAGACTAGCTTCCATTACTGACTTCTAACAAACAGGGCTGCAGCTCAGACCTCAGCAAAAACCCGACCCAATCACGAGCTCACGCTGGTACAGTACGtaagaattaattaattaattgtacaTACAGATAAATGTCTATGTGCAGTGTTGCATTGAATCTGAGCTATCACTAACAAACTGTGCTTCACTTTACaacttttttgtatatatatatataaatatataatttcatttttatttcattttaatagaGTAGTTAATAATAAGACTATACCCCAATTCAATTTCAAAGCCCACATGAAGCTGgatattaaccctcctgttatgttgcAGGTCAAATTGatccattttaaatttaatttaatttaaggttGTATCATATTTGGAGCATGATTTAGGCataattagtgtaattaatatcaattataaaaatgaatcCTTTGCAAAAGTCAGATTTTGTGCGCTATTTGTgaccattttaatacatttattaaaaaaatgacttttataaataaaatttaatgaaAATCTGTTAATCTGTTATTgacagcattattattattattattattattattattattattaaaatacacaggCAAAACAGGATAATTATCATAAGTAGCCACATTTACttaatcaaacttttttttttattatctgaaGTATTgattaaattcatatttattcagTGCAAAATGTTCCACTTTTGGATGGTTAAACATTAACCAGGTCAATTTGGCCTGGAAACATTATGGCTGCTCTATACAgctgaacataacaggagggttaaatcaCAAACAGTGAAGAAAATGGACAAAACCCTTACTTTAGATTGTGATATAATCCAAGACTAGACCTGACACATGTCTAGAAAGAGAGTCAACATCCTGTCTATAGTGCAAAGATTTTTTAATTACCTTTGCTCATCTGGTcggttgtgtttgtttttatattatttgtaggttttaatttttttcttatataacATTTGATTATGtggattctaaaaaaaaacacaatgccaaaattttaacatttccattttatttttattcctcCAAAGGCTAAAggctgcttcaagtgttgtggCTGCAGTTGGTATGATGTGTATTTATCTTAATGTGCTACAGGGTAGCAGtatcaatttgtttttattgttattttgtggTTCAATTTAAATCAGGATTAAAATAGGTCATGTACGAGAGTGCTATTATGCTATGTTCACGTTGCAAACCTTCAATCTTTCTGATTTAGTGGTTAATATTTGTTATCTGTGAGCCAGAAGCATCTGAGCCCCAAATCTAccctattaaataaaaaataagcgaACTATGACTGCATCTTAAATGGCTCCGAGTCTGCCAGTGCACTATTTGTCCAGTAGGGGTCAGTGAATACAGACTGAATGGCTTTTTGTCTAAGATGTAATGCACTGCTTGGGTACAGATGccactgtttttgtttgtttttctgttgttgttttttttttattgcacagAGCCATTTGAGATTCTGCCTTCGGTATTGGAGTAAAAAGAATGCTTTTGCAGAACAAAGCAATGACCTTATCTAATCCAAAGTGCCAGAAGTGTGGGGGTCTGAGAAGATTGCTAAAAGGTAGTTAATGATGCTGACCTTGTTACCACAGTGCATGTTTGCAGATATGGTTTGCGATGTCCAGACACACAAATCCAATCTCATTACTTGCAAATAAGAGTGCAGACAGGCATCTTAACGGATCTGATTTGACTGCAGTCAGCCATAGCCTAAGACATGTTTAACAAACAAAACTTCTCTCCATGTTGCATGTCATTTAAAAGCCCATCAGTCTAAACAGTAACTTTTTGTATCTATCTTTAGCATAGCACAGTAAGAggctgcacaaaaaaaaaaactactggtTGTTGcgtaataaattattgtgcattTTCCGTCCCACACAGCAGATTAAACCACATTAAAGACAGACTAAGTGGCGACATATTTGACTACaaatgtaaatgcatgtggCATGTTGTCACCCGGTATAAAGATGGTCATTAAGCTCACAAGCAaacaaatgtaaatgctttagAACTGGCTCAGGACAGATTTGCATCTCTTCAAATTCACAATTCACTAATGTATTTTAACCTTGCAATGTGAACATAGCTTTAGTAGCATATTTGGTGTCAGTAGGTCAATTTCAGAGTTCGATCCAAAGATACTGGTGAACTCATTATGCTGCGTTACTGCCTTTTTTGTTACATGCCAAAAGAATACTTGCCTTTAAGAAAAAGCCCAAACATTCCTTGTGTCAATTTCTTTATTCCAGGTTTAAGTCTTAAATATTTTGCACATTGTTGGGGGATTTAGTAAGTTTGAGACCtttgttttgttcttatttttgtttttaatgttttattattatgattatattttttttaaaggtgaaCACTATTGAATGAACGGTGAGCATAACCAAAATTACTAATGGaacaaaataacatagacattcCTTACAGTTGACACGATGCTGGACCTATCTGTCATGCAGTCTTGTGTTTGTagtagcatgtgtgtgtatagattaTTTTTCTACTTTAAAATCTCTTTTGTTGCCTATTAAATCTCAGTCGGTCTAAACCAATAAGGATTACGCTCTTAAGAGTGCAGTTTACAGCAGCATCGTGTTGTTCATATATGTGCCTGGTTCTACAAGGGTACTTGTATATAATACTGTACTTTTTGTTGGAAAGTATGCATTATGTCTTACAGCATGTTTTCTCTTCAAGCACTATCGTCCTTATGTTTCCTGTAGAGAGAAAATAGAGTGTTAATGCAGGACGTAACCATTCGTTTTAAAAACTGGAACATTGTGAATTAGTGCCTTTCGCATTTCATGTACTAACTCAAGTCATCCTCCACAGGCTCTGTGTATGTTCTACCCACTCTTATTTTGTATATGAAACTGTTTGTATCTgtctaatttttatatatatatataaaaatcagattcagtttaa

Function

NR:

description
PREDICTED: myelin protein zero-like protein 1

GO:

id name namespace
GO:0016020 membrane cellular_component

KEGG:

id description
K06770 MPZ; myelin protein zero

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_007247276.3 True 4438 mRNA 0.37 6 31295065 31314439

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
ets2 ets2 coding upstream 50181 31237788 ~ 31244884 (+)
kcnj15 kcnj15 coding upstream 178370 31112015 ~ 31116695 (+)
dyrk1a dyrk1a,dyrk1aa,LOC108411986,LOC107676490 coding upstream 344135 30935257 ~ 30950930 (+)
ttc3 NA coding upstream 370116 30876529 ~ 30924949 (+)
ripply3 NA coding upstream 440910 30850265 ~ 30854155 (+)
LOC103032011 NA coding downstream 34802 31349241 ~ 31360268 (+)
LOC103030242 chordc1 coding downstream 759188 32073627 ~ 32086443 (+)
LOC103040533 grm5,grm5a,LOC108423821,LOC107693909,LOC107720647,LOC107718729 coding downstream 797917 32112356 ~ 32187729 (+)
LOC103040837 rab38,LOC103040837,LOC108423822,LOC108277304,LOC107701102,LOC107718792,LOC107557212,LOC107693892 coding downstream 876409 32190848 ~ 32205776 (+)
map3k7cl map3k7cl coding downstream 966840 32281279 ~ 32298945 (+)
G180237 NA non-coding upstream 64428 31210212 ~ 31230637 (+)
G180233 NA non-coding upstream 174755 31119113 ~ 31120310 (+)
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G180174 NA non-coding upstream 309824 30985012 ~ 30985241 (+)
G180173 kcnj6,LOC107744206 non-coding upstream 321366 30964001 ~ 30973699 (+)
G180260 NA non-coding downstream 80547 31394986 ~ 31395348 (+)
G180263 NA non-coding downstream 108031 31422470 ~ 31423208 (+)
G180264 NA non-coding downstream 109173 31423612 ~ 31426111 (+)
G180278 emsy,LOC106603772 non-coding downstream 136865 31451304 ~ 31456528 (+)
G180280 nhlrc3 non-coding downstream 148866 31463305 ~ 31464839 (+)
G180235 erg other upstream 143970 31139344 ~ 31151095 (+)
LOC103038954 zgc:101846,LOC106525086,LOC108416226,LOC101161532 other upstream 3769624 27524302 ~ 27525441 (+)
rnasek rnasek,LOC107554319 other upstream 4378721 26913750 ~ 26916344 (+)
LOC103024073 LOC108424537 other upstream 4415982 26830637 ~ 26879083 (+)
smpd1 smpd1,LOC107718723,LOC107720657,LOC107556869 other upstream 6037596 25244161 ~ 25257469 (+)
G180266 NA other downstream 118759 31433198 ~ 31433909 (+)
G180460 cct8,LOC100304907,LOC107693911,LOC107701129 other downstream 950559 32264998 ~ 32273798 (+)
ufm1 ufm1,LOC107701138 other downstream 1735803 33050242 ~ 33067932 (+)
LOC103026201 LOC108277347,LOC108423746,LOC106604019 other downstream 2858485 34172924 ~ 34328970 (+)
LOC103024954 LOC108423745 other downstream 3020137 34334576 ~ 34507324 (+)

Expression


Co-expression Network