dusp26 (dusp26,LOC107720817)


Basic Information

Item Value
gene id dusp26
gene name dusp26,LOC107720817
gene type coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035916.1
NCBI id CM008319.1
chromosome length 36262418
location 1747521 ~ 1753757 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

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Function

symbol description
dusp26 Acts upstream of or within axonogenesis; lens development in camera-type eye; and retina layer formation. Is expressed in brain and retina.

NR:

description
dual specificity protein phosphatase 26

GO: NA

KEGG:

id description
K14165 K14165; atypical dual specificity phosphatase

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_022680821.1 False 3301 mRNA 0.38 4 1748453 1753757

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC103043725 bcl7a,LOC108410533,LOC107704131,LOC107706784,LOC107722340,LOC107554537 coding upstream 28574 1713634 ~ 1718947 (+)
LOC103044833 LOC108410534,LOC108276727 coding upstream 34596 1709405 ~ 1712925 (+)
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G172552 NA other upstream 118716 1626799 ~ 1628805 (+)
zswim6 zswim6,LOC108425190,LOC107704169,LOC103369940,LOC107706746,LOC105014808 other upstream 202565 1383495 ~ 1544956 (+)
G172517 NA other upstream 205370 1507320 ~ 1542151 (+)
LOC111194999 pitpnb,LOC108425199,LOC107602250,LOC107709228,LOC107706770,LOC107704163,LOC107653151 other upstream 881145 843788 ~ 866376 (+)
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LOC103041266 NA other downstream 85594 1839351 ~ 1850216 (+)
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G172770 h2afvb,h2afva,LOC107386217,LOC105007341,LOC107668744,LOC107599604,LOC103039302 other downstream 240951 1994708 ~ 1997362 (+)
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unc5c unc5c,LOC108435138,LOC108277026,LOC105911728,LOC106564027,LOC105025160,LOC106568183 other downstream 1711376 3465133 ~ 3739736 (+)

Expression


Co-expression Network