nrg1 (nrg1)


Basic Information

Item Value
gene id nrg1
gene name nrg1
gene type coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035916.1
NCBI id CM008319.1
chromosome length 36262418
location 23256525 ~ 23403475 (-)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

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Function

symbol description
nrg1 Predicted to enable chemorepellent activity and protein tyrosine kinase activator activity. Acts upstream of or within several processes, including enteric nervous system development; fin regeneration; and neurogenesis. Predicted to be located in membrane. Predicted to be integral component of membrane. Predicted to be active in extracellular space. Is expressed in gut; heart; nervous system; and somite. Human ortholog(s) of this gene implicated in several diseases, including bipolar disorder; cerebral malaria; dementia; middle cerebral artery infarction; and psychotic disorder (multiple). Orthologous to human NRG1 (neuregulin 1).

NR:

description
PREDICTED: pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform isoform X1

GO: NA

KEGG:

id description
K05455 NRG1; neuregulin 1

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_007255254.3 True 5661 mRNA 0.45 9 23256525 23316373
XM_007255255.3 False 5658 mRNA 0.45 9 23256525 23316373
XM_007255256.3 False 5658 mRNA 0.45 9 23256525 23316373
XM_007255257.3 False 5658 mRNA 0.45 9 23256525 23316373
XM_007255258.3 False 5646 mRNA 0.46 8 23256525 23316373
XM_007255259.3 False 5643 mRNA 0.46 8 23256525 23316373
XM_007255260.3 False 5637 mRNA 0.46 8 23256525 23316373
XM_007255261.3 False 5634 mRNA 0.46 8 23256525 23316373
XM_007255262.2 False 4266 mRNA 0.42 11 23256525 23347683
XM_015607369.2 False 4585 mRNA 0.44 10 23256525 23403418
XM_022681274.1 False 4361 mRNA 0.43 11 23256525 23403182
XM_022681275.1 False 4343 mRNA 0.43 10 23256525 23403182
XM_022681276.1 False 4337 mRNA 0.43 10 23256525 23403182
XM_022681277.1 False 4657 mRNA 0.45 11 23256525 23403475
XM_022681278.1 False 3964 mRNA 0.42 9 23256525 23276677
XM_022681279.1 False 3880 mRNA 0.42 9 23256525 23275733
XM_022681280.1 False 3856 mRNA 0.42 8 23256525 23275733
XM_022681281.1 False 3853 mRNA 0.42 8 23256525 23275733
XM_022681282.1 False 3772 mRNA 0.42 6 23256525 23275776

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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LOC103040684 NA coding downstream 358980 22881124 ~ 22897545 (-)
map3k1 map3k1,LOC107558252,LOC107670047 coding downstream 492113 22696309 ~ 22764412 (-)
LOC103042817 hmgcs1,LOC108427280,LOC108277226,LOC107737058 coding downstream 562593 22679197 ~ 22693932 (-)
LOC103043437 tln1 coding downstream 584674 22581421 ~ 22671851 (-)
wrn NA coding upstream 7708 23411183 ~ 23453696 (-)
ubxn8 NA coding upstream 111777 23515252 ~ 23521636 (-)
LOC103038694 LOC108427265,LOC108277159 coding upstream 303226 23706701 ~ 24078366 (-)
apbb1 apbb1 coding upstream 813697 24217172 ~ 24231664 (-)
LOC103022888 NA coding upstream 831447 24234922 ~ 24249982 (-)
G178575 NA non-coding downstream 1032 23255238 ~ 23255493 (-)
LOC111195071 NA non-coding downstream 34027 23221554 ~ 23222498 (-)
G178550 NA non-coding downstream 67724 23118708 ~ 23188801 (-)
G178528 NA non-coding downstream 325557 22930109 ~ 22930968 (-)
G178521 NA non-coding downstream 343256 22908792 ~ 22913269 (-)
G178660 NA non-coding upstream 7139 23410614 ~ 23410877 (-)
G178672 NA non-coding upstream 64383 23467858 ~ 23475206 (-)
G178673 ppp2cb,LOC107758729 non-coding upstream 99879 23503354 ~ 23514708 (-)
G178686 NA non-coding upstream 127519 23530994 ~ 23536703 (-)
G178758 NA non-coding upstream 318663 23722138 ~ 23722899 (-)
sh2d4a sh2d4a other downstream 299299 22945161 ~ 22957226 (-)
LOC111195067 NA other downstream 314861 22935490 ~ 22941664 (-)
G178450 NA other downstream 583842 22672132 ~ 22672683 (-)
LOC103023660 LOC103023660,LOC108440734,LOC108276836,LOC106926931 other downstream 746742 22501318 ~ 22509783 (-)
G178426 NA other downstream 799746 22455497 ~ 22456779 (-)
G178982 hint1,LOC107665476 other upstream 1727507 25130982 ~ 25134156 (-)
LOC103025094 zgc:171929,LOC107690845,LOC107575147,LOC107671611,LOC105905449 other upstream 1799850 25203325 ~ 25207386 (-)
thsd1 thsd1 other upstream 1890200 25293675 ~ 25303083 (-)
LOC103043022 LOC108410630,LOC107556853 other upstream 1960457 25363932 ~ 25472244 (-)
LOC103047293 LOC108410718,LOC106581537 other upstream 2252780 25656255 ~ 25864474 (-)

Expression


Co-expression Network