proser1 (proser1,LOC107556855)


Basic Information

Item Value
gene id proser1
gene name proser1,LOC107556855
gene type coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035916.1
NCBI id CM008319.1
chromosome length 36262418
location 25323348 ~ 25336596 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>XM_022681313.1
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>XM_022681314.1
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Function

symbol description
proser1 Orthologous to human PROSER1 (proline and serine rich 1).

NR:

description
PREDICTED: proline and serine-rich protein 1

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_022681313.1 True 5613 mRNA 0.45 12 25323348 25336596
XM_022681314.1 False 5520 mRNA 0.45 11 25323348 25336596

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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LOC103043838 stoml3b,LOC103043838,LOC108444492,LOC107556874,LOC108277281,LOC102781741,LOC107685018,LOC107720596,LOC101474847 coding downstream 2992 25339588 ~ 25358610 (+)
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LOC103044955 slc43a2b,LOC103044955,LOC108410672,LOC108277386,LOC107701113,LOC107720664,LOC107684998 coding downstream 220468 25557064 ~ 25586563 (+)
LOC103045464 pitpnab,pitpna,LOC103045464,LOC108276543,LOC105890453,LOC108237022,LOC108410689,LOC107386993 coding downstream 253227 25589823 ~ 25617224 (+)
LOC103045760 LOC108410697 coding downstream 288760 25625356 ~ 25643316 (+)
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LOC111195080 tpte2,LOC108410538,LOC108276937,LOC107718790,LOC107701101,LOC107685006 non-coding upstream 63707 25257793 ~ 25259641 (+)
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G179028 NA non-coding downstream 27711 25364307 ~ 25367336 (+)
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G179183 NA non-coding downstream 628047 25964643 ~ 25968792 (+)
smpd1 smpd1,LOC107718723,LOC107720657,LOC107556869 other upstream 65879 25244161 ~ 25257469 (+)
LOC103032894 LOC108424565 other upstream 868726 24447792 ~ 24454622 (+)
G178485 NA other upstream 2358359 22963447 ~ 22964989 (+)
G178388 hmgcs1,LOC108427280,LOC108277226,LOC107737058 other upstream 2613791 22689001 ~ 22709557 (+)
G178352 NA other upstream 2777218 22544640 ~ 22546130 (+)
LOC103024073 LOC108424537 other downstream 1494041 26830637 ~ 26879083 (+)
rnasek rnasek,LOC107554319 other downstream 1577154 26913750 ~ 26916344 (+)
LOC103038954 zgc:101846,LOC106525086,LOC108416226,LOC101161532 other downstream 2187706 27524302 ~ 27525441 (+)
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G180266 NA other downstream 6096602 31433198 ~ 31433909 (+)

Expression


Co-expression Network