G181750


Basic Information

Item Value
gene id G181750
gene name NA
gene type non-coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035917.1
NCBI id CM008320.1
chromosome length 21661149
location 27415 ~ 28989 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>TU246136
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>TU246143
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>TU246147
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Function

GO:

id name namespace
GO:0030001 metal ion transport biological_process
GO:0006811 ion transport biological_process

KEGG:

id description
ko04911 Insulin secretion

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU246136 True 1527 lncRNA 0.37 3 27415 28989
TU246143 False 1503 lncRNA 0.37 2 27415 28989
TU246147 False 1527 lncRNA 0.37 3 27415 28989

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC103026105 LOC103353182,LOC103469355,LOC103137796,LOC106954674,LOC102796940,LOC102236590 coding upstream 3449 12979 ~ 23966 (+)
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LOC103030568 camk2d2,LOC107714220,LOC107742503,LOC107563926 coding downstream 36892 65881 ~ 107890 (+)
LOC103027206 NA coding downstream 173319 202308 ~ 207014 (+)
LOC111195167 NA coding downstream 216477 245466 ~ 247320 (+)
LOC103031511 NA coding downstream 221487 250476 ~ 256183 (+)
LOC111195166 NA non-coding downstream 64176 93165 ~ 93769 (+)
G181777 NA non-coding downstream 134640 163629 ~ 166044 (+)
G181775 NA non-coding downstream 178757 207746 ~ 208523 (+)
G181782 rps6kb2,LOC108413157,LOC108260512,LOC103368287,LOC104930044,LOC101478146,LOC102204811 non-coding downstream 182846 211835 ~ 231061 (+)
G181797 NA non-coding downstream 239713 268702 ~ 269257 (+)
G181779 cd027,LOC108413410 other downstream 162968 191957 ~ 199996 (+)
G181799 NA other downstream 247682 276671 ~ 278173 (+)
G181801 NA other downstream 253087 282076 ~ 286281 (+)
LOC111195149 NA other downstream 260021 289010 ~ 390166 (+)
LOC111195150 NA other downstream 271106 300095 ~ 306312 (+)

Expression


Co-expression Network