G184203 (LOC108427427,LOC108260577)


Basic Information

Item Value
gene id G184203
gene name LOC108427427,LOC108260577
gene type non-coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035917.1
NCBI id CM008320.1
chromosome length 21661149
location 13558816 ~ 13591074 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>TU249607
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>TU249611
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>TU249613
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Function

NR:

description
PREDICTED: aurora kinase A

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU249607 True 4811 lncRNA 0.34 2 13558816 13564531
TU249611 False 458 lncRNA 0.50 3 13558816 13591074
TU249613 False 4761 lncRNA 0.34 4 13558816 13564531

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC103041974 LOC108427427 coding upstream 32404 13305949 ~ 13526412 (+)
LOC103047288 LOC108427443 coding upstream 292416 12899191 ~ 13266400 (+)
LOC103041365 LOC108427445 coding upstream 766533 12765229 ~ 12792283 (+)
LOC107197667 crgm2,LOC103042598,LOC108427436,LOC108427435,LOC108441183,LOC108260664,LOC108260583,LOC108260584,LOC108260580 coding upstream 1022154 12535768 ~ 12536662 (+)
LOC103040140 NA coding upstream 1923826 11631805 ~ 11634990 (+)
hgfac NA coding downstream 39468 13630542 ~ 13654273 (+)
LOC103042284 LOC103042284,LOC108427430 coding downstream 116615 13707689 ~ 13709643 (+)
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LOC103029182 LOC108429273,LOC108260865 coding downstream 265895 13856969 ~ 13906069 (+)
G184201 NA non-coding upstream 8771 13546162 ~ 13550045 (+)
LOC111195227 NA non-coding upstream 220745 13334495 ~ 13338071 (+)
G184192 NA non-coding upstream 260701 13297784 ~ 13298115 (+)
G184182 NA non-coding upstream 428018 13077958 ~ 13130798 (+)
G184171 NA non-coding upstream 503103 12956175 ~ 13055713 (+)
G184268 NA non-coding downstream 133682 13724756 ~ 13729942 (+)
G184285 NA non-coding downstream 151954 13743028 ~ 13743451 (+)
LOC111195229 NA non-coding downstream 194804 13785878 ~ 13801142 (+)
LOC111195228 NA non-coding downstream 210283 13801357 ~ 13827701 (+)
LOC111195230 NA non-coding downstream 390974 13982048 ~ 13997645 (+)
LOC111195141 LOC107096934,LOC108427427,LOC103480793 other upstream 13321 13535062 ~ 13545495 (+)
G183996 crgm2,LOC103042598,LOC108441183,LOC108427435,LOC108427436,LOC108427240,LOC108260579,LOC108260664,LOC108260583 other upstream 1866880 11690901 ~ 11691936 (+)
ppp1r21 ppp1r21,LOC107578819 other upstream 2055337 11483052 ~ 11503479 (+)
clhc1 NA other upstream 2102443 11431984 ~ 11456373 (+)
G183892 rps27a other upstream 2126890 11399062 ~ 11431926 (+)
LOC103025917 LOC108427442 other downstream 69073 13660147 ~ 13691164 (+)
c21h11orf68 drap1,cunh11orf68,c29h11orf68,LOC106608686,LOC107684582,LOC105923970,LOC107748024,LOC107670404,LOC103032366 other downstream 459713 14050787 ~ 14063300 (+)
G184594 NA other downstream 1668302 15259376 ~ 15261534 (+)
chrna9 chrna9,LOC107548308 other downstream 2149144 15740218 ~ 15750689 (+)
G184727 slit2 other downstream 2862266 16453340 ~ 16486424 (+)

Expression


Co-expression Network