LOC103032041



Basic Information


Item Value
gene id LOC103032041
gene name NA
gene type misc
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_035917.1
NCBI id CM008320.1
chromosome length 21661149
location 14063644 ~ 14116456 (-)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence


>TU249876
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>XM_007230172.3
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Function


GO: NA

KEGG:

id description
K04735 RELA; transcription factor p65

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU249876 False 3160 TUCP 0.37 2 14063657 14116456
XM_007230172.3 True 7081 mRNA 0.41 11 14063644 14088334

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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LOC103042598 crgm2,LOC103042598,LOC108427435,LOC108427436,LOC108260664,LOC108260584,LOC108260580,LOC108441183,LOC108260581 coding upstream 222258 14338714 ~ 14340598 (-)
LOC103043225 NA coding upstream 1142921 15259377 ~ 15261518 (-)
LOC103042179 NA coding upstream 1148652 15265108 ~ 15303915 (-)
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G184256 NA non-coding downstream 443808 13619632 ~ 13619836 (-)
G184422 LOC104965148,LOC104966956,LOC103385808 non-coding upstream 12072 14128528 ~ 14131095 (-)
LOC111195216 NA non-coding upstream 63649 14180105 ~ 14185344 (-)
G184447 NA non-coding upstream 219490 14335946 ~ 14336641 (-)
LOC111195232 NA non-coding upstream 836988 14953444 ~ 15001573 (-)
LOC103043324 NA non-coding upstream 931291 15047747 ~ 15052870 (-)
LOC103031091 map3k11,LOC108427450,LOC108260854,LOC107748023 other downstream 23399 13988809 ~ 14040245 (-)
LOC111195226 NA other downstream 468891 13551132 ~ 13594753 (-)
LOC111195225 NA other downstream 759964 13226333 ~ 13303680 (-)
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LOC103043525 tapt1,LOC108434341,LOC107702406,LOC107750443,LOC107671913,LOC105908524 other upstream 1193053 15309509 ~ 15340580 (-)
smim18 smim18 other upstream 1260202 15376658 ~ 15381208 (-)
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LOC103032582 NA other upstream 3113629 17230085 ~ 17241027 (-)

Expression



Co-expression Network