G193770


Basic Information

Item Value
gene id G193770
gene name NA
gene type non-coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035918.1
NCBI id CM008321.1
chromosome length 32506130
location 30537778 ~ 30600898 (-)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>TU262947
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>TU262949
TCAGCTgcttcattatttcattttttttttgttcaaaaattttaattttagtgcATCCCTAATAAAATTCAGTTCGATATACAGTAAACGTGCAGTCTGATTCATCAGTGTGATCTTTCTTTCACCAGTGATTGTGATTATGCTAATTTCAGATTGTGATTAACGGCTGGATACTGCTGTTAATAATCTTTCACTCTcaaactttcactttcacacatacagtaaacacgtaaacatacacacacagacacacactgcaGACATGCTACAGGATTTAACCTACACCTGCCAGAACTACCCAGCTGCCCACCAACATCTGGTTAAATGTGGGTTTTGATGCCAAAAGTCTAAacgttttattattttgttgatATTAAGGTTTTTAAGTTCTGAAATAAAGTGTCCAAAATCAAACATCTTGCAAATGTCACATGCCAACATCATACTGACTTTGAGGTCTCGAGATACTGTATAGGGACCACAACCCAACCTCTGCTAAACATACTGTTAGATGTTGATATGTTGATAAGTTTAAGTGTCTCTCTAATGTTTGAGATTGATTCCAACCCAAATTTGTTGACCAATTAAAATTTGAAATCCAACCAAACCATAACATCTAAACAATGTTTGAGTTTGGATGTCCACCCAGTGTAACCCAATGCAACATCTGCTAATGTTAGAGCTTGGTTTTAACCCAATGTTGTTTTCAAGGTTTAAACAATGTTGGAGTTAATCTCAATTCAACTTGATGGCAACCCAATGTTGGATTTTGACAGATATGTGACTATGTTTTTTAACCAAAATGTAACATTTGTACAATGTTGGAGCTTTATTGCATCCCATTGTTGGTTTTCACATCTGAACAACATTGGAGATTGATATCAACCCAGTTTAGATTTTTTGCCGATATGTGACTTTAATTTTGAAGCAAAATACAACATCTGTCTAACGTTAGAGCTTGATTTTAACCCAATGTTGGTTTCAATGTTTGAACAATGTTGGAGCTTAATGTCAACCCAATGTTCGATTTCGCCATATGTGTGACTTTAATTTCCAAAATCAATGTCAACAACACTAAACAACATTGAAACTTGATGTCAACCGAATGTTGCTTTTGACATGTTGATATGTTacttagtttatttttaaaaatcaatgtcCATTTAACATTACAGATTAATGTCAACCGAATGTTATTGTTGACAGATTTGTGCCTTGGATTTCAAATGAAAACCCATTATTGTTTTCAACATTTGAACAACATTTGATGGAAACCCAATGTTGGATTATTTTAGATGTGACTGTTTCTAACCAAAATGTAACATTTGTAAAACGTTTGAGCTTTATTGAAACCCATTGTTGGCATTAACACCTAAACAACATTGGAGATTGATGTCAAGCCAGTTTTGGTTTTTGGTAGACATGTGACTTGCAGCATCTGTTTAACCTTAGAgcttgatttttaccaaatgttGGTTTTAACATCTAAAAACATTGGAGCTTGATATCAACTCAAtgttggatttaaaaaaaaaatgttaggtgATGTTAACCCATTGTTGTATGTTTACGGATATATTTGACTTTAATTTTGGAGCTTGATGTCAGTCCGATGTTGGTTTTTGCTGGATATGAGAGATTGATTTTACACCTAAATCCAACATTGGAACTTAAAATGTCAACCAAATGTTGGTTTTTGAAAGATATGTAACTTTGAATGGAAGCAAAATTCAATTTCTGTACAATGTTTGAGCTTGAGGTTATGGATATGTGGGActgtttttttaaccaaaatttAAGCTTTATTGCAACCCATTTATACTTTTAACCTCTGAACAACATTGGAGATTGATGTCGGTCCAGTTTACTTTTTGGCAGATAtgtgactttgactttgaaccAAATAGCAGCATCTGTCTAACAGTAGAGCTCGATTTTAACCCAATATTGGTTTAACATCTAAACAACATTGGAGCTTGATGTCAACTCAATGTTGTTTTTTGacatatgattttattttgaaCCAAAATTCAATGTCTCTCCAACTTTGGAGCTTGATGTTAACCCAATGTTGGATTTCTCAACATATATTTGACTTTGATTTTGAACCAAAATATCAAATTTTGGAGCTTGATGTCAGTCCGATGTTGGTTTATGATAGATTTTACAACAATGGAACTTGAAATATCAAACCAGTATTGGTTTTCGACAGATGAGTAACTTGATGTTAACTCATTACATTTTCACGTCTTTCTAACTTTGGAGCTTGATGTCAGTCCAATGTTTGTTTTCCACGGATATTCAACTCTAAAATCTGACCAACCGTCTGTCCAACATCTTATTGATGTCCTGTGGCTGCTGGGTAAGCCCTTGAAAAAACAAGTCTTCTCtattattgatgtaaaattGATTGAAATGCAGTAACAGTCAGGCTTGCTTGCTCACTTTTCAGAAAGGCACTGAATAAAAGAGTGGAGACAAACAAACCCAGCTCCACCCTGTTTCTACGTAAAAAtacattctcttttttttttactgtggtcAAGTGATAAGCAGCGTGTGATAGCAGGAGTATCACCAGTTCAGTACAGAATCACAGTAATGACTGGGTTTTTCAGCTTGTGTCGGTGTTGCTGTTGTTTGTGGATGGGTTTTGTACAGATATATAGTTTCGTTCATCATATTCATGTGAGGAAATCAaagaataaaagttttttttgaagGGGTTggacaggggttggacaatgaaactggttttagaccacaataatttattgtcctgatggacagttctggtgaaaacaggagagttgaggtgaatATTGGGGCAGCcgaatccaggttagcacccgaacatccctttcagacagcttcctcttacagcgtccacagttaatcctgttggatgtggttggtccttcttgatggtatgctgacattaccctggataccgtggctcttgatacatcacaaagacttgctgtcttggtcacagatgcaccaacaatttgtctgcttttgaactctggtatgtcacccataatgttatagtgtgcattgcaatattttgagcagaactgtgctcttaccctgctaattgaaccttcacactctgctcttactggtgcagtaatgtgcaattaatgaagactgatcaccaggctgctccaatttattcatgaaacctcccacactaaaatgacaggtgtttcagtttcattgtccaacccctgtatgttgattgaagaaaaaaaaatagctggtTTCCATCCACTACATTTTTGCAAATTGTTAAAGGCAACATATTATGCAATGTTCACTGtttgcacactttttttatttcctttattttgtcTACTTGGTTCTcgatccatccatctgttttctgtaaaataattaaacatacatagaaccaccctggcaccacccctcacctggCAACCCTccccagagccccacccactagatcagttgaaaaaAACGACATGTCGATCTGCAGGTTGAGAGCTCTGTACAAtgtacagtacacagcaggattagggattagccagcagacttcgtctgagggagggatctgtacctactgacCTTGGCAAGTCAGCAAATAAGTTTTATCCTTCTATTACAGTTAAGCACGAACTAGCTTGTTCTTGTTTCGCCGTTTAGCACGAGCTAACACTAACGTGCGGTAACCGCTCAGTGTAAATGTGATGTCATggcagcaacagcttatttgcataaaagtgacagagcccttaaacagttCTTTTTAAAAGGGACTAAAACCCTTTATTTTAGAGCGATTTTGTGCACAGAActacatgaacatgttttgtgtagcccatagacctattgtaacttgttaaaaaaaaagtgctttataaaaCCTGAATAGAAAAAGCTTATTGTTTTTTGCTACAATGCTGTGGAAAAGTTTTTACAAAATTTTGCAGGAATCCAAActgtgaaaaagagagatggtatatatatatatatattttttttttttaaatacatgatGATGTCTAATGTAAGTGCCTCTGGTGTAACTCCACCCTCAACCCAACAGCACTTGGTCTCACTGAAGTTCTAGTCGCCAACAATTTACACTCTTTTTAAAAGAGCCTCAAGCTGTAGACACATTGCAAAATCTTCGTTTCCGTTTATCGTGATCTAAACTTTtaagtgtttcttttatttcttgtattCCTGTGTTTGTTTGCCCGTTTTGACCATTTGTCTGATTATTTGACTGTGTTTTGCTTGTGAATAAAGATCTGTCTGCAACTGCATCCAGCTTCATTTCCCTATTGTGTTGACGGACACACAGCTCTGCACTTTTCTtgcagaactgtctggtgtgtttgcactCCCACAAGTGTGGTGGACATCATTAGGGTGTCACAAAGATAGGCCCTGCTCATCCTAATTAGCGATCAAACATCGGAAATGGTCACAAATAGGTTTCTGCCACTCCTAATCATGGTAGTGGATAACTGTAGTGGATGGAAACACAACTTATAATTACTTGtgataaaatgcaaaattcCATTCCAAACATTTGGATGGAAATCCAACTGATGCCAATTTATTATGTaatcacagtaaaataaactataaaataaggTATTAGTGATTCTATTTAGGAGCGAAAAAGTGACCTGTGCTGATGGATAAAGTATGTTTTGTGTTATATCGTTTTTAAATAGATGTTTAACGCACTTAGTGTACATAAGTGTAAAGCGGTATTACGTTGATGAGCATCGATTCCTCAAATGTTTACGGGATTTGTAGTATATTTGGCAGATGTTCGACCACAAAAAAGAGATTAATACTGAtagggttttctttttttttttttttttcctgattgcCTGTATACATAACGATGTTAGAGGTTAATCAAATCCACCTCTGCCTTTGCACCTCAACCTCGGTCTCAAAGCAGTGGTTCTCTGGAACCCTGGTCACTGGTCACATCGTCTGGCTGCCCAGAGACT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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU262947 True 6000 lncRNA 0.39 3 30537778 30600898
TU262949 False 5400 lncRNA 0.38 2 30537778 30543617

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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LOC103036366 prkcd,prkcdb,LOC108435819,LOC107696837,LOC107728641,LOC107656045,LOC107600299 coding upstream 637573 31238471 ~ 31287104 (-)
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G193678 NA non-coding downstream 804506 29732572 ~ 29733272 (-)
G193662 NA non-coding downstream 952932 29584452 ~ 29584846 (-)
G193818 NA non-coding upstream 123534 30724432 ~ 30728862 (-)
G193846 NA non-coding upstream 243157 30844055 ~ 30845956 (-)
G193866 NA non-coding upstream 292729 30893627 ~ 30911740 (-)
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G193737 NA other downstream 357652 30165761 ~ 30180126 (-)
G193541 NA other downstream 1939140 28597555 ~ 28598638 (-)
LOC111195343 LOC108434908 other downstream 1951556 28576107 ~ 28586222 (-)
LOC111195422 si:dkey-33m11.6,LOC108411515,LOC108255079,LOC107572850,LOC107714486,LOC107680422 other downstream 2324708 28194379 ~ 28213070 (-)
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spcs1 spcs1,LOC107680421,LOC107744856 other upstream 208896 30809794 ~ 30830957 (-)
LOC103037496 mustn1,LOC103037496,LOC103359875,LOC107091502 other upstream 569400 31170298 ~ 31194049 (-)
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Expression


Co-expression Network