shisa5


Basic Information

Item Value
gene id shisa5
gene name NA
gene type coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035918.1
NCBI id CM008321.1
chromosome length 32506130
location 12905330 ~ 12922980 (-)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>XM_007229619.3
GGTTGGGCGTGGGATCCGGATCATATTACAGTATCGGCGCTGCGCTCACCCGAGCTCCAGCCTCTCCTCTCGGCCAGCCATGGCGTCCGCTCTCCCCGCGCTCCTGCTGCTCGCTGGGCTCGTGTTTTTCGCCACTGCTGATTCGGACTGTGATGCCTACCTTACCAGCTATGGCGTCTACAGAGGATCGCAGGACTGCTCCTTCTATCAGTTCTGTTGTGGGACTTGTGATGAGAGATACTGCTGTTCTGATTACTCCAAAAAGCTGGAAGATGACTACTGCGCCTTTGGCTCAAAGATGAACTCCATTGCCATCGGCTCCATAATAGGGGGAATAATCTTCATGATCGTGCTGTTTGTGGTTTGCTGCGTGTGCCCGTGCTGCTGCCTGTATAAACTGTGCAAGAAACCCAGGCCGGTGCTCACAACCACCACTCACACTACAGTGATTAGCAGCCAGTACCCACAGCAGCCTACAAACCCTGGGCCCCAGTATACCAGCCCAGCGTACCAGCATGTTCCAGCTCAGCCTGGGTACGGAGCTCAGCCGGGTTACCCAGGCCAGCCCATGCCCCCTGCCCCATATCAGGGACAGCCTTATGCACCAGGAGCACCTCCTCCATACCACGAGAGCGGATATCCTGCTCCATACAGCCAGGCCGCGTACGATGGTGGCCACCCCCCGTATCCCCTCCAACCGCCCACCCAGCCAGGCTATGCTCAGCCACCGCCCACAACAGACTACAGTGCCACCCAGCCGCCCTACAACCCCGCCTACGTTGAGCCGCCAAAGACCGGGTACTGAACCACAGGCGTCTGACTGCAGCGTCCGCTGGatcacacactcctacacacttCCACCGTCCACCACGGATTTGCCTAAAGAATTCTTATACCATCTATATTTACGCAGGACAGTCTCCAGTACACAGCGAGGCAGagttttcctttattttctctcttccCCCCCCTCTTCCCTCTATTCCCAGCCCCCATCCCCGGCCACTCACCTTATTTTCGTGGTCCGGTGCTATTAagacttcttttttttccttctttttttacgCTTCACAGTAAATCTGTCCACGACTCCAagccatatttttttcttttttgatgtTCTGAAAGGAAAAAAGGGAATGTATTGTATGCAGTGtttttctcattgttttttttttattgtacttttattctctttttgaTTCGTTCAATTTGTTTTAACTGCAAAACGTAAATCAGTTTTTTCCAACGAAATGATTACGTTTGCAGTGTTCACATGTTTTgtcaagtttaaaaaatgtcatgGGTCATGCAAAATGTCCAAAATTATGGAAccttgttactttttaaagaaagtCTATTTAAGCTCATTTTGGAGTCCAAGCATTTCTATAGGCCACATGTTTGGCACTACAAGTCTAAGCTGGATTTTCAATGGCAAAAATCAATGTTCTATACTTTCTttggagttaaaaaaaaagaaaaaaagaaattgcaCCTATCTCGTTCTGTGGTTTAttcactaccagtcaaaagtttggacaacccCCTTCtcatttttatcatatatttttttgtttttctttacttttattatgTGCTACATACATTGATTACATTGATTACATACATAGATTGATATTGAAGACATCAgaactataaaggaacacatatgccATTATGAAGTTaacaaagaaaaacttaaaagtagcacATTTTGCTTCAATGACAGCTTTGCTCACTCTTTGCTGATCCTCGCAGTCACTTCACAACATAAAACCTGGAATGGATCTCCAgctgtcttaaaggagttctagaGATTTTGAGCgcttgttaatttattttccttCACTCTGCACTTCAACTCATCAGAACACATGGGTTGGGTTTTATGTCAGGTGTTTATAAAGTCAAACacttgtttatttgcttttttggtTAATACCAAAATTCATACAGTAAAACTTAATAGTTTTAagcctttaatattaaactgtaGTAAGTtatacaaataacaaaacaaatattaatgagaatgtgtgACCAGACccttgactggtactgtacaaatgtccagaacactttttttttttgttttggataCATATTTTAGGCCTTGGTTTAGAACCAGAGGTGCCAAATATATGGGCAAAATATTGTGCAGACTAAAAACTGATGGCAAAAATTACAAAGACAATGACTTCAGtgttctattggtctattctcTGTGCAATTTAAGAATTTTTGACACAGTGGAAGAATAACTTCTTAGATTCAACTTGCATCAAAAAGCAAAACAAGATTTCTGCATGATAAAAACTTGTCAATATGTCATTCTTGGCCTGATTTGATCATTATAACTATTACAGTCCCTCAGAATAGCTACAGACACTGGCTTCTGTAAAATGTAGTTTATGCCTACAGCACGGATATATCTACATTGAACAAGACTGCTGTGGGCATCCTGTGGTTACAGTGTTAGAGAAGTGTTCCTTACTATCGTAGGAGTGAGCAAACAGGGCACTCATTACCAACACAGTTCTCCTTCAGGTGTGTTTAAGCCACCTAAGTGTTGGCAAGTTCCTTCCTACTGTCACAAAGTTCCACAGTTTGTGGGCACTGGTAGGACGTGCAGGCTGGGATAGTGCTCCGGCTTGCTCAGCTATTTGCTTTGGCCAAGCTGTGTTGTAGTCGGATGTAATTGATTGGACCTGTTTAGGTTTCTGTTAAAGTTGCCAAGTAAGTGTTGGTTTAGGAACAgggcacattcacacacacattgttttcATGGCCACTAGTGCAGAACATACTGCTCTCTAGTTGAACAGCATCTTCTGCACTGGTGGCcatgagaacagagaaaaagacGATGCCTTCAACTCAGATCTAACTCTGTCTAAATTTTGGGTTCTGTTTCAAAACCTCTCCTTTCTGAaaaaacttttactttaatttatatgGGGGcagaaattgaaataaaaaaatatcttaattaGGCAACTCCACCATAGTTGTTCTCATTCAGGAAGTGTGCCTTGGGTTGAATGTTTAAAAGTTCTTCATTAGTCAGagttttaaccctcctgttacgtTGCAGGTCACACTGACCTGTTTtgataggtttaaaaaataCCAGACAacaattttaatcattttaagagCATGAGACCTTTTCTGCAAAGCTTaactgtatatttgtgtaaagAATGTGTAAAGGGTAAGTGTCCAGTTTAATGTgttcatattatatattctaataaatgtttgtattaTGCACATAATAGTGCAACCCAATAGTGACGATACAGGCTTcagaaggttaaaaaaaaataaaattgagaccaaagcatattttattttgaattataaaTTGTAACCAGTAATCTCTTCTGGgtttttttaaaccttaaaaCTACTTTTGGATTGGTAAAACACAAGCCAGTTTAACCTGGGAAATTACTGCTGTTCCTTACAGCCGAACGTAACAGGAGGGATAACAGTGTGGAAACCTGGACAGAGGAAACAGACTTTctatgtgaaaaataaatggatAGTAAGAATGGAAttgtttcatatttttcttaattCAGTATATCCCTCGTACTGCAGTTTTGACATTCAGAGCTAAATTGTAAGATTACTGAATGTTGTGTATGGTATTGTGTGTTGTATTATGTCATTATGTTGTGGAAAGCTTAaggacatttttcatttatctGTACTGCATTGTATCATTATCAATATCATTATAATTGTTAAACCAAAGGTTTAAGTTTATACCCCTTAAAGGAGAAACCCGGTGTGAAAtagacttgggttgtagtgaaacataatgcaaataaatctatatttttacaccattagaAAGGGCTCAAAGTATCTCCAAATATCAATAGTAGATGTCAGAGGGCCCTGACAGGCCCTACAATAaggcactgagagctttaaaggtgcatgtaatttattaaaaaaagactgtatacacacagtaccttgagGTAGTTCTCTGGGTGAAAATGCTATTATACTGTTAGAGAGACATGGAATTCATTTTGTAATCTGTTCCCATATCCTACTCATTCATTAATGCTCAGCAGCCACTTTATTGTGACTTAAGATTTAAAGATTGCGAAGCCCAGGggactgtgtgtataaacagtgaaTATGCAGGTAgttagtattaaaaaaacaaagttcttagtgcctcgttttaagTGTCAATATCCTCAGAAttttaccaatgaagtgtgaCGCTACTTTAAATGTTAGAATGCAGTATTTTGGAATGTCATGAAAGAACAGAGACGAATTATTCGACAAAAGTTCTTACTCGCCTTGTTTCACCACAACCCAAGtctatttcacactggatttctccacCAAGCGATTGTAAGAACTACACACcaacatttacactgttctaggcctgtcacaataggTACATTTTTGACTTAtaatttttgacataatgttTGCTGACCTCTTTCCATTAGTCCATTAACTTACACCAGCATgcagattaaaaaacaattttaatattCAAATACCAGTGTATGCATattcataaaaacaaaattcaCTGTGTTATGATATTAGTGTATTATCATTAAATCagtgaaataatttatttctggAACAGTATATGGTGCAGaaatagttattgtgacaggcctacattgTTCTGCAGATGCAGGTGTACAGAGATGTAGCtcctttttttatgaaaaaagttCTGCCTGTTTTGCCTTAACCGGGTCTGTGAATGTTTTTCTGAACTCTCAGTATTTACGTTTTGTTTGCATAAAGATAAGCATCCAGAATATGCCTTATTTCATATTTCCTGTTATGCAGTGTTGGATGAGGTGGTAAAGCATGCCAGCCTTTCTCCAGCGTCTGTCTAATAAAAGGGGTTGCCACCAGA

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_007229619.3 True 4921 mRNA 0.39 5 12905330 12922980

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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LOC111195380 NA coding upstream 60441 12983421 ~ 12990268 (-)
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LOC111195455 NA other downstream 191298 12612611 ~ 12714032 (-)
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ptpdc1 NA other upstream 3646643 16569623 ~ 16599317 (-)

Expression


Co-expression Network