G74252



Basic Information


Item Value
gene id G74252
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id CI01000012
NCBI id null
chromosome length 13770000
location 7014865 ~ 7020574 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence


>TU84676
ATAAAATACACACACGCACGCACGCACGCACACACACACACACACACACACACACAAAATTAGAAAGTGACCGTGACATTGAACATTGCACTGTTTTTGAGTGAAATATGCTTTCCCAGCAGCAATGCTGCATGACACTTTGACCTGAGGTTGTTGCGAAACAGGATTTGTTCCTGTTGGATATTAATTGTCTTGTTTAATTACAGCTTAGTAATTAGAGGGGGGCGAGACACGAATTCCCTGTTGCTAAGTCCTTGTTAATGTTTGCGTTTTCAAAGTCAAAGCTGTATGTTCTCAAGGATATGGCAACTCCCCCCTAAACTGCCAGTTAATGGACAGAGACAAGGCTGGAGTCAGCACCTCCTTGGTGTTGGTGTGTATGTGTGTGTGCTGACATTGCAAACATTTCTGCACTGAGAAGCAGAGAGATGTGTTGTTGGTTAAGAACCCCACTGGTATTAAACACCTGAAGATTAATGACACTCCTTAACTGCTGCCCACCAGTCATGCGATCTCACCTAAACCGATCGCAACACTGCAGACATCACCACAACTTGATTTAACTACATATAAACATTTCTATTTGAAGAAAAACTACTTAAACCAGCCTGAGGTAGTTTTCTCTTAATTAAAGGGGACCTATAATGCCCCTTTTCACAAGATGTAATATAAGTCTCCGGTGTCTCCAGAATGTGTCTGAAGTTTCAGCTCAAAATACCCCACAGATCATTTATTATAGCTTGTCAAATTTGCCTCTATTTGGGTGTGAGCAAAAACACACTGTTTTTGTGTGTGTCCCTTTAAATGCAAATGAGCTGCTGCTCCCGACCCCCTTTCCAGAAGAGGGTGGAGTTTTAACAGCTTGTGCTTCAGATACTCAACAACAACAAAACCGGAGAATCTCACGCAGCCAAAATGTCAGAAATTGTCAGTAGCGGTGTTCTGCCTTACATATTTGGAGTCAGACTTTAATGGAGAGACTCATGAAGAAGTTACAACTTTTAAAATACGTTTTTACATAAGAGTAGGGGGGGAAATCTGGAACCGCTTGTTTAGAGAGACTGTTTATGATTTATAGGGTTTATAAAAATAAGGAGTGGGTGGATTTTTACCATTATAGGCTGGTTGTTGACACATACTGTGGACACACATCTGTGTTCAAACCTTATAAAAGTGAATTTTGCATAATAGGTCCCCTTTAAGGCAAGACACCAAAAATTGTAATCTCTAACAATATACTTCCCCAGTTTGATTAATCACAATAGAGTATGCAATTGAGACATTATCTAATTAAATGCACAATAATTGACATATAATAATTTCCAGAACCGAAATCTAAACATTGGATAAAGCCAGGTTAAAAATTCTTGTTTAATTATGTTGACATATTAAAGTGAAATTTTTTTAGAGGGGTTTTTGGATCTCTTTTTATCACTCCATAAATCAGAAAATACTGTCAAACTCAGCAGAAAGAAAAAAAAAAAAACAATTTTCACCATGTGTTTACTAATAAAATGTTGTATAAATCAGGCGAATAAGTGTAGGAGAAAAAACTAATTGGAAGAAATAGTCTTTAAAGATATATTGTAATTGAAATCTACAGACGCAAACAGATCAAGTGGAATAAAATAAACACTTGTTTTCTTTCCTCTAGTCTAAAAGAAGACATGTTATGGAAGCAAAAACAAAACAAAACCAACAGTACACAACATGGTCATATGCATCTCAGTGGATGTCTGCGTGATTGTGTTTTCACTACGGCATAAATCCAATCCCTGCTTAAGCAGAGGACATGGACTATGGGTTCGTACATCTGGCTTAGCACATTGAGGCTTTTTACCCAGTCACACAAAGCGATGTCATGCATTTAGCCTCAGTCTTGTGTTTGTTGTCCAGTGTCCGTCTCATTGAGCCGTGGGCTTCCTGCAGTATTGCCGTGGGATGCAAGTTGCCGTGTTGAGATAACAGGCCCAACCCAGCTGCGTTATCACGGTCTCCCTTCCCGTTAATCGGCTTTCAGCCTTGCGTAAATAAAGTTTTAGTGTTTCTCTGTGTGATGGGGCTAGCCTGCTTAGTTAAGAGAATGCAAATGGCAGGCCAGGCAGGGTTAATTTACTCAGAGCTAGTCTCAGGGCAAACCATCCGTCATTGGCTCTAAACGCCGCTCACGTCCGCAATTTTGCTCCAGCGTGAATATAAAGACTTATTATGAACTGTTAAAAAGATCCCTGAGCCTGAAATCTGGGTTTTATTTATACAGTCAGTAGAAAACAACAGCACAGTTAATAGATGCAATTTGTGATTTGTTTTTTTGTTTTTTTAACACTGCTGTTTATTCTTTCAGAATATTCTATGCACTTTCAAGATAATTTTTACACTTTTGAAAGCTCCCTAACCCTCTTCTCTGGAGATGCCAACGTAGTGCCAATGAAGCGAGACGCAGACACAACTTGATTAAGCACACATAATTGTCAAAGAGCACCATAAACAGAAGTTGCTCATCAGCGCTCATGAATATGCAGCAAATATTCATAGGATTCTGCTGTTGTGTAGAACAATAAGAGCAGAGCTCATGGCAATCTGGGAAAAGGTTAATGACTCAATGAGGGAATCCAACCATTACCTTCTTTTTTCCTTCCTAAAGCGGATCCTGACCTTTGCAGGCCCGTATCACCACGCTTCTGCTATCACCATTTCATGTGCGGCCCTCTCTTCACACTCATCAGCTGTACTTTTGCACATAGAAAAGGATATAAACACTTCATCTTTACAGTGGTGGATGAAATGGATGAAAATGTGGGAGAATGTTTTTACTTTCCAGTCATTGTTAGGTGTGCCATTTAAGAAATATCACTCAAGCAAGAGTGCCGTTCGATCAAAGGTAATCACAGCCGATTCTGCGGCAAGGGAAAACACATGAACTATGACTCAAAAAACAAACAATCAAAAAATAAACACTACCTATTCTGCTTTCACTCTGTACATTTCACATACTTTGGTCTAGAACATTGAACATTAGAACATTTCTAGTGTTGTTTCACCAAATATATAAATGAAATATTTATTAATTTATAAAATGTATTATGATTTTATAATAATGATTTTTATTAATTTATTAATTATTTCAGAGCAAATAAATAAATATTTTTACATTTATTGGATCTGATGTAATAATAACTAGAGAACCAGAGCAAATAAATAAATAAACAAACCACATTATATAACAATAATTCTTTATTTTTGATCTGTTCCTCTAATTTGATTTAATATATAAATATATAACATCAATACTATATGATCTCAGTTTTTAGTGCTCAAATCCATTTTTCTTGGTAAAGAATGTAGTGTGCGTTGCCTGGCAATGATGGCAAGTAACAGATAATCAGAATTTTGTGTAACAAATTATTTCATGTTGTACTCGCCTCTAGTTGTGCCCTCAAAAGGAGATATAGAAAAAAAATAAAGGGGAAAGCTCAAAACCAAATGATTAAAAAAAAGTTTTGAGCCGTGTTAAAGTCCCCTTGAAATCAAAATTTAAGTTTTTTAGCATTTAGTATGAATATGTTAGCCTTAAGGTTATGAATAAGCTGGTGCTTTCCAAAACAATGACAAAATTCGCATTTAGGAGACATAAGCATTCAAAACTTACAGTCTCTCACTTTCGTTAAAATGGATCACGGATTTTCATGACATCGCATCGCACTTCAACTTCTCGTCAGATCTTCTGTCCAATCAAATTCTCTCTAGAATCTGAAGTCCCGCCCCCTCCTACACTATATACAAATGCTGAAGCTGCGGCTGAAATCGGTCATTTATTCACACATTTACTAGTTACATAGTGCACTATATAGAGGACAGGGAACGATTCAGACAGTGTAAATATTCTTTCCATTGATGTGAATGAAGTCGTTTTCGTGTTAGTGTCACGTGAACCGCTGCAGCGCGAGCACAGTCTGCTCTGACCCAGAGACACGAGAGCACAGAGTGGATCATTTCAGCGGACCGCGAGTCGGCTCAGACCACAAAAGGTATTGGACCCATTTGAATTCTGCACAGAATGCTGTATTTTAAAGTGATATAGAGGACATTAGGAGGAGAAACGGTTAGAGATTAGAAGGAAACTGAGGTTTTACCGAGTTTAACGGCTCTGGCCGAGCTGTGGTGTAAACGAAATGCTATTGGCTATTTAAAAAAAGAGGCAGAGCTGTTCGATATGTCCCGCCCTGTCTTCCTGTTTCATTTGAAATTACATCAACACATTGAATAATGCTGCGCGTTCCATGGCAATTCAGTGGGCCTTTAACTTCTTCCCCTCTCTATCTCTATCCTGAGCCCAGCAAGGATACGAAAGGTGTACTTGTGTACGGCAAATGCGTCTTTACGGGTACTGACTGAGGAAGTTGCCAGTGTTCTCTTCTTTACCCAGCAGAGATTTCGAGGTGTCTGCATAAATTGACAGCACCAGATAGAAAGTTGCTGCAGTGGATTTGGTTTTTCTTCTTTTCAAAGCAAAGTCACACAAATACGGGCCTCGATTCACCGTCAGGGGAAGAATGTTGCTATGCATCACTTAACAAGCTAGTGTTCAAACAGAGCTTCCTCTGATTTACTGCTGATGGGGGAATGTGATTAATGCTCCCTTTTAAAACCCTCATACTTTAGTATGTGTCGCAGCCCGGCCCATTATTCCCAGGACGGCACATTATTTCAGTGTTTCATGTCAGATGGCGAATCTTAGATGGTTTGTAATAAATTGACTTCACTTGCATTGTCTCCAGCCACAACAAAGTGTTTTAATTTGTAAATAAAGCAGGGCAGTTTGTGTCTACAGATTTTGAACTCATTTTATTTTCATTTTTAAATATTCCACTGTTTACATTATCATTCACATGCTTGTTTTCTGTAAAATATGAATTCTTGATAAGAGTGATGCAATATTAGATGAACGCTATCTGCCAGCGGTGACCAGCCCCAATTCTGTCAAGGTTATTCTGTAAATT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Function


GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU84676 True 5684 lncRNA 0.39 2 7014865 7020574

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
CI01000012_06989295_06990487 NA coding downstream 24022 6988932 ~ 6990843 (-)
CI01000012_06979304_06984075 NA coding downstream 29921 6979296 ~ 6984944 (-)
CI01000012_06872835_06911259 NA coding downstream 102897 6872715 ~ 6911968 (-)
CI01000012_06713565_06749032 NA coding downstream 265795 6713456 ~ 6749070 (-)
CI01000012_06694889_06695185 NA coding downstream 319642 6694787 ~ 6695223 (-)
CI01000012_07032479_07034631 NA coding upstream 11879 7020730 ~ 7035201 (-)
CI01000012_07092852_07097731 EPHX5 coding upstream 72278 7092852 ~ 7097731 (-)
CI01000012_07113504_07118919 MGME1 coding upstream 92782 7113356 ~ 7119168 (-)
CI01000012_07164949_07166936 NA coding upstream 144265 7164839 ~ 7166936 (-)
CI01000012_07210006_07251043 NA coding upstream 189021 7209595 ~ 7251043 (-)
G74142 NA non-coding downstream 156223 6769833 ~ 6858642 (-)
G74215 NA non-coding downstream 478228 6534877 ~ 6536637 (-)
G74066 NA non-coding downstream 686737 6327892 ~ 6328128 (-)
G74063 NA non-coding downstream 690295 6324358 ~ 6324570 (-)
G74117 NA non-coding upstream 17922 7038496 ~ 7053630 (-)
G74255 NA non-coding upstream 80851 7101425 ~ 7101860 (-)
G74256 NA non-coding upstream 81616 7102190 ~ 7102463 (-)
G74079 NA non-coding upstream 83479 7104053 ~ 7104444 (-)
G72629 NA other downstream 867371 6147011 ~ 6147494 (-)
G72294 NA other downstream 1549008 5462840 ~ 5465857 (-)
CI01000012_05414096_05416676 TTC9 other downstream 1598085 5413369 ~ 5416780 (-)
G72204 NA other downstream 1712659 5293773 ~ 5302206 (-)
G72068 NA other downstream 2234733 4776220 ~ 4780132 (-)
CI01000012_07356934_07358497 NA other upstream 334678 7356863 ~ 7358612 (-)
G74648 NA other upstream 1243755 8264329 ~ 8265654 (-)
G74701 NA other upstream 1346445 8367019 ~ 8367643 (-)
CI01000012_09068458_09070536 NA other upstream 2047332 9067906 ~ 9070765 (-)
CI01000012_09071892_09073410 NA other upstream 2050797 9071371 ~ 9073457 (-)

Expression



Co-expression Network