mien1 (mien1,sepw2a,LOC107566883)


Basic Information

Item Value
gene id mien1
gene name mien1,sepw2a,LOC107566883
gene type misc
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NW_019172828.1
NCBI id APWO02000046.1
chromosome length 5964967
location 826378 ~ 834058 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>TU407924
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>TU407925
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>TU407926
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>TU407927
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>XM_022664998.1
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Function

symbol description
mien1 Involved in negative regulation of apoptotic process; positive regulation of cell migration; and positive regulation of filopodium assembly. Located in several cellular components, including centriolar satellite; cytosol; and nucleoplasm. Is intrinsic component of the cytoplasmic side of the plasma membrane.

NR:

description
PREDICTED: migration and invasion enhancer 1 isoform X1

GO:

id name namespace
GO:0045454 cell redox homeostasis biological_process
GO:0008430 selenium binding molecular_function

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU407924 True 2314 lncRNA 0.39 4 826385 833888
TU407925 False 2286 lncRNA 0.39 5 826385 833888
TU407926 False 2306 lncRNA 0.39 5 826385 834058
TU407927 False 2287 lncRNA 0.39 5 826385 833888
XM_022664998.1 False 1565 mRNA 0.41 4 826378 833132

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC111191049 spop,LOC107754841,LOC100710366 coding upstream 569375 118768 ~ 257003 (+)
slc35b1 slc35b1,LOC107590797,LOC107582861,LOC107678880 coding upstream 814615 283 ~ 11763 (+)
LOC103033788 slc4a1 coding downstream 30791 864849 ~ 889789 (+)
ubtf ubtf,LOC102797579,LOC107689086 coding downstream 58037 892095 ~ 910156 (+)
atxn7l3 atxn7l3,LOC108276986,LOC107571925 coding downstream 77401 911459 ~ 924286 (+)
LOC103032830 NA coding downstream 115246 949304 ~ 958431 (+)
LOC103035075 NA coding downstream 127223 961281 ~ 964439 (+)
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G296616 NA non-coding upstream 111617 707871 ~ 714761 (+)
G296607 NA non-coding upstream 121309 636029 ~ 705069 (+)
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G296599 NA non-coding upstream 218071 608002 ~ 608307 (+)
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G296646 tmub2,LOC107708558,LOC107566939,LOC107754824,LOC107660620 non-coding downstream 94712 928770 ~ 931596 (+)
G296645 vat1,LOC107567018,LOC108413532 non-coding downstream 131384 965442 ~ 1053569 (+)
G296660 NA non-coding downstream 276230 1110288 ~ 1111113 (+)
G296754 NA non-coding downstream 393337 1227395 ~ 1230550 (+)
LOC103026352 ndufa4l,LOC103026352,LOC108413413,LOC108260900,LOC107684646,LOC107590798,LOC103357383,LOC107582867 other upstream 785487 36833 ~ 40891 (+)
G296679 tlk2,LOC108413572,LOC107660745 other downstream 357705 1191763 ~ 1200788 (+)
LOC103044283 LOC103044283,LOC108412482 other downstream 453458 1287516 ~ 1290420 (+)
G296790 tcap,LOC108413611 other downstream 525054 1359112 ~ 1361935 (+)
LOC111191028 grb2b,grb2,LOC108432081,LOC107719324,LOC108256494,LOC107672691,LOC107672145,LOC107723603 other downstream 2208374 3042432 ~ 3148603 (+)
LOC103030733 NA other downstream 2716269 3550327 ~ 3640614 (+)

Expression


Co-expression Network