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Basic Information


Item Value
gene id rab37
gene name rab37,zgc:112183,LOC106601425,LOC106606976,LOC105012908,LOC107654586,LOC108278300,LOC107665712
gene type coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NW_019172828.1
NCBI id APWO02000046.1
chromosome length 5964967
location 5278162 ~ 5344518 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence


>XM_022664960.1
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>XM_022664961.1
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TTCTACATGTTTTGAGAATCTGGCCTCTGGTTCCTCTATCAGGTCCGTCAGGTATTTTCTGAATAGTTTCAGCTTTTTTGCTAATGAGCCGCGCTGTGTAAAGGAGAATCTGTTTATAGATTATTGTTACTGGTCTGATTCAGTTGTTACTTGTTAGCTTTTGATGTCACACTGATAACGGTACTGTTACAGAGATCACAAAGTGCCAAGACGAAGTGCTTTGTAACTGTATACATTCTGTATAAACCTCTATTTTGTAATGTAGAGGA

Function


symbol description
zgc:112183 Predicted to enable GTP binding activity and GTPase activity.
rab37 Predicted to enable GTP binding activity and GTPase activity. Predicted to be involved in protein transport. Located in endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment.

NR:

description
PREDICTED: ras-related protein Rab-37

GO:

id name namespace
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GO:0015031 protein transport biological_process
GO:0005525 GTP binding molecular_function

KEGG:

id description
K07914 RAB37; Ras-related protein Rab-37

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_022664961.1 True 5269 mRNA 0.43 9 5305680 5344518

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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LOC103033642 LOC103033642,LOC108431896,LOC107553625 coding downstream 374551 5719069 ~ 5719464 (+)
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znf653 znf653,LOC106601361,LOC107553636,LOC104961106,LOC103393609 other upstream 844091 4419997 ~ 4434071 (+)
LOC103041102 LOC108440983,LOC108258030,LOC107718582,LOC107661664,LOC107715658,LOC107695723,LOC107550253 other upstream 978715 4253016 ~ 4299447 (+)
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LOC111191028 grb2b,grb2,LOC108432081,LOC107719324,LOC108256494,LOC107672691,LOC107672145,LOC107723603 other upstream 2129559 3042432 ~ 3148603 (+)
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Expression



Co-expression Network