ppip5k2 (ppip5k2)



Basic Information


Item Value
gene id ppip5k2
gene name ppip5k2
gene type coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NW_019172836.1
NCBI id APWO02000054.1
chromosome length 895725
location 315982 ~ 359784 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence


>XM_007255307.3
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Function


symbol description
ppip5k2 Predicted to enable diphosphoinositol-pentakisphosphate kinase activity; inositol heptakisphosphate kinase activity; and inositol hexakisphosphate kinase activity. Predicted to be involved in inositol metabolic process and inositol phosphate biosynthetic process. Predicted to act upstream of or within phosphorylation. Predicted to be located in cytoplasm. Predicted to be active in cytosol. Human ortholog(s) of this gene implicated in autosomal recessive nonsyndromic deafness 100. Orthologous to human PPIP5K2 (diphosphoinositol pentakisphosphate kinase 2).

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inositol hexakisphosphate and diphosphoinositol-pentakisphosphate kinase 2 isoform X12

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RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_007255307.3 False 6365 mRNA 0.47 32 315982 359784
XM_007255308.3 False 6343 mRNA 0.47 31 315983 359784
XM_007255309.3 False 6301 mRNA 0.47 31 315983 359784
XM_007255310.3 False 6280 mRNA 0.47 30 315983 359784
XM_007255311.3 False 6244 mRNA 0.47 31 315983 359784
XM_007255312.3 False 6232 mRNA 0.47 32 315983 359784
XM_007255313.3 False 6223 mRNA 0.47 30 315983 359784
XM_007255314.3 False 6190 mRNA 0.47 31 315983 359784
XM_007255315.3 False 6160 mRNA 0.47 29 315983 359784
XM_007255316.3 False 6070 mRNA 0.47 30 315983 359784
XM_007255317.3 False 5985 mRNA 0.47 28 315984 359784
XM_022665566.1 False 6404 mRNA 0.47 33 315982 359784
XM_022665567.1 True 6407 mRNA 0.47 33 315982 359784

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
pam pam,LOC107577007,LOC107737006 coding upstream 6474 187642 ~ 309508 (+)
reep5 reep5,LOC107740782,LOC107715872,LOC108246451 coding upstream 234791 71276 ~ 81191 (+)
LOC103030803 aph1a,LOC108427283,LOC100304952,LOC105021718,LOC107670051 coding upstream 291334 7635 ~ 24648 (+)
cunh5orf30 cunh5orf30,zgc:194281,c16h5orf30,LOC107564120,LOC107740794,LOC107670048,LOC107665462,LOC107715868 coding downstream 7163 366947 ~ 372699 (+)
LOC103024265 NA coding downstream 22271 382055 ~ 383879 (+)
LOC103024567 LOC108427294,LOC108413448 coding downstream 25719 385503 ~ 389270 (+)
LOC103025635 LOC103025635 coding downstream 36175 395959 ~ 398846 (+)
LOC103031748 NA coding downstream 42683 402467 ~ 404751 (+)
G303228 chd1 non-coding upstream 223362 90240 ~ 92620 (+)
G303226 chd1 non-coding upstream 228104 85897 ~ 87878 (+)
G303221 NA non-coding upstream 254669 59902 ~ 61313 (+)
G303218 NA non-coding upstream 264942 30569 ~ 51040 (+)
G303305 NA non-coding downstream 2161 361945 ~ 363425 (+)
G303340 NA non-coding downstream 80638 440422 ~ 446559 (+)
G303341 NA non-coding downstream 84075 443859 ~ 445869 (+)
LOC111191252 NA non-coding downstream 191586 551370 ~ 567446 (+)
G303418 NA non-coding downstream 432568 792352 ~ 795312 (+)
G303307 cunh5orf30,zgc:194281,c16h5orf30,LOC107564120,LOC107740794,LOC107670048,LOC107665462,LOC107715868 other downstream 6209 365993 ~ 383873 (+)
LOC111191247 NA other downstream 446306 806090 ~ 806546 (+)

Expression



Co-expression Network