cunh5orf30 (cunh5orf30,zgc:194281,c16h5orf30,LOC107564120,LOC107740794,LOC107670048,LOC107665462,LOC107715868)
Chromosome Information
Item |
Value |
chromosome id |
NW_019172836.1 |
NCBI id |
APWO02000054.1
|
chromosome length |
895725 |
location |
366947 ~ 372699 (+) |
genome version |
Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome |
Sequence
>XM_022665558.1
ATATCCATTTTGCCTGCTGCTGAGGTCAAAGCTACTCTGAAGCCCGAGGCAGATAAGCCGCGCTGCTCCAGCACCCCATGCTCGCCTATCAAAAGTACTGTTTCGGGATACCAAATCCTCCACATGAACTCTAACTACCTGGTGGGATTTACCACCGGCGAGGAGCTCCTTAAACTGGCCCACAAGTGGTCCGGTCCTGAGAAGAGCAACACAGAGGCCTTGCCCAGTCCTGTAAAGAAGCCTGTGGATCTGGGCCTGCACCGCGCCTCGCGTATTTACAAAGCCAAAAGCCGCTTCTATCAGCCCTACGACATCCCGGCCGTCAACGGGCGCAGGAGGAGGCGCATGCCCAGCTCCAGCGAATCCTGCTTCAGGTCCCTGGCAGCCAGCGAGCCCAGCAAGGCTCTGCACGGGCCTCTGCCCCTCTGCCTGCTCAAGGGCAAGCGGGCACACTCCAAGTCCCTGGACTACCTCAACCTGGACAAGATGAGCCTCAGGGAGCCGGCGGACACTGAGGTGCTGCAgtaccagctccagcaccttacCTTGCGGGGAGAGCGCATGTTCAACAGGAACAAAACATGAGCGGAGGGCCGCCATCGCGGACTGATCGCATCCACAGCCAGACCACCCTCTCCACCACAGGAGGGGAGTTTGGCTGCTGATTTGCTGTTTCTGGGCCTTGCGTTTCTCCACTCAGTTCATAGGCAGTTCCTGTAGTAAGGCACCCATAGACCACTAATCTTAATTTAAGAACTGTTAATCAGAAGGTATGGATGAGGCATTGTCAGTCAGGCCCGCCGACTAATTTAATCGTTAACCTGtgaacaagaaaaaagaaaagaaaaacaaaaaaaaaattgttttgatagtgtgtgtatgtatgtgtgtgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtgcgtgtgggcACATTTGTGCAGAAGTATGTTTGAGTGTATGtgaatgtatgtgtatgtgtatgtcaGATGTCAGGAGGATACGTTTGATAAACGTGAGGGTTGAGGTCATTCAGGATTAGCAATAAATGACTTTTGGCTTAATAATTGCTACTACTGTATGTGCGTGTACGCCTGTGCTATAAGGTGTTATATACCTTTGTGTGGAAAAGCCTCTTTTGCAGAAACGTAAGTATGTATGTAAGCTCTGCACTGGATCGCACTGTTAGTACATCTggatatgtatatttattgtttttgtattttatttgattttgtttaTATCATTCATTTTGTCCTGGTTAGTTCACTGTGTTGTTCTCCGTTCTCCTCTAATGTTATGTTAGCGTATTCGCAACTATAGCATCTTCTCAAATGTGTCATCAGGTGAGCTCACCTTCACCTTCGCTCCTGCTTTtgcctccgtctggcaggaatCTTCATGTAAAACTCTGACTTGTTACACAATCTGTGGGTTATTTAAGACAGCGCTGTGAGAGGCTTTGAGCTGGAGAGGCTTATCTTCAGAGAACCTGAGCTAAGATTAGAGCCTCATATACACACTGTTAATCCTCCCTTTCCATTTTttcaccccccacacacaccccgTGCCCCCATACACCGCAGGACGCCGCTCGGATTACTCTagtcctgtttttttcttttccagatTGAGTAATCCTTCCTGTTGGGAATCGCTTTCATGATAACGTGAAGGATCTACATGGGTATACAGCGCTGATATGATGCTGGTCCATGTTTACACACATCATTATATCAGATATGAATATGATCctgctttctttattttgttgttggtgTTTATTTCTCATCTTGGTGCACAGTATTGCTACTGAAACAAACCAAAGGATAAACTTACTTTGGGTGTCCTGGGGAAAACTTGATTGCTAatgtgattttcttttcttttttttttcttttttgtggaaCACCTGACAATCATATCCAGATTTTCTACCCAATAAGCCAAACAGCTGGAAACGTCAGCTGGTTCACATCGCTCATATTCTGCTGCCGGCCAggcatgttttttcttttatttgttttctaaatataaaacatttgtaaTATGTCTTACTATTTAAAGCTATAATTAGTGTACTATTTATTGTCTACTAGTACCATTGACatcatcactactactactactactactactactactactactactactactactacttctattaCCACTACCAGTAAATAGTGTGGACCTGATACAGTGGTTTGAAAAGCATGCAACGGATTTGTTTTTAAAGACCATCTTTAAGATTTAGGCTAGTGCATTTGTATTTACCtgtgttttttatggttttatggtCAAATAATACACTATCCTGAATGTcgtaatgtttaatgtttattttttaagtccCCATATCTGCACCCTAATCTGATTGcccattatatttaatttgatcttttttattattatttctttctatgtttaatataaattaggatttcatatattttttttcttactcaaATAATGGAAGTATGTTTGGTTTGATGTGGAATTGTACACAAAAGGCTCTTTTTTGTGGGTTGTTTGCTGGAAAGCTACAAATTACAGTGAATGCTTTGTTGGaagttttatttaaagcagGTTTTGTGGTAGGATTGAGTGTAATTGGGTGTAATGTCGGGTAACATCCTCATTGTACCTTTTGGGGGTGTAAAGGTACGCAAAAGTCTATGGTACGATTTGGGTTTGGATGTCGTTcttggtgtggcacagtggataacactacCCTCTGCATGtgggggttcaattcctgggtttgggtggggagggggggggggacttTTGCATTTTGAATAGACATTTGTGCAAGTCGTTTTTCCGTCCATCTGTCCTTCTATTAGATTTTTTCAGCAGTAAAGTGTAATTATTAGCATGTCTGATATGTTAgaatactcacacacacagacaaatgcAGACACACCGTCCTCATCCAATCCACTATGATTTCATGAGTTGGAATAAGCTGTTAAACAAGCATTTCTCAGATATTCTGGCTTTTACGTTCAATCATTTCAAGCATAAAGGTGAGAAcagtgagagataaagaataaatagaTATAAACAACTTTTGTTTCTACATGAGGAGTGGGAGGGGTTAGGGGGGtacaaacaagactacagttTTCACAGTATCATAGCGCACTACAATCCCCTCAATAGTGTGCAAATCCAACAACATCTTACAGCTTAATGCTACATTCTGTTTAGTCGGATATCTAAGCTGGGAATGATGCCACACCCGAGCTGACTGTGTTCCAGTTAAACATAATGATTATTGTACATTCattgtacataaatataaaaaaaaaaacaacaacagttgAGTTCAGTTGGTTTGACAGTTCTTTATCAGTGTTTAATGGCAAATCTAACCAAAATATTTCCAACTTTTTATGTTGCAGCATTGTACCAGGTTAGCATTATTAGTGTCGCCAGTTAaccagattataatgcattataggGAATCAAGCAAAACACTATGGAATCATCCACTGGTAGACGGACAGTAATCAGTAATACTAAACTGCATAAATGTAATGCTAAACATTACTACTATTCATGTTACTATTGGTGAGGGTTAGCTCTCCTGACTTTCTGAGTAGGAAATCCATCATGTTTGGTTGTTTTAGTTTACGATTCCTACTTAAAACGAATAAATTCTGACATGTGGGTTTTAATAGAATACAGCATTAACCTGTAAGTGTGTGCTGTGTACAGTACATGACCCCGTACTGTAATTCATACATGTACCATGACGACTATGCGTACCGTTACACTCCTGGCACCTTTTAATATTAAGGTTAATTAataactgtttactgtttagatGATATGCACtagactttattattttttctttatttattttttgttttgttttgtttttttgttcattgaTAAGCGAATATTTACTACGAATGCTGAGAAGAGCACCTTAGACTTAGACATCAGTGATATATATTGGTGGGATTTCCTCTCGTCCTGACTGAACTGCATATTGATCCTACgtgttgcttttcttttttctttttgcctaTTTGTTTACATATTGAGTGTTTTACTTTAAGGCTGGAATACTGTTGTGTGATTGGTTGTGTGTTTGAttcttttgatgttttttggacTGATTTTGATTTGTATTGTGCCAGATTTATTATTGCTGTGAACATAAATGGATAAAGGCTGCAGCTCTTGGCTGCTGATCTGAGCTCTGCTATGTACCGTTTATCTTAAAATAAGGGAATAATAGGAAGCTGTGTGATTTCTGTGACTCAGGACTGAGCCGGACTGTTTCTCAAGTCGTTTCTCAGCACAGTAACACTACAGCCCTGTACTGCTTATAGTTCTAAAACGGTTCCTGCTGActgattttctatattttaccTGTCGAGGTGTCCCAATAACTATAATTAGAACTCGGAGACCATAAACACATCTGATTTATTTGATAGGATCAGCTTGTAGGATTAAAATCTTGACCATGGCATTATCATACTTTAAGAGCTGAACTGGAAACTTCTGgaacacatttttattgttcttgCATCACCAAGTAAAAAAATCTGCTGTaatgtgtgaatgtgattttaaaAGCTGATACAAAACCCCTGTTTACAACTGATCACTTAATCCTccttgagtatcaggattaaATCTGAATAAGTAAAAGCCACATgaaaatgcaagtgtaaaccCACCGAATACACATGTAAATATGATTGATTGATATCTCTCTCAAACAaattcaggaggtggtctgagatggTGGTTTTTGAGCCACATGTTGAAGCAGTGTAAACACAGCACTTTCCATCTCCAATGAACATGCaaggacaaataaaaaaaaacagtaaacttTGGCATATTATGagcaattttaaatattttttttttttcgaaaaacaaactaaataaatggaGATTTATTGACTACCAAATAGCTACAATCAAATTAGGACACAATCCagatattactcaaataatgtaaCCAGGTGTAAAC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Function
NR:
description |
PREDICTED: UNC119-binding protein C5orf30 homolog |
GO:
id |
name |
namespace |
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|
protein transport |
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Kupffer's vesicle development |
biological_process |
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|
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biological_process |
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|
ciliary transition zone |
cellular_component |
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|
cytoplasm |
cellular_component |
KEGG: NA
RNA
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representative |
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exon number |
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XM_022665558.1 |
True |
5753 |
mRNA |
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1 |
366947 |
372699 |
Neighbor
gene id |
symbol |
gene type |
direction |
distance |
location |
ppip5k2 |
ppip5k2
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coding |
upstream |
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pam |
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reep5,LOC107740782,LOC107715872,LOC108246451
|
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|
coding |
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|
coding |
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|
coding |
downstream |
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LOC103025635
|
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downstream |
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NA
|
coding |
downstream |
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syk |
syk
|
coding |
downstream |
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NA
|
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upstream |
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|
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upstream |
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chd1
|
non-coding |
upstream |
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G303221 |
NA
|
non-coding |
upstream |
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NA
|
non-coding |
upstream |
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NA
|
non-coding |
downstream |
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G303341 |
NA
|
non-coding |
downstream |
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NA
|
non-coding |
downstream |
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G303418 |
NA
|
non-coding |
downstream |
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G303413 |
NA
|
non-coding |
downstream |
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LOC111191247 |
NA
|
other |
downstream |
433391 |
806090 ~ 806546 (+) |
Expression