cunh5orf30 (cunh5orf30,zgc:194281,c16h5orf30,LOC107564120,LOC107740794,LOC107670048,LOC107665462,LOC107715868)



Basic Information


Item Value
gene id cunh5orf30
gene name cunh5orf30,zgc:194281,c16h5orf30,LOC107564120,LOC107740794,LOC107670048,LOC107665462,LOC107715868
gene type coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NW_019172836.1
NCBI id APWO02000054.1
chromosome length 895725
location 366947 ~ 372699 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence


>XM_022665558.1
ATATCCATTTTGCCTGCTGCTGAGGTCAAAGCTACTCTGAAGCCCGAGGCAGATAAGCCGCGCTGCTCCAGCACCCCATGCTCGCCTATCAAAAGTACTGTTTCGGGATACCAAATCCTCCACATGAACTCTAACTACCTGGTGGGATTTACCACCGGCGAGGAGCTCCTTAAACTGGCCCACAAGTGGTCCGGTCCTGAGAAGAGCAACACAGAGGCCTTGCCCAGTCCTGTAAAGAAGCCTGTGGATCTGGGCCTGCACCGCGCCTCGCGTATTTACAAAGCCAAAAGCCGCTTCTATCAGCCCTACGACATCCCGGCCGTCAACGGGCGCAGGAGGAGGCGCATGCCCAGCTCCAGCGAATCCTGCTTCAGGTCCCTGGCAGCCAGCGAGCCCAGCAAGGCTCTGCACGGGCCTCTGCCCCTCTGCCTGCTCAAGGGCAAGCGGGCACACTCCAAGTCCCTGGACTACCTCAACCTGGACAAGATGAGCCTCAGGGAGCCGGCGGACACTGAGGTGCTGCAgtaccagctccagcaccttacCTTGCGGGGAGAGCGCATGTTCAACAGGAACAAAACATGAGCGGAGGGCCGCCATCGCGGACTGATCGCATCCACAGCCAGACCACCCTCTCCACCACAGGAGGGGAGTTTGGCTGCTGATTTGCTGTTTCTGGGCCTTGCGTTTCTCCACTCAGTTCATAGGCAGTTCCTGTAGTAAGGCACCCATAGACCACTAATCTTAATTTAAGAACTGTTAATCAGAAGGTATGGATGAGGCATTGTCAGTCAGGCCCGCCGACTAATTTAATCGTTAACCTGtgaacaagaaaaaagaaaagaaaaacaaaaaaaaaattgttttgatagtgtgtgtatgtatgtgtgtgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtgcgtgtgggcACATTTGTGCAGAAGTATGTTTGAGTGTATGtgaatgtatgtgtatgtgtatgtcaGATGTCAGGAGGATACGTTTGATAAACGTGAGGGTTGAGGTCATTCAGGATTAGCAATAAATGACTTTTGGCTTAATAATTGCTACTACTGTATGTGCGTGTACGCCTGTGCTATAAGGTGTTATATACCTTTGTGTGGAAAAGCCTCTTTTGCAGAAACGTAAGTATGTATGTAAGCTCTGCACTGGATCGCACTGTTAGTACATCTggatatgtatatttattgtttttgtattttatttgattttgtttaTATCATTCATTTTGTCCTGGTTAGTTCACTGTGTTGTTCTCCGTTCTCCTCTAATGTTATGTTAGCGTATTCGCAACTATAGCATCTTCTCAAATGTGTCATCAGGTGAGCTCACCTTCACCTTCGCTCCTGCTTTtgcctccgtctggcaggaatCTTCATGTAAAACTCTGACTTGTTACACAATCTGTGGGTTATTTAAGACAGCGCTGTGAGAGGCTTTGAGCTGGAGAGGCTTATCTTCAGAGAACCTGAGCTAAGATTAGAGCCTCATATACACACTGTTAATCCTCCCTTTCCATTTTttcaccccccacacacaccccgTGCCCCCATACACCGCAGGACGCCGCTCGGATTACTCTagtcctgtttttttcttttccagatTGAGTAATCCTTCCTGTTGGGAATCGCTTTCATGATAACGTGAAGGATCTACATGGGTATACAGCGCTGATATGATGCTGGTCCATGTTTACACACATCATTATATCAGATATGAATATGATCctgctttctttattttgttgttggtgTTTATTTCTCATCTTGGTGCACAGTATTGCTACTGAAACAAACCAAAGGATAAACTTACTTTGGGTGTCCTGGGGAAAACTTGATTGCTAatgtgattttcttttcttttttttttcttttttgtggaaCACCTGACAATCATATCCAGATTTTCTACCCAATAAGCCAAACAGCTGGAAACGTCAGCTGGTTCACATCGCTCATATTCTGCTGCCGGCCAggcatgttttttcttttatttgttttctaaatataaaacatttgtaaTATGTCTTACTATTTAAAGCTATAATTAGTGTACTATTTATTGTCTACTAGTACCATTGACatcatcactactactactactactactactactactactactactactactactacttctattaCCACTACCAGTAAATAGTGTGGACCTGATACAGTGGTTTGAAAAGCATGCAACGGATTTGTTTTTAAAGACCATCTTTAAGATTTAGGCTAGTGCATTTGTATTTACCtgtgttttttatggttttatggtCAAATAATACACTATCCTGAATGTcgtaatgtttaatgtttattttttaagtccCCATATCTGCACCCTAATCTGATTGcccattatatttaatttgatcttttttattattatttctttctatgtttaatataaattaggatttcatatattttttttcttactcaaATAATGGAAGTATGTTTGGTTTGATGTGGAATTGTACACAAAAGGCTCTTTTTTGTGGGTTGTTTGCTGGAAAGCTACAAATTACAGTGAATGCTTTGTTGGaagttttatttaaagcagGTTTTGTGGTAGGATTGAGTGTAATTGGGTGTAATGTCGGGTAACATCCTCATTGTACCTTTTGGGGGTGTAAAGGTACGCAAAAGTCTATGGTACGATTTGGGTTTGGATGTCGTTcttggtgtggcacagtggataacactacCCTCTGCATGtgggggttcaattcctgggtttgggtggggagggggggggggacttTTGCATTTTGAATAGACATTTGTGCAAGTCGTTTTTCCGTCCATCTGTCCTTCTATTAGATTTTTTCAGCAGTAAAGTGTAATTATTAGCATGTCTGATATGTTAgaatactcacacacacagacaaatgcAGACACACCGTCCTCATCCAATCCACTATGATTTCATGAGTTGGAATAAGCTGTTAAACAAGCATTTCTCAGATATTCTGGCTTTTACGTTCAATCATTTCAAGCATAAAGGTGAGAAcagtgagagataaagaataaatagaTATAAACAACTTTTGTTTCTACATGAGGAGTGGGAGGGGTTAGGGGGGtacaaacaagactacagttTTCACAGTATCATAGCGCACTACAATCCCCTCAATAGTGTGCAAATCCAACAACATCTTACAGCTTAATGCTACATTCTGTTTAGTCGGATATCTAAGCTGGGAATGATGCCACACCCGAGCTGACTGTGTTCCAGTTAAACATAATGATTATTGTACATTCattgtacataaatataaaaaaaaaaacaacaacagttgAGTTCAGTTGGTTTGACAGTTCTTTATCAGTGTTTAATGGCAAATCTAACCAAAATATTTCCAACTTTTTATGTTGCAGCATTGTACCAGGTTAGCATTATTAGTGTCGCCAGTTAaccagattataatgcattataggGAATCAAGCAAAACACTATGGAATCATCCACTGGTAGACGGACAGTAATCAGTAATACTAAACTGCATAAATGTAATGCTAAACATTACTACTATTCATGTTACTATTGGTGAGGGTTAGCTCTCCTGACTTTCTGAGTAGGAAATCCATCATGTTTGGTTGTTTTAGTTTACGATTCCTACTTAAAACGAATAAATTCTGACATGTGGGTTTTAATAGAATACAGCATTAACCTGTAAGTGTGTGCTGTGTACAGTACATGACCCCGTACTGTAATTCATACATGTACCATGACGACTATGCGTACCGTTACACTCCTGGCACCTTTTAATATTAAGGTTAATTAataactgtttactgtttagatGATATGCACtagactttattattttttctttatttattttttgttttgttttgtttttttgttcattgaTAAGCGAATATTTACTACGAATGCTGAGAAGAGCACCTTAGACTTAGACATCAGTGATATATATTGGTGGGATTTCCTCTCGTCCTGACTGAACTGCATATTGATCCTACgtgttgcttttcttttttctttttgcctaTTTGTTTACATATTGAGTGTTTTACTTTAAGGCTGGAATACTGTTGTGTGATTGGTTGTGTGTTTGAttcttttgatgttttttggacTGATTTTGATTTGTATTGTGCCAGATTTATTATTGCTGTGAACATAAATGGATAAAGGCTGCAGCTCTTGGCTGCTGATCTGAGCTCTGCTATGTACCGTTTATCTTAAAATAAGGGAATAATAGGAAGCTGTGTGATTTCTGTGACTCAGGACTGAGCCGGACTGTTTCTCAAGTCGTTTCTCAGCACAGTAACACTACAGCCCTGTACTGCTTATAGTTCTAAAACGGTTCCTGCTGActgattttctatattttaccTGTCGAGGTGTCCCAATAACTATAATTAGAACTCGGAGACCATAAACACATCTGATTTATTTGATAGGATCAGCTTGTAGGATTAAAATCTTGACCATGGCATTATCATACTTTAAGAGCTGAACTGGAAACTTCTGgaacacatttttattgttcttgCATCACCAAGTAAAAAAATCTGCTGTaatgtgtgaatgtgattttaaaAGCTGATACAAAACCCCTGTTTACAACTGATCACTTAATCCTccttgagtatcaggattaaATCTGAATAAGTAAAAGCCACATgaaaatgcaagtgtaaaccCACCGAATACACATGTAAATATGATTGATTGATATCTCTCTCAAACAaattcaggaggtggtctgagatggTGGTTTTTGAGCCACATGTTGAAGCAGTGTAAACACAGCACTTTCCATCTCCAATGAACATGCaaggacaaataaaaaaaaacagtaaacttTGGCATATTATGagcaattttaaatattttttttttttcgaaaaacaaactaaataaatggaGATTTATTGACTACCAAATAGCTACAATCAAATTAGGACACAATCCagatattactcaaataatgtaaCCAGGTGTAAAC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Function


NR:

description
PREDICTED: UNC119-binding protein C5orf30 homolog

GO:

id name namespace
GO:0015031 protein transport biological_process
GO:0070121 Kupffer's vesicle development biological_process
GO:0060271 cilium assembly biological_process
GO:0035869 ciliary transition zone cellular_component
GO:0005737 cytoplasm cellular_component

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_022665558.1 True 5753 mRNA 0.39 1 366947 372699

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
ppip5k2 ppip5k2 coding upstream 7163 315982 ~ 359784 (+)
pam pam,LOC107577007,LOC107737006 coding upstream 57439 187642 ~ 309508 (+)
reep5 reep5,LOC107740782,LOC107715872,LOC108246451 coding upstream 285756 71276 ~ 81191 (+)
LOC103030803 aph1a,LOC108427283,LOC100304952,LOC105021718,LOC107670051 coding upstream 342299 7635 ~ 24648 (+)
LOC103024265 NA coding downstream 9356 382055 ~ 383879 (+)
LOC103024567 LOC108427294,LOC108413448 coding downstream 12804 385503 ~ 389270 (+)
LOC103025635 LOC103025635 coding downstream 23260 395959 ~ 398846 (+)
LOC103031748 NA coding downstream 29768 402467 ~ 404751 (+)
syk syk coding downstream 59888 432587 ~ 548171 (+)
G303305 NA non-coding upstream 3522 361945 ~ 363425 (+)
G303228 chd1 non-coding upstream 274327 90240 ~ 92620 (+)
G303226 chd1 non-coding upstream 279069 85897 ~ 87878 (+)
G303221 NA non-coding upstream 305634 59902 ~ 61313 (+)
G303218 NA non-coding upstream 315907 30569 ~ 51040 (+)
G303340 NA non-coding downstream 67723 440422 ~ 446559 (+)
G303341 NA non-coding downstream 71160 443859 ~ 445869 (+)
LOC111191252 NA non-coding downstream 178671 551370 ~ 567446 (+)
G303418 NA non-coding downstream 419653 792352 ~ 795312 (+)
G303413 NA non-coding downstream 433014 805713 ~ 809762 (+)
LOC111191247 NA other downstream 433391 806090 ~ 806546 (+)

Expression



Co-expression Network