G84386


Basic Information

Item Value
gene id G84386
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000013
NCBI id null
chromosome length 12551977
location 10644446 ~ 10657577 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU96032
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU96032 True 12938 lncRNA 0.38 2 10644446 10657577

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000013_10586449_10594082 NA coding upstream 50004 10585818 ~ 10594442 (+)
CI01000013_10502138_10525511 GRM3 coding upstream 118772 10500690 ~ 10525674 (+)
CI01000013_10335904_10336688 NA coding upstream 307550 10335904 ~ 10336896 (+)
CI01000013_10261599_10283287 NA coding upstream 360479 10260271 ~ 10283967 (+)
CI01000013_09681047_09683275 LRRC4, LRRC4.2 coding upstream 961013 9681047 ~ 9683433 (+)
CI01000013_10756927_10790192 FRMD4A coding downstream 99350 10756927 ~ 10792761 (+)
CI01000013_10808688_10819703 NA coding downstream 151111 10808688 ~ 10819925 (+)
CI01000013_10821530_10827412 SEPHS1, SEPHS1.L coding downstream 163953 10821530 ~ 10827977 (+)
CI01000013_10865753_10884937 MAPK8IP2 coding downstream 208176 10865753 ~ 10886301 (+)
CI01000013_10916049_11031034 NA coding downstream 256118 10913695 ~ 11031159 (+)
G84390 NA non-coding upstream 641 10633395 ~ 10643805 (+)
G84405 NA non-coding upstream 30069 10614151 ~ 10614377 (+)
G84404 NA non-coding upstream 32031 10612194 ~ 10612415 (+)
G84403 NA non-coding upstream 33217 10610973 ~ 10611229 (+)
G84389 NA non-coding upstream 40516 10603574 ~ 10603930 (+)
G84410 NA non-coding downstream 149732 10807309 ~ 10807963 (+)
G84383 NA non-coding downstream 184139 10841716 ~ 10850104 (+)
G84444 NA non-coding downstream 247608 10905185 ~ 10905428 (+)
G84445 NA non-coding downstream 253596 10911173 ~ 10911440 (+)
G84250 NA other upstream 428484 10215127 ~ 10215962 (+)
G84215 NA other upstream 565110 10076454 ~ 10079336 (+)
G84194 NA other upstream 607653 10030608 ~ 10036953 (+)
G84005 NA other upstream 1042211 9601611 ~ 9602235 (+)
G82581 NA other upstream 1309498 9329329 ~ 9334948 (+)
G84768 NA other downstream 1512412 12169989 ~ 12170818 (+)
G84790 NA other downstream 1527365 12184942 ~ 12201975 (+)
G84864 NA other downstream 1707472 12365049 ~ 12375905 (+)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) G2351104 NA non-coding NW_023493687.1 JAAXML020000410.1 87017 ~ 92509 (+)