G57043


Basic Information

Item Value
gene id G57043
gene name NA
gene type non-coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035902.1
NCBI id CM008305.1
chromosome length 52532229
location 36825767 ~ 36839252 (-)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>TU76963
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TGCGGGTCAACTCATTAGTAAGTAATTGACTAGATGGACCGGGC
>TU76964
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>TU76965
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU76963 True 5044 lncRNA 0.38 4 36827394 36833067
TU76964 False 2004 lncRNA 0.40 4 36825767 36833067
TU76965 False 3469 lncRNA 0.38 4 36827394 36839252

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC103045252 LOC108438351 coding downstream 7556 36796730 ~ 36818211 (-)
LOC103045561 phf19,LOC107557185,LOC107599052,LOC106585785 coding downstream 47457 36755166 ~ 36778310 (-)
LOC103045855 LOC108438352,LOC108265896 coding downstream 184204 36605407 ~ 36641563 (-)
med27 med27,LOC107665006,LOC107557205,LOC107725311,LOC107757301 coding downstream 333053 36412872 ~ 36492714 (-)
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LOC111192681 si:ch211-240g9.1,LOC108438565,LOC108264952,LOC107598959,LOC107653411,LOC105925911,LOC100700110 coding upstream 551190 37390442 ~ 37476012 (-)
tbc1d22b tbc1d22b,LOC108438566,LOC107653399,LOC107674367,LOC107734531 coding upstream 708507 37547759 ~ 37599298 (-)
LOC103031835 pim1,LOC103031835,LOC108438567,LOC107584899,LOC107598956,LOC107734527,LOC108265925,LOC107674355,LOC107725309 coding upstream 791805 37631057 ~ 37635455 (-)
G57012 NA non-coding downstream 222339 36600038 ~ 36603428 (-)
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G57121 nras,LOC107598969,LOC107725308 non-coding upstream 278192 37117444 ~ 37207042 (-)
G57147 dennd2c,LOC108438557,LOC107665005,LOC107674357,LOC107566809,LOC107734514,LOC107598967 non-coding upstream 336049 37175301 ~ 37181186 (-)
G57149 bcas2,LOC107566810,LOC107734517,LOC107674303 non-coding upstream 345188 37184440 ~ 37186552 (-)
G57166 trim33 non-coding upstream 390946 37230198 ~ 37237667 (-)
LOC111192678 phf19 other downstream 33323 36785308 ~ 36792444 (-)
LOC107196826 LOC108438352,LOC106580127,LOC108265896,LOC106585786 other downstream 79133 36680166 ~ 36746634 (-)
G57014 NA other downstream 422469 36402850 ~ 36403298 (-)
G56987 atp2a2,atp2a2a,LOC108265716,LOC107580452 other downstream 505072 36319056 ~ 36320695 (-)
LOC103023491 fnbp1,LOC107599022,LOC108264955 other downstream 564222 36226129 ~ 36261545 (-)
brpf3 brpf3,LOC108265695 other upstream 441861 37281113 ~ 37299607 (-)
LOC103043112 LOC108438563,LOC108265696,LOC107725303,LOC107653398,LOC107598961,LOC107674288,LOC107734522,LOC107570980,LOC105889772 other upstream 462795 37302047 ~ 37326736 (-)
LOC111192682 NA other upstream 1421865 38261117 ~ 38305466 (-)
LOC103030299 fkbp1aa,fkb1b,fkbp1a,LOC103030299,LOC107553142,LOC107574256,LOC107752559,LOC107707744 other upstream 2682292 39521544 ~ 39562921 (-)
G57727 kdm5c,LOC107550909,LOC107747206,LOC107570512 other upstream 3278537 40117789 ~ 40119095 (-)

Expression


Co-expression Network