tprg1l (tprg1l,LOC107710788,LOC107678419,LOC107698845,LOC106513028)



Basic Information


Item Value
gene id tprg1l
gene name tprg1l,LOC107710788,LOC107678419,LOC107698845,LOC106513028
gene type misc
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_035902.1
NCBI id CM008305.1
chromosome length 52532229
location 40748741 ~ 40756014 (-)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence


>TU78113
ggaggaggaggagctgctgtCAGAAACAGCGAGGTTCAGCTCGCTCTGTGTTATTATCACTGAACAGGAGATAACTACACTTATCTGTGCGGAGTCGTGCTGTCGGCCGCTGAACTGAGCTCCTCTCCGCTACGATGCTTCAGCTGAACGACACCGTGGAGCCCGAGAGCCCCGGCGCCGCAGTGCTGCACGCGGCCGAGGTGGAGGACGGGGTGGAGGTCGCCTTCACGCCGCCCGCGGGCCACCACAGCCGGGGCTTCGAGGTAGCGGCCGTGGCCTGCTGCTCCCCGCTCCAGAAACTCACGCCCTTCCACGTCCACAACCCCACGATGCAGGCCAAGGTGAAGGACTACTTCGTGTTCAGGGAACTATAGAGCAGGCAGTGAACGATATCCGCACAGTGGCGTTGCCTTCAGAAGATGGAGAGGTTCTCAGTGTGTGGCTCCTGGCAGAAGTTGATCACTGGAATAACGAGAAGGAGAGGCTGGTGCTGATAACAGAAAGGTCTTTGCTGGTTTGCAAATACGACTTCATAAACCTGCAGTGTCAACAAGTTATCAGGATTTCTTTAAATGCTGTGGACACGATTTCCATTGGGGATTTTGAGTTTCCTCCAAAATCTCTCAACAAGAGAGAAGGAAGTGGTATTCGTGTGCAGTGGGATAAACGGCCGAGACCTTCTTTTCTCAATCGCTGGAACCCCTGGTCCACAGACATGCCATATGCCACCTTCACAGAGCACCCCATGGCCCATGCTGATGAAAAGGTGGCTTCTCTCTGCCAGCTTGAGAACTTCAAAACTCAGCTAATTCAGGCTGTGAAAAAGGCCCACAAGGAGTTCCCCATCCCAGGCCGAGCCAACGGAGTGCTGCTGTTGGAGCGGCCCCTCCTGATAGAGAcatatcttggcatcatgtccttCATCAACAACGAGGCCAAACTAGGCTACTCCATGACCAGAGGCAAAATCGGCTTCTAGTTCCGCCTGAGCGTCTGATCTCTGACCACACCCACCTGGCATCTCCACTGACTGGTACTGTTACACTCGAGTAGGTCAAACTAAGTGAACCCCCTTTTGTGCCGCTTGCCAGATTTCAGTGTGGGTGCCCTCTCTCCACCCTGACAGTGTTCATCACTGACTCACTCAGCAGCATGTGCCTGGAAGCATCCGATGCCAACACAGACGCCCTTTTACTGGGTAATGCCATCTGGCTTTTTTTCCTATGTGCCCCACTGTaccaaatgtgtttttataagaGTCTTCTGAAAGTGTGATGATGTGGGATGAGCTGGCTAAAGGTggatggacggacggacggacggacgacTAAGCTTTGTAGGTTGCACAGGTGGGATCGGCCACTTTTATCAGCGTGTTTGGTTAGCAGTTGAAGTAGTATTGTTTACTAGGAGAATTTAAATATCTCAGATAACGATCTGAAACTTTAACaaagagaaaatatattaattgtCAGCAAGAAGGTGAGTAGCCATAATCTCAGTCctcctttattaatttaaaacgCTATGTCTGATGATGTCTATGATGTTCTGAGGCAATGGTTTGGCTCTTTAAAAGTCTGTTTAACTTCTTACTGTGTTACTCTGGAAATATTTACGTCTCCCATAAGTTATACAAAACAGAAATCTGAATACAACATCAAGTTAAGAATTATTAATAGCAGCACTAAACTTGAACTGtactataattattaatttatttattaatctaatGAATCAATTTTCAACTATTGAAATGCTGatttaaaacagtataaagaGTATAAACATTACAAGGCTGCTTCCCAAAAAGTAAATGAAGAATCTTGATGATCCTGATGTTGCTAAAGCGGTTCGTTAAAagtctctgctggactgaagccTAAACTTTTTAGCAAATGAACCAATTGCACTAATCAGATAATAATAGCTTATATTTGTGCAGtaaaacatctgtttttttcaatgtattctggataaaaaaggcaaattgtgtgtttatatctATGTAAAGCACCttaaatttacagtgtttatattttgttGCAATGAATTCACCTTGGCGGTTTAAAATAGGTTTGCTAATAAAGTTGAAATTGGCAATTGTAGCCAATCAGATCAGATCATAGAATTATTAAGTGAACAGTCCAAAATGCAAGTATATGTCTTCGTAAAGGATATCTTACTCAATTACACTGGTGAAATTATTCCAGTTCTGTGCTGCaaacatttttgcaaaaataactCATTCAAGGTATTTGAATTTCCTCGTTAAAAAAAATTTGTAATCACATTTTACTAGTAAAAAGTTCAATTAAAGAGATCTACAGTAGAATTCGGATTCtattaattcagacaattttgTTCGTAATATAATCAAAACTTGATCTGAAAGTATATTTCTGAAATCTGAAAGTATACTTAAGTCGAGGAATAAACATGCATATTAAACGAGTCAAAATGAAACTACACATATCTTCCATTGCTTATGTACTAGTCTAAGTTTATTTACAGATATGTGGATTTGAACTTACTAGTCACAAAGTTCCCaaccatttattattattccatttatttacagtaaacttagattaccgaatttctccagcactaaggcatTAGCAGCAAATatcttcagcagtgctagccagggttagaagcaggctacagaccgatTATACGCCCCTCTGAACATTGAAATAGTAAGCGCAGTAAAATGCTAATGCAACTTCAGCCCCAGTGCTAAAGAACTAAACTCAAAATCCTGAAAAACACTGCAatttagtggagtggctttactgcttcttacaacctgactgataaaactcattaataagaTACACTGGAttaaaggcgcactgacgatttttgggaaaattaaagtattttaagtgcaccttatagtgcgaaaaatacggtattttcATTCACACCAGTTAAAACTAGGTTTTGATCCTTGTGAATAAGGAGAGGCCAAAAttctaaaaaattaaaacattactgttgtaaaaacaaaataactgataatctaataaaaacctCATTAAGAGTTTGTAGCATTTGGCTTAATACTGCacagaaatcttttttttttttttttatcgttttaCAGCGTGTTTTGCGTCCTGCACATGTGGAGATGCCGTGTTAAGAGTTACGAGAATTCCCATTCATATTTCAACCAGTGGTCGCTCTCCTTTTTAATTGTGTGGTGTTGGAGGCGACGTGCATAAATGTATTTGGAGGTCTTCAGGGACAGATTTTTAATAcacagacatttaaaaatatgcgAACCGTCCGGATGGCCATATTCCTgatccgatctgagcaaaaaatctgaattgattAATGAAGCTTGTAATGTGTACGTAGCCGAAGTTTTCGGAGGAGAATACGGGTTCTAACAAGTCTTTGCTTGtatgcactttttatttattcattcttttCTGTCTGCTCACGTTTCAATGCATAGTGACTCGTTTGTACCAAAGTTATGTTAATGGCACTGTTTTGTAGGTGCTCCCTACAAaagtcagtatttttttttgtgtgtgtgtgtgtgtgagagagaaatgttaaaatacaattGCATGTTATCTATGCATGCAGTTTCCTGTGAATAATCTGTTTCATGTATATGGTATTTGTACTCATGGCCTCAGATTACACATTACAGCTTTTAAGCACAGTTTCTCTAGAAATAAGACATTAAGACAGTGAAAGACTATTGtcatttatccattttttctttctgtttttagaaCCAAAATTTTATGTGCCATTATATCACTGTTACATTTTTCCAGTCTTAGATTTAAAAAGGATCTTAAACAGGCTGCAGAGTTGTGCTCTGACTTCCGTTGCCATTACTGCTGATATATCACTCCACTGGGTTTGTACTGTAACAATGATCATgcctaaaactattaaaaacaacTATGGTCTTtta
>XM_022670687.1
TCACACATCACCCACAAAGGTCCAGGTGGGGaataaactctaataaactgAATGAAAACGGGCTCTTTAAGAATCAGTCTCGTgctggaggagtggaggagcaGGTGGGTGTTTCTCTCACTGAGCAAAACAAGCttctgctggaggaggaggagctgctgtCAGAAACAGCGAGGTTCAGCTCGCTCTGTGTTATTATCACTGAACAGGAGATAACTACACTTATCTGTGCGGAGTCGTGCTGTCGGCCGCTGAACTGAGCTCCTCTCCGCTACGATGCTTCAGCTGAACGACACCGTGGAGCCCGAGAGCCCCGGCGCCGCAGTGCTGCACGCGGCCGAGGTGGAGGACGGGGTGGAGGTCGCCTTCACGCCGCCCGCGGGCCACCACAGCCGGGGCTTCGAGGTAGCGGCCGTGGCCTGCTGCTCCCCGCTCCAGAAACTCACGCCCTTCCACGTCCACAACCCCACGATGCAGGCCAAGGTGAAGGACTACTTCGTGTTCAGGCCAGGAACTATAGAGCAGGCAGTGAACGATATCCGCACAGTGGCGTTGCCTTCAGAAGATGGAGAGGTTCTCAGTGTGTGGCTCCTGGCAGAAGTTGATCACTGGAATAACGAGAAGGAGAGGCTGGTGCTGATAACAGAAAGGTCTTTGCTGGTTTGCAAATACGACTTCATAAACCTGCAGTGTCAACAAGTTATCAGGATTTCTTTAAATGCTGTGGACACGATTTCCATTGGGGATTTTGAGTTTCCTCCAAAATCTCTCAACAAGAGAGAAGGAAGTGGTATTCGTGTGCAGTGGGATAAACGGCCGAGACCTTCTTTTCTCAATCGCTGGAACCCCTGGTCCACAGACATGCCATATGCCACCTTCACAGAGCACCCCATGGCCCATGCTGATGAAAAGGTGGCTTCTCTCTGCCAGCTTGAGAACTTCAAAACTCAGCTAATTCAGGCTGTGAAAAAGGCCCACAAGGAGTTCCCCATCCCAGGCCGAGCCAACGGAGTGCTGCTGTTGGAGCGGCCCCTCCTGATAGAGAcatatcttggcatcatgtccttCATCAACAACGAGGCCAAACTAGGCTACTCCATGACCAGAGGCAAAATCGGCTTCTAGTTCCGCCTGAGCGTCTGATCTCTGACCACACCCACCTGGCATCTCCACTGACTGGTACTGTTACACTCGAGTAGGTCAAACTAAGTGAACCCCCTTTTGTGCCGCTTGCCAGATTTCAGTGTGGGTGCCCTCTCTCCACCCTGACAGTGTTCATCACTGACTCACTCAGCAGCATGTGCCTGGAAGCATCCGATGCCAACACAGACGCCCTTTTACTGGGTAATGCCATCTGGCTTTTTTTCCTATGTGCCCCACTGTaccaaatgtgtttttataagaGTCTTCTGAAAGTGTGATGATGTGGGATGAGCTGGCTAAAGGTggatggacggacggacggacggacgacTAAGCTTTGTAGGTTGCACAGGTGGGATCGGCCACTTTTATCAGCGTGTTTGGTTAGCAGTTGAAGTAGTATTGTTTACTAGGAGAATTTAAATATCTCAGATAACGATCTGAAACTTTAACaaagagaaaatatattaattgtCAGCAAGAAGGTGAGTAGCCATAATCTCAGTCctcctttattaatttaaaacgCTATGTCTGATGATGTCTATGATGTTCTGAGGCAATGGTTTGGCTCTTTAAAAGTCTGTTTAACTTCTTACTGTGTTACTCTGGAAATATTTACGTCTCCCATAAGTTATACAAAACAGAAATCTGAATACAACATCAAGTTAAGAATTATTAATAGCAGCACTAAACTTGAACTGtactataattattaatttatttattaatctaatGAATCAATTTTCAACTATTGAAATGCTGatttaaaacagtataaagaGTATAAACATTACAAGGCTGCTTCCCAAAAAGTAAATGAAGAATCTTGATGATCCTGATGTTGCTAAAGCGGTTCGTTAAAagtctctgctggactgaagccTAAACTTTTTAGCAAATGAACCAATTGCACTAATCAGATAATAATAGCTTATATTTGTGCAGtaaaacatctgtttttttcaatgtattctggataaaaaaggcaaattgtgtgtttatatctATGTAAAGCACCttaaatttacagtgtttatattttgttGCAATGAATTCACCTTGGCGGTTTAAAATAGGTTTGCTAATAAAGTTGAAATTGGCAATTGTAGCCAATCAGATCAGATCATAGAATTATTAAGTGAACAGTCCAAAATGCAAGTATATGTCTTCGTAAAGGATATCTTACTCAATTACACTGGTGAAATTATTCCAGTTCTGTGCTGCaaacatttttgcaaaaataactCATTCAAGGTATTTGAATTTCCTCGTTAAAAAAAATTTGTAATCACATTTTACTAGTAAAAAGTTCAATTAAAGAGATCTACAGTAGAATTCGGATTCtattaattcagacaattttgTTCGTAATATAATCAAAACTTGATCTGAAAGTATATTTCTGAAATCTGAAAGTATACTTAAGTCGAGGAATAAACATGCATATTAAACGAGTCAAAATGAAACTACACATATCTTCCATTGCTTATGTACTAGTCTAAGTTTATTTACAGATATGTGGATTTGAACTTACTAGTCACAAAGTTCCCaaccatttattattattccatttatttacagtaaacttagattaccgaatttctccagcactaaggcatTAGCAGCAAATatcttcagcagtgctagccagggttagaagcaggctacagaccgatTATACGCCCCTCTGAACATTGAAATAGTAAGCGCAGTAAAATGCTAATGCAACTTCAGCCCCAGTGCTAAAGAACTAAACTCAAAATCCTGAAAAACACTGCAatttagtggagtggctttactgcttcttacaacctgactgataaaactcattaataagaTACACTGGAttaaaggcgcactgacgatttttgggaaaattaaagtattttaagtgcaccttatagtgcgaaaaatacggtattttcATTCACACCAGTTAAAACTAGGTTTTGATCCTTGTGAATAAGGAGAGGCCAAAAttctaaaaaattaaaacattactgttgtaaaaacaaaataactgataatctaataaaaacctCATTAAGAGTTTGTAGCATTTGGCTTAATACTGCacagaaatcttttttttttttttttatcgttttaCAGCGTGTTTTGCGTCCTGCACATGTGGAGATGCCGTGTTAAGAGTTACGAGAATTCCCATTCATATTTCAACCAGTGGTCGCTCTCCTTTTTAATTGTGTGGTGTTGGAGGCGACGTGCATAAATGTATTTGGAGGTCTTCAGGGACAGATTTTTAATAcacagacatttaaaaatatgcgAACCGTCCGGATGGCCATATTCCTgatccgatctgagcaaaaaatctgaattgattAATGAAGCTTGTAATGTGTACGTAGCCGAAGTTTTCGGAGGAGAATACGGGTTCTAACAAGTCTTTGCTTGtatgcactttttatttattcattcttttCTGTCTGCTCACGTTTCAATGCATAGTGACTCGTTTGTACCAAAGTTATGTTAATGGCACTGTTTTGTAGGTGCTCCCTACAAaagtcagtatttttttttgtgtgtgtgtgtgtgtgagagagaaatgttaaaatacaattGCATGTTATCTATGCATGCAGTTTCCTGTGAATAATCTGTTTCATGTATATGGTATTTGTACTCATGGCCTCAGATTACACATTACAGCTTTTAAGCACAGTTTCTCTAGAAATAAGACATTAAGACAGTGAAAGACTATTGtcatttatccattttttctttctgtttttagaaCCAAAATTTTATGTGCCATTATATCACTGTTACATTTTTCCAGTCTTAGATTTAAAAAGGATCTTAAACAGGCTGCAGAGTTGTGCTCTGACTTCCGTTGCCATTACTGCTGATATATCACTCCACTGGGTTTGTACTGTAACAATGATCATgcctaaaactattaaaaacaacTATGGTCTTtta

Function


symbol description
tprg1l Predicted to be active in cytoplasm. Orthologous to human TPRG1L (tumor protein p63 regulated 1 like).

NR:

description
tumor protein p63-regulated gene 1-like protein

GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU78113 False 3949 lncRNA 0.40 6 40748741 40755872
XM_022670687.1 True 4095 mRNA 0.40 6 40748741 40756014

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
tp73 tp73 coding downstream 22262 40666471 ~ 40726479 (-)
rer1 rer1,LOC107678415,LOC107710784,LOC107698848,LOC107595758 coding downstream 86170 40652574 ~ 40662571 (-)
LOC103024844 NA coding downstream 109968 40632068 ~ 40638773 (-)
LOC103026801 LOC103026801,LOC108414620,LOC107756851,LOC107702881,LOC107573971,LOC107691553,LOC107566963,LOC108265407 coding downstream 121090 40619650 ~ 40627651 (-)
LOC103026522 eif2s2,LOC103026522,LOC108414623,LOC107739644,LOC107756850,LOC107566961,LOC107666094 coding downstream 133096 40609610 ~ 40615645 (-)
prdm16 prdm16 coding upstream 7841 40763855 ~ 41072239 (-)
mfn2 mfn2,LOC107748965,LOC107710790,LOC107602467,LOC107678429 coding upstream 491372 41247386 ~ 41278478 (-)
plod1 plod1,plod1a,LOC107698842 coding upstream 525147 41281161 ~ 41296693 (-)
clcn6 clcn6 coding upstream 649357 41405371 ~ 41436478 (-)
LOC103033502 NA coding upstream 701982 41457996 ~ 41493671 (-)
G57925 wrap73,LOC107678416,LOC107748967,LOC107710786,LOC107595759 non-coding downstream 202 40741514 ~ 40748539 (-)
G57916 NA non-coding downstream 83977 40664520 ~ 40664764 (-)
G57788 NA non-coding downstream 457555 40290977 ~ 40291186 (-)
G57782 NA non-coding downstream 492925 40255567 ~ 40255816 (-)
G57754 NA non-coding downstream 584461 40162984 ~ 40164280 (-)
G57920 NA non-coding upstream 5481 40761495 ~ 40762172 (-)
G58031 mthfr,LOC107687111 non-coding upstream 693199 41449213 ~ 41452982 (-)
G58145 NA non-coding upstream 1096575 41852589 ~ 41944829 (-)
G58152 NA non-coding upstream 1120249 41876263 ~ 41934574 (-)
G58149 plch2 non-coding upstream 1144096 41900110 ~ 41903678 (-)
LOC103037008 LOC108442081,LOC105022382,LOC106567250 other downstream 569600 40165400 ~ 40179141 (-)
G57727 kdm5c,LOC107550909,LOC107747206,LOC107570512 other downstream 629646 40117789 ~ 40119095 (-)
LOC103030299 fkbp1aa,fkb1b,fkbp1a,LOC103030299,LOC107553142,LOC107574256,LOC107752559,LOC107707744 other downstream 1185820 39521544 ~ 39562921 (-)
LOC111192682 NA other downstream 2443275 38261117 ~ 38305466 (-)
LOC103043112 LOC108438563,LOC108265696,LOC107725303,LOC107653398,LOC107598961,LOC107674288,LOC107734522,LOC107570980,LOC105889772 other downstream 3422005 37302047 ~ 37326736 (-)
G58022 LOC103032860,LOC108432146 other upstream 640072 41396086 ~ 41398478 (-)
G58435 aaas other upstream 2346856 43102870 ~ 43107623 (-)
G58537 NA other upstream 2926310 43682324 ~ 43682684 (-)
G58649 NA other upstream 3611886 44367900 ~ 44368368 (-)
G58678 NA other upstream 3718145 44474159 ~ 44477666 (-)

Expression



Co-expression Network