LOC103035734


Basic Information

Item Value
gene id LOC103035734
gene name NA
gene type coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035902.1
NCBI id CM008305.1
chromosome length 52532229
location 41979557 ~ 42034244 (-)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

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RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_007247932.3 False 9490 mRNA 0.38 11 41979557 42034244
XM_015605499.2 True 9587 mRNA 0.38 12 41979557 42034243

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
pex10 pex10 coding downstream 451667 41516965 ~ 41527890 (-)
LOC103034037 NA coding downstream 466470 41493604 ~ 41513087 (-)
LOC103033502 NA coding downstream 485886 41457996 ~ 41493671 (-)
clcn6 clcn6 coding downstream 543079 41405371 ~ 41436478 (-)
plod1 plod1,plod1a,LOC107698842 coding downstream 682864 41281161 ~ 41296693 (-)
LOC103037059 gpr153,LOC107687122,LOC107693426 coding upstream 53144 42087388 ~ 42177716 (-)
acot7 acot7,LOC107754737 coding upstream 174472 42208716 ~ 42389129 (-)
LOC103037387 LOC108432136 coding upstream 356502 42390746 ~ 42392957 (-)
LOC103027912 NA coding upstream 374735 42408979 ~ 42411388 (-)
ybx1 ybx1,LOC107595774,LOC107693424,LOC107602459 coding upstream 532302 42566546 ~ 42574089 (-)
G58145 NA non-coding downstream 34728 41852589 ~ 41944829 (-)
G58152 NA non-coding downstream 44983 41876263 ~ 41934574 (-)
G58159 NA non-coding downstream 68447 41910783 ~ 41911110 (-)
G58149 plch2 non-coding downstream 75879 41900110 ~ 41903678 (-)
G58031 mthfr,LOC107687111 non-coding downstream 526575 41449213 ~ 41452982 (-)
G58185 NA non-coding upstream 17706 42051950 ~ 42052535 (-)
G58184 NA non-coding upstream 18633 42052877 ~ 42053889 (-)
G58191 NA non-coding upstream 48023 42082267 ~ 42082568 (-)
G58208 NA non-coding upstream 78946 42113190 ~ 42113620 (-)
G58236 NA non-coding upstream 289591 42323835 ~ 42324250 (-)
G58022 LOC103032860,LOC108432146 other downstream 581079 41396086 ~ 41398478 (-)
tprg1l tprg1l,LOC107710788,LOC107678419,LOC107698845,LOC106513028 other downstream 1223543 40748741 ~ 40756014 (-)
LOC103037008 LOC108442081,LOC105022382,LOC106567250 other downstream 1800416 40165400 ~ 40179141 (-)
G57727 kdm5c,LOC107550909,LOC107747206,LOC107570512 other downstream 1860462 40117789 ~ 40119095 (-)
LOC103030299 fkbp1aa,fkb1b,fkbp1a,LOC103030299,LOC107553142,LOC107574256,LOC107752559,LOC107707744 other downstream 2416636 39521544 ~ 39562921 (-)
G58435 aaas other upstream 1068626 43102870 ~ 43107623 (-)
G58537 NA other upstream 1648080 43682324 ~ 43682684 (-)
G58649 NA other upstream 2333656 44367900 ~ 44368368 (-)
G58678 NA other upstream 2439915 44474159 ~ 44477666 (-)
snrnp200 snrnp200,LOC107686403,LOC107602857,LOC107667532,LOC107600001,LOC108265067 other upstream 2552062 44586306 ~ 44622074 (-)

Expression


Co-expression Network