LOC103040839


Basic Information

Item Value
gene id LOC103040839
gene name NA
gene type coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035902.1
NCBI id CM008305.1
chromosome length 52532229
location 42599341 ~ 42611018 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_022670718.1 False 3376 mRNA 0.41 3 42599344 42611018

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
espn espn coding upstream 66823 42431490 ~ 42532518 (+)
LOC103036755 NA coding upstream 521398 42076474 ~ 42077943 (+)
LOC103027595 NA coding upstream 531412 42062298 ~ 42067929 (+)
LOC103027292 NA coding upstream 539929 42042327 ~ 42059412 (+)
dpp9 dpp9 coding upstream 622293 41948019 ~ 41977048 (+)
angptl7 angptl7,LOC107727987,LOC107594962 coding downstream 152985 42764003 ~ 42767588 (+)
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LOC103045241 NA coding downstream 304469 42915487 ~ 42947000 (+)
pcbp2 pcbp2,LOC107663584,LOC107569168,LOC106571954,LOC105026324 coding downstream 435461 43046479 ~ 43057716 (+)
LOC111192688 NA non-coding upstream 176528 42366132 ~ 42422813 (+)
G58227 NA non-coding upstream 192749 42406197 ~ 42406592 (+)
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G58265 NA non-coding downstream 631 42611649 ~ 42613559 (+)
G58267 exosc10,LOC107724196,LOC107696929 non-coding downstream 17603 42628621 ~ 42649533 (+)
G58444 NA non-coding downstream 559123 43170141 ~ 43172830 (+)
G58454 NA non-coding downstream 709738 43320756 ~ 43326039 (+)
G58460 NA non-coding downstream 735367 43346385 ~ 43349871 (+)
LOC103040535 arhgef16,ybx1,LOC107595774 other upstream 22638 42534901 ~ 42576703 (+)
G58211 acot7 other upstream 317371 42208721 ~ 42281970 (+)
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G58025 NA other upstream 1160430 41438027 ~ 41438911 (+)
LOC103032352 LOC103032352,LOC108432100 other upstream 1221896 41374689 ~ 41377445 (+)
G58529 NA other downstream 1049764 43660782 ~ 43661647 (+)
LOC111192736 NA other downstream 1824840 44435858 ~ 44446503 (+)
LOC103028384 ptges2,LOC107083974,LOC107081068 other downstream 1968062 44579080 ~ 44583918 (+)
G58696 snrnp200,LOC106579886,LOC106585548 other downstream 1984215 44595233 ~ 44600960 (+)
LOC103029434 dgcr6,LOC103029434,LOC108430318,LOC107572069,LOC107721026,LOC108265986,LOC105899531 other downstream 2241762 44852780 ~ 44866838 (+)

Expression


Co-expression Network