LOC103030661 (LOC108430371)


Basic Information

Item Value
gene id LOC103030661
gene name LOC108430371
gene type coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035902.1
NCBI id CM008305.1
chromosome length 52532229
location 35371911 ~ 35390172 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

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Function

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PREDICTED: endophilin-B2-like isoform X1

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GO:0005737 cytoplasm cellular_component

KEGG:

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K21269 SH3GLB2; endophilin-B2

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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mrpl40 LOC107753002,LOC107671004,LOC107754402,LOC107559600 coding upstream 75909 35293923 ~ 35296002 (+)
LOC103030350 NA coding downstream 15282 35405454 ~ 35437427 (+)
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pxn pxnb,LOC107754409,LOC107552183 coding downstream 346415 35736587 ~ 35770038 (+)
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G56487 seta,LOC103031932,LOC107752982,LOC107699670,LOC108265615,LOC107754404,LOC107671021 non-coding upstream 56356 35312115 ~ 35315555 (+)
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LOC111192732 NA non-coding upstream 153129 35217891 ~ 35218782 (+)
G56499 NA non-coding downstream 2130 35392302 ~ 35468036 (+)
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G56669 NA non-coding downstream 187350 35577522 ~ 35577822 (+)
LOC103032256 dynll1,LOC103397138,LOC107554284,LOC107559583,LOC100698873 other upstream 87640 35276079 ~ 35284271 (+)
ikbkb ikbkb,vdac3,LOC107560056,LOC107671013,LOC107754399 other upstream 99383 35226485 ~ 35272528 (+)
LOC103047498 NA other upstream 382626 34961800 ~ 34989285 (+)
G56414 tcf7l1,LOC107721095,LOC107556226 other upstream 620348 34713218 ~ 34751563 (+)
fgf17 fgf17,LOC103025711,LOC107698084,LOC107678395,LOC107721084 other upstream 860227 34503114 ~ 34511684 (+)
G56504 NA other downstream 30546 35420718 ~ 35458877 (+)
G56701 pola2,LOC107710902,LOC107657899 other downstream 565932 35956104 ~ 35964510 (+)
G57066 NA other downstream 1615101 37005273 ~ 37005798 (+)
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frmd3 frmd3,LOC107678471 other downstream 3901899 39292071 ~ 39370585 (+)

Expression


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