XLOC_007924 (fat1b)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_007924
gene name fat1b
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007125.7
NCBI id CM002898.2
chromosome length 52660232
location 30156449 ~ 30226882 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00015461
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Function

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gene id symbol gene type direction distance location
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XLOC_007922 sorbs2b coding downstream 250240 29807097 ~ 29906209 (-)
XLOC_007921 pdlim3b coding downstream 356342 29782508 ~ 29800107 (-)
XLOC_007920 NA coding downstream 449406 29706704 ~ 29707043 (-)
XLOC_007919 NA coding downstream 454815 29701320 ~ 29701634 (-)
XLOC_007925 NA coding upstream 70492 30297374 ~ 30298171 (-)
XLOC_007926 pdgfrl coding upstream 132242 30359124 ~ 30366196 (-)
XLOC_007927 slc7a2 coding upstream 140720 30367602 ~ 30390145 (-)
XLOC_007928 zdhhc2 coding upstream 200074 30426956 ~ 30452218 (-)
XLOC_007929 micu3b coding upstream 226460 30453342 ~ 30490763 (-)
XLOC_007641 CU855896.1 misc downstream 27748609 2407736 ~ 2407840 (-)
XLOC_007640 CU855896.2 misc downstream 27749018 2407328 ~ 2407431 (-)
XLOC_007639 CU855896.3 misc downstream 27749377 2406945 ~ 2407072 (-)
XLOC_007918 CABZ01048945.1 non-coding downstream 803326 29353007 ~ 29353123 (-)
XLOC_007917 NA non-coding downstream 1241263 28911909 ~ 28915186 (-)
XLOC_007916 NA non-coding downstream 1559719 28594185 ~ 28596730 (-)
XLOC_007930 FP015860.1 non-coding upstream 284599 30511481 ~ 30536884 (-)
XLOC_007951 BX248522.1 non-coding upstream 1099719 31326601 ~ 31326717 (-)
XLOC_007952 NA non-coding upstream 1239724 31466606 ~ 31469460 (-)
XLOC_007954 dre-mir-457b non-coding upstream 1295048 31521930 ~ 31522007 (-)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
grasscarp (Ctenopharyngodon idella) CI01000000_13971301_14008905 FAT1B coding CI01000000 null 13970387 ~ 14010358 (+)