G94084



Basic Information


Item Value
gene id G94084
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id CI01000016
NCBI id null
chromosome length 12175457
location 1000424 ~ 1009153 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence


>TU107060
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>TU107059
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>TU107061
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>TU107055
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>TU107056
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>TU107057
GGAATACAGAANNNNNNNNNNNNNNNATTGCGCTCTTGCAAACTTAAACTTTAAGGGAAAATATTTAAAAAAAAGTAAAGACTGAAATGGGTGTCAGAAGTGTAATGGTGGTGATGTTTAAGTTAAGTGACTGGTGTAGTTTGTTTATAGCCTACAGTACGAGTAGCTTTTTACTTGTGGCGATTGTATTTACGCTTCGGAATTCATAAAAGTTGTGTTCATTTGTGAAGATTATCATGATGAACAAAATGTGTGAGACTTTTGTTGGTCACAGAGCTTATTTTCTGCAATAATCCAAAAGCCAATGGAAAAATACTAGTATTTTTGTCAAAGGAACACGGGTAATGCTAACTTCCGGGTTGGCCTACAAAAACACCTCATCACTGTAGTGCTCTATAGAGTTCTATACTATCAGACCGCATCAAAAAAACATCTACTTCATGGTAAATAAAGGACAGCAGCCTTGTTTTTATATTAATATATGAGACGTTACCCCTTTCTACTCTTCTGTTAGCTAGTTTCCCCCCTCTGGAATGGGTAGCCTGATAAAATGAAAGCAGATTTCAGATATGGAAAGTCGAGATGTCTAATTCCGAGCTGTCAAGGCACCTGAGCAACCGCCGAATCCCATGATGATGGGCACCTTAGGCCCTGTCCCAAATAACAAACTGGATGTGCATTCGCTGTCTTGCGATTTGACATTTAAGGGTTACTACTACGGATTTCTAACTGCATTACGTCACCAAAATATGGACTTTAAAGCAACCGCAAGGGTTTTGGGACAGAGCCTTCGTTTTTCAAGTAAAGAGTGTTATTTTCACGAGAGATTTCCTATGGCATCTGGTTGATTAAAGAAACTTTGCATATAATATGAGGCGTTTGGATCGCAAATACATCTACAGAGAAAGACGGAGGTGCTCAGAACAACGTGTCATGCTAATGCTGCTAATTGCAAATGTTTCTCAGTGCCCCTGAAGCAAAGCTTGTGTTTTATGACCTGCAACACATTCTCCTGTGTTTCCTCATGGTAAAATTGCTTTCAATGAGGTAGTGATCTGTACACAGAGTTTAAATATACACTAGTGAGTGCTTTGATACCTTCCTGTTAAGTTGAAATGATGAAAACTGCCTTCTTTGTGAGAAAGCTCGAACTGAACGGACGTGCGACATGTTAAATGGCGACCAACCCATCGGTCGGTGACTGGGAGGTGCAGCGATAGAGGTATAGTTCATTCAGCCGGGCAGACGCGAGATGATTGATGGTTCAGCCACTCTCTGACGCCCTCTGGTGGGGAGATCACACTCGTGTGAATCAGTGATGGTGGTTTTCTGCCTCTCAACTGAACGATTGACATAGATTCTGCAACAGTGGAAGGAAGTTTAAACCCTAAAGTACCAATTTGGCCGTCAAGGTCAAACGGATACTTCTGAAACAAAATTAATATGCCAAAACATCTCAAATAGAAAAAAAGAAACTAAAAAATTGATCCACTCCACTGTCTTGAGGGGGGGTTTCTTCATCTTTGGTATAAAATATGCCATCCATGGGCTGCATTTGATCCACAGCTAAGAAAGACTAAAGAAATTGTCAACAATTTCCTATTACTATTGCTTTTTGCACACATTTGCTTTTTTTCGTTTTGATTTAATCCGTAAGCTTTTATCTATGTAGATTTGCGCTGCCATTTTTTTTTTTGACTGTTTTCGTTTTCTTTTTTCCGCAATGAAACAAGCAAAGCAGGCTAAAAACACCTTAAAGCTCATAAAAAATATTGCAGATAAAAACAATAATGCCATTAAAAATGATCTGCACTACACAATAAACTGCATTTCCCATGATGCAGTGGATTAACATTTTTTTCCTCTGTTTCTAAAAAAATGCAACTCTGTTTAATCATCATCATCATCATGACCACAATATTTTTTTGTCTGTCCTCTCTTTTAAACACATAGTCACCACTGATAATTTAAAACGTCTCAAGGAGACCTCTCTCTCTTTCTTTCTATGCTTTATACAGGTAATTTTCCTTTCTTTGTCAGGTCATTTTCACTGCATTTATCAGTCTGTTCAGTTCAAACAGGAAAAAGTCTTAGATGTTTCTCGAAATTAAGGCAACAAAGATGAAAAAACATTAATCTTCTCTAGAAAACTAAAATCTAACTCATAAAAAAAGAAAAGTAATAGTAGCTTAGAATCCGAGGAAGACTTCTTTTGCTCCTTCTCTCATTGTTTTACAAGAACGTGCTTCCTCGTCTAATAGAAAAACCCACTGTTTCTGAAAACCTACCTGCACATTCAAAAAAAGAATAGGAAAACTTGTACTTGTTTGAATTCGTTCACTTCATGAAGGTACAGTTTTTCGGGTAGCCGATTAACAGTAGGCTCGATCTCCCAGACTGCATTTGTCTCGTTTCCTGTCTGGTTGTGAGTTCTCCAAAGGTCCTCCGGTGTGGGCCAGGTGTTAAATAAATTGTTTTTTGTTGTTGTTTTTTTTTAAGATGCTTGTGCAAAAGTAGACACAAACGTGTTTTCCTATCTCTTGCGCTCTGTCTTCAATGTTCCCTCGTTGCAGTCCCCCAGTCTCAAGGCAACGCAGTCACCTCAACGCCCCACTTCTCCTCT

Function


GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TU107059 False 1443 lncRNA 0.38 2 1001160 1005716
TU107061 False 1445 lncRNA 0.38 2 1001160 1005716
TU107055 False 2835 lncRNA 0.39 2 1001544 1009153
TU107056 False 4012 lncRNA 0.38 2 1001544 1005716
TU107057 True 2623 lncRNA 0.38 2 1001544 1007659

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
CI01000016_00843272_00857193 NA coding downstream 143128 843150 ~ 857296 (-)
CI01000016_00775184_00778097 HINT3 coding downstream 222327 774658 ~ 778097 (-)
CI01000016_00754785_00770356 NA coding downstream 230068 754683 ~ 770356 (-)
CI01000016_00679328_00729780 NA coding downstream 270458 678792 ~ 729966 (-)
CI01000016_00601605_00607255 RSPO3 coding downstream 393169 600622 ~ 607255 (-)
CI01000016_01088942_01089316 NA coding upstream 79399 1088552 ~ 1089339 (-)
CI01000016_01134396_01182271 OSBPL10 coding upstream 124661 1133814 ~ 1182271 (-)
CI01000016_01195747_01197970 KIAA1143 coding upstream 186564 1195717 ~ 1199062 (-)
CI01000016_01199558_01199730 TMEM42 coding upstream 190392 1199545 ~ 1199730 (-)
CI01000016_01202843_01213613 ZDHHC3B, ZDHHC3, ZDHHC3A, MGC82349 coding upstream 192105 1201258 ~ 1213613 (-)
G94098 NA non-coding downstream 15554 983567 ~ 984870 (-)
G94213 NA non-coding downstream 22265 976880 ~ 978159 (-)
G94137 NA non-coding downstream 137462 858768 ~ 862962 (-)
G94106 NA non-coding downstream 202705 797484 ~ 797719 (-)
G94247 NA non-coding upstream 34425 1043578 ~ 1043797 (-)
G94238 NA non-coding upstream 47202 1056355 ~ 1057041 (-)
G94253 NA non-coding upstream 50135 1059288 ~ 1060054 (-)
G94256 NA non-coding upstream 115889 1125042 ~ 1131942 (-)
G94310 NA non-coding upstream 236193 1245346 ~ 1245597 (-)
G94786 NA other upstream 1261683 2270836 ~ 2276275 (-)
G95070 NA other upstream 1976107 2985260 ~ 2985641 (-)
CI01000016_03647744_03675574 NA other upstream 2626454 3647653 ~ 3675585 (-)
CI01000016_03921124_03930996 NA other upstream 2856608 3920055 ~ 3931162 (-)
CI01000016_04921091_04922518 NA other upstream 3903555 4918975 ~ 4922518 (-)

Expression



Co-expression Network